Missing coverage evidence...
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AGCGCGGAGAGCGGCAGCAGCAAAATCAGGCACACAAACAGCAGACTGGTGCCGAGGCTTAAGGTAA  >  minE/1595467‑1595533                                                                   | aGCGCGGAGAGCGGCAGCAGCAAAATCAGGCACACAAACAGCAGACTGGTGCCGAGGCTTAAGGTaa  <  1:2038377/67‑1 (MQ=255) aGCGCGGAGAGCGGCAGCAGCAAAATCAGGCACACAAACAGCAGACTGGTGCCGAGGCTTAAGGTaa  <  1:921485/67‑1 (MQ=255) aGCGCGGAGAGCGGCAGCAGCAAAATCAGGCACACAAACAGCAGACTGGTGCCGAGGCTTAAGGTaa  <  1:800525/67‑1 (MQ=255) aGCGCGGAGAGCGGCAGCAGCAAAATCAGGCACACAAACAGCAGACTGGTGCCGAGGCTTAAGGTaa  <  1:685169/67‑1 (MQ=255) aGCGCGGAGAGCGGCAGCAGCAAAATCAGGCACACAAACAGCAGACTGGTGCCGAGGCTTAAGGTaa  <  1:558398/67‑1 (MQ=255) aGCGCGGAGAGCGGCAGCAGCAAAATCAGGCACACAAACAGCAGACTGGTGCCGAGGCTTAAGGTaa  <  1:53449/67‑1 (MQ=255) aGCGCGGAGAGCGGCAGCAGCAAAATCAGGCACACAAACAGCAGACTGGTGCCGAGGCTTAAGGTaa  <  1:465863/67‑1 (MQ=255) aGCGCGGAGAGCGGCAGCAGCAAAATCAGGCACACAAACAGCAGACTGGTGCCGAGGCTTAAGGTaa  <  1:433252/67‑1 (MQ=255) aGCGCGGAGAGCGGCAGCAGCAAAATCAGGCACACAAACAGCAGACTGGTGCCGAGGCTTAAGGTaa  <  1:427454/67‑1 (MQ=255) aGCGCGGAGAGCGGCAGCAGCAAAATCAGGCACACAAACAGCAGACTGGTGCCGAGGCTTAAGGTaa  <  1:388989/67‑1 (MQ=255) aGCGCGGAGAGCGGCAGCAGCAAAATCAGGCACACAAACAGCAGACTGGTGCCGAGGCTTAAGGTaa  <  1:38155/67‑1 (MQ=255) aGCGCGGAGAGCGGCAGCAGCAAAATCAGGCACACAAACAGCAGACTGGTGCCGAGGCTTAAGGTaa  <  1:2102542/67‑1 (MQ=255) aGCGCGGAGAGCGGCAGCAGCAAAATCAGGCACACAAACAGCAGACTGGTGCCGAGGCTTAAGGTaa  <  1:2100753/67‑1 (MQ=255) aGCGCGGAGAGCGGCAGCAGCAAAATCAGGCACACAAACAGCAGACTGGTGCCGAGGCTTAAGGTaa  <  1:1033659/67‑1 (MQ=255) aGCGCGGAGAGCGGCAGCAGCAAAATCAGGCACACAAACAGCAGACTGGTGCCGAGGCTTAAGGTaa  <  1:1992125/67‑1 (MQ=255) aGCGCGGAGAGCGGCAGCAGCAAAATCAGGCACACAAACAGCAGACTGGTGCCGAGGCTTAAGGTaa  <  1:1816275/67‑1 (MQ=255) aGCGCGGAGAGCGGCAGCAGCAAAATCAGGCACACAAACAGCAGACTGGTGCCGAGGCTTAAGGTaa  <  1:1803414/67‑1 (MQ=255) aGCGCGGAGAGCGGCAGCAGCAAAATCAGGCACACAAACAGCAGACTGGTGCCGAGGCTTAAGGTaa  <  1:1774450/67‑1 (MQ=255) aGCGCGGAGAGCGGCAGCAGCAAAATCAGGCACACAAACAGCAGACTGGTGCCGAGGCTTAAGGTaa  <  1:1568701/67‑1 (MQ=255) aGCGCGGAGAGCGGCAGCAGCAAAATCAGGCACACAAACAGCAGACTGGTGCCGAGGCTTAAGGTaa  <  1:1532508/67‑1 (MQ=255) aGCGCGGAGAGCGGCAGCAGCAAAATCAGGCACACAAACAGCAGACTGGTGCCGAGGCTTAAGGTaa  <  1:1369971/67‑1 (MQ=255) aGCGCGGAGAGCGGCAGCAGCAAAATCAGGCACACAAACAGCAGACTGGTGCCGAGGCTTAAGGTaa  <  1:1313959/67‑1 (MQ=255) aGCGCGGAGAGCGGCAGCAGCAAAATCACGCACACAAACAGCAGACTGGTGCCGAGGCTTAAGGTaa  <  1:1510798/67‑1 (MQ=255)  gcgcGGAGAGCGGCAGCAGCAAAATCAGGCACACAAACAGCAGACTGGTGCCGGGGCTTAAGGTaa  <  1:880368/66‑1 (MQ=255)  gcgcGGAGAGCGGCAGCAGCAAAATCAGGCACACAAACAGCAGACTGGTGCCGAGGCTTAAGGTaa  <  1:1430037/66‑1 (MQ=255)  gcgcGGAGAGCGGCAGCAGCAAAATCAGGCACACAAACAGCAGACTGGTGCCGAGGCTTAAGGTaa  <  1:605900/66‑1 (MQ=255)  gcgcGGAGAGCGGCAGCAGCAAAATCAGGCACACAAACAGCAGACTGGTGCCGAGGCTTAAGGTaa  <  1:1249850/66‑1 (MQ=255)                    gcaAAATCAGGCACACAAACAGCAGACTGGTGCCGAGGCTTAAGGTaa  <  1:1299523/48‑1 (MQ=255)                         aTCAGGCACACAAACAGCAGACTGGTGCAGAGGCTTAAGGTaa  <  1:1479429/43‑1 (MQ=255)                                                                   | AGCGCGGAGAGCGGCAGCAGCAAAATCAGGCACACAAACAGCAGACTGGTGCCGAGGCTTAAGGTAA  >  minE/1595467‑1595533

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑