Missing coverage evidence...
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TAACCCGTGTGCGCCATAACGGCCTCGACGACAGTCCGCAGTTGCAGATTGATATCGACC  >  minE/1635994‑1636053                                                            | tAACCCGTGTGCGCCATAACGGCCTCGACGACAGTCCGCAGTTGCAGATTGATATCGAcc  >  1:1807720/1‑60 (MQ=255) tAACCCGTGTGCGCCATAACGGCCTCGACGACAGTCCGCAGTTGCAGATTGATATCGAcc  >  1:9759/1‑60 (MQ=255) tAACCCGTGTGCGCCATAACGGCCTCGACGACAGTCCGCAGTTGCAGATTGATATCGAcc  >  1:932058/1‑60 (MQ=255) tAACCCGTGTGCGCCATAACGGCCTCGACGACAGTCCGCAGTTGCAGATTGATATCGAcc  >  1:923986/1‑60 (MQ=255) tAACCCGTGTGCGCCATAACGGCCTCGACGACAGTCCGCAGTTGCAGATTGATATCGAcc  >  1:84287/1‑60 (MQ=255) tAACCCGTGTGCGCCATAACGGCCTCGACGACAGTCCGCAGTTGCAGATTGATATCGAcc  >  1:624458/1‑60 (MQ=255) tAACCCGTGTGCGCCATAACGGCCTCGACGACAGTCCGCAGTTGCAGATTGATATCGAcc  >  1:588448/1‑60 (MQ=255) tAACCCGTGTGCGCCATAACGGCCTCGACGACAGTCCGCAGTTGCAGATTGATATCGAcc  >  1:565291/1‑60 (MQ=255) tAACCCGTGTGCGCCATAACGGCCTCGACGACAGTCCGCAGTTGCAGATTGATATCGAcc  >  1:533601/1‑60 (MQ=255) tAACCCGTGTGCGCCATAACGGCCTCGACGACAGTCCGCAGTTGCAGATTGATATCGAcc  >  1:1961844/1‑60 (MQ=255) tAACCCGTGTGCGCCATAACGGCCTCGACGACAGTCCGCAGTTGCAGATTGATATCGAcc  >  1:1950519/1‑60 (MQ=255) tAACCCGTGTGCGCCATAACGGCCTCGACGACAGTCCGCAGTTGCAGATTGATATCGAcc  >  1:1907777/1‑60 (MQ=255) tAACCCGTGTGCGCCATAACGGCCTCGACGACAGTCCGCAGTTGCAGATTGATATCGAcc  >  1:1116597/1‑60 (MQ=255) tAACCCGTGTGCGCCATAACGGCCTCGACGACAGTCCGCAGTTGCAGATTGATATCGAcc  >  1:1767063/1‑60 (MQ=255) tAACCCGTGTGCGCCATAACGGCCTCGACGACAGTCCGCAGTTGCAGATTGATATCGAcc  >  1:1754423/1‑60 (MQ=255) tAACCCGTGTGCGCCATAACGGCCTCGACGACAGTCCGCAGTTGCAGATTGATATCGAcc  >  1:1691404/1‑60 (MQ=255) tAACCCGTGTGCGCCATAACGGCCTCGACGACAGTCCGCAGTTGCAGATTGATATCGAcc  >  1:1685790/1‑60 (MQ=255) tAACCCGTGTGCGCCATAACGGCCTCGACGACAGTCCGCAGTTGCAGATTGATATCGAcc  >  1:1556760/1‑60 (MQ=255) tAACCCGTGTGCGCCATAACGGCCTCGACGACAGTCCGCAGTTGCAGATTGATATCGAcc  >  1:1446708/1‑60 (MQ=255) tAACCCGTGTGCGCCATAACGGCCTCGACGACAGTCCGCAGTTGCAGATTGATATCGAcc  >  1:1336953/1‑60 (MQ=255) tAACCCGTGTGCGCCATAACGGCCTCGACGACAGTCCGCAGTTGCAGATTGATATCGAcc  >  1:1207532/1‑60 (MQ=255) tAACCCGTGTGCGCCATAACGGCCTCGACGACAGTCCGCAGTTGCAGATTGATATCGAcc  >  1:1172785/1‑60 (MQ=255) tAACCCGTGTGCGCCATAACGGCCTCGACGACAGTCCGCAGTTGCAGATTGATATCGAcc  >  1:1140284/1‑60 (MQ=255)                                                            | TAACCCGTGTGCGCCATAACGGCCTCGACGACAGTCCGCAGTTGCAGATTGATATCGACC  >  minE/1635994‑1636053

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑