Missing coverage evidence...
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CACCGCAAAGCGCGGTAGGTAGCTGACCCCGATATTCGCCGCGACACAACGCTTGATGCTTTCGATA  >  minE/1747281‑1747347                                                                   | cACCGCAAAGCGCGGTAGGTAGCTGCCCCCGATATTCGCCGGGACACAACGCTTGATGCTTTCGATa  >  1:2059093/1‑67 (MQ=255) cACCGCAAAGCGCGGTAGGTAGCTGCCCCCGATATTCGCCGCGACACAACGCTTGATGCTTTCGATa  >  1:1531748/1‑67 (MQ=255) cACCGCAAAGCGCGGTAGGTAGCTGCCCCCGATATTCGCCGCGACACAACGCTTGATGCTTTCGATa  >  1:792602/1‑67 (MQ=255) cACCGCAAAGCGCGGTAGGTAGCTGCCCCCGATATTCGCCGCGACACAACGCTTGATGCTTTCGATa  >  1:1131482/1‑67 (MQ=255) cACCGCAAAGCGCGGTAGGTAGCTGACCCCGATATTCGCCGCGACACAACGCTTGATGCTTTCGATa  >  1:611131/1‑67 (MQ=255) cACCGCAAAGCGCGGTAGGTAGCTGACCCCGATATTCGCCGCGACACAACGCTTGATGCTTTCGATa  >  1:985558/1‑67 (MQ=255) cACCGCAAAGCGCGGTAGGTAGCTGACCCCGATATTCGCCGCGACACAACGCTTGATGCTTTCGATa  >  1:2143427/1‑67 (MQ=255) cACCGCAAAGCGCGGTAGGTAGCTGACCCCGATATTCGCCGCGACACAACGCTTGATGCTTTCGATa  >  1:2147041/1‑67 (MQ=255) cACCGCAAAGCGCGGTAGGTAGCTGACCCCGATATTCGCCGCGACACAACGCTTGATGCTTTCGATa  >  1:2155315/1‑67 (MQ=255) cACCGCAAAGCGCGGTAGGTAGCTGACCCCGATATTCGCCGCGACACAACGCTTGATGCTTTCGATa  >  1:230957/1‑67 (MQ=255) cACCGCAAAGCGCGGTAGGTAGCTGACCCCGATATTCGCCGCGACACAACGCTTGATGCTTTCGATa  >  1:371482/1‑67 (MQ=255) cACCGCAAAGCGCGGTAGGTAGCTGACCCCGATATTCGCCGCGACACAACGCTTGATGCTTTCGATa  >  1:41281/1‑67 (MQ=255) cACCGCAAAGCGCGGTAGGTAGCTGACCCCGATATTCGCCGCGACACAACGCTTGATGCTTTCGATa  >  1:531915/1‑67 (MQ=255) cACCGCAAAGCGCGGTAGGTAGCTGACCCCGATATTCGCCGCGACACAACGCTTGATGCTTTCGATa  >  1:549077/1‑67 (MQ=255) cACCGCAAAGCGCGGTAGGTAGCTGACCCCGATATTCGCCGCGACACAACGCTTGATGCTTTCGATa  >  1:583078/1‑67 (MQ=255) cACCGCAAAGCGCGGTAGGTAGCTGACCCCGATATTCGCCGCGACACAACGCTTGATGCTTTCGATa  >  1:90562/1‑67 (MQ=255) cACCGCAAAGCGCGGTAGGTAGCTGACCCCGATATTCGCCGCGACACAACGCTTGATGCTTTCGATa  >  1:613416/1‑67 (MQ=255) cACCGCAAAGCGCGGTAGGTAGCTGACCCCGATATTCGCCGCGACACAACGCTTGATGCTTTCGATa  >  1:2039886/1‑67 (MQ=255) cACCGCAAAGCGCGGTAGGTAGCTGACCCCGATATTCGCCGCGACACAACGCTTGATGCTTTCGATa  >  1:641311/1‑67 (MQ=255) cACCGCAAAGCGCGGTAGGTAGCTGACCCCGATATTCGCCGCGACACAACGCTTGATGCTTTCGATa  >  1:716837/1‑67 (MQ=255) cACCGCAAAGCGCGGTAGGTAGCTGACCCCGATATTCGCCGCGACACAACGCTTGATGCTTTCGATa  >  1:769001/1‑67 (MQ=255) cACCGCAAAGCGCGGTAGGTAGCTGACCCCGATATTCGCCGCGACACAACGCTTGATGCTTTCGATa  >  1:942154/1‑67 (MQ=255) cACCGCAAAGCGCGGTAGGTAGCTGACCCCGATATTCGCCGCGACACAACGCTTGATGCTTTCGATa  >  1:796418/1‑67 (MQ=255) cACCGCAAAGCGCGGTAGGTAGCTGACCCCGATATTCGCCGCGACACAACGCTTGATGCTTTCGATa  >  1:798968/1‑67 (MQ=255) cACCGCAAAGCGCGGTAGGTAGCTGACCCCGATATTCGCCGCGACACAACGCTTGATGCTTTCGATa  >  1:806432/1‑67 (MQ=255) cACCGCAAAGCGCGGTAGGTAGCTGACCCCGATATTCGCCGCGACACAACGCTTGATGCTTTCGATa  >  1:1550780/1‑67 (MQ=255) cACCGCAAAGCGCGGTAGGTAGCTGACCCCGATATTCGCCGCGACACAACGCTTGATGCTTTCGATa  >  1:10250/1‑67 (MQ=255) cACCGCAAAGCGCGGTAGGTAGCTGACCCCGATATTCGCCGCGACACAACGCTTGATGCTTTCGATa  >  1:1025102/1‑67 (MQ=255) cACCGCAAAGCGCGGTAGGTAGCTGACCCCGATATTCGCCGCGACACAACGCTTGATGCTTTCGATa  >  1:1060243/1‑67 (MQ=255) cACCGCAAAGCGCGGTAGGTAGCTGACCCCGATATTCGCCGCGACACAACGCTTGATGCTTTCGATa  >  1:1151460/1‑67 (MQ=255) cACCGCAAAGCGCGGTAGGTAGCTGACCCCGATATTCGCCGCGACACAACGCTTGATGCTTTCGATa  >  1:1209491/1‑67 (MQ=255) cACCGCAAAGCGCGGTAGGTAGCTGACCCCGATATTCGCCGCGACACAACGCTTGATGCTTTCGATa  >  1:1239377/1‑67 (MQ=255) cACCGCAAAGCGCGGTAGGTAGCTGACCCCGATATTCGCCGCGACACAACGCTTGATGCTTTCGATa  >  1:1244617/1‑67 (MQ=255) cACCGCAAAGCGCGGTAGGTAGCTGACCCCGATATTCGCCGCGACACAACGCTTGATGCTTTCGATa  >  1:1266659/1‑67 (MQ=255) cACCGCAAAGCGCGGTAGGTAGCTGACCCCGATATTCGCCGCGACACAACGCTTGATGCTTTCGATa  >  1:1279195/1‑67 (MQ=255) cACCGCAAAGCGCGGTAGGTAGCTGACCCCGATATTCGCCGCGACACAACGCTTGATGCTTTCGATa  >  1:145893/1‑67 (MQ=255) cACCGCAAAGCGCGGTAGGTAGCTGACCCCGATATTCGCCGCGACACAACGCTTGATGCTTTCGATa  >  1:1001941/1‑67 (MQ=255) cACCGCAAAGCGCGGTAGGTAGCTGACCCCGATATTCGCCGCGACACAACGCTTGATGCTTTCGATa  >  1:1605466/1‑67 (MQ=255) cACCGCAAAGCGCGGTAGGTAGCTGACCCCGATATTCGCCGCGACACAACGCTTGATGCTTTCGATa  >  1:1631218/1‑67 (MQ=255) cACCGCAAAGCGCGGTAGGTAGCTGACCCCGATATTCGCCGCGACACAACGCTTGATGCTTTCGATa  >  1:165764/1‑67 (MQ=255) cACCGCAAAGCGCGGTAGGTAGCTGACCCCGATATTCGCCGCGACACAACGCTTGATGCTTTCGATa  >  1:1760663/1‑67 (MQ=255) cACCGCAAAGCGCGGTAGGTAGCTGACCCCGATATTCGCCGCGACACAACGCTTGATGCTTTCGATa  >  1:1803407/1‑67 (MQ=255) cACCGCAAAGCGCGGTAGGTAGCTGACCCCGATATTCGCCGCGACACAACGCTTGATGCTTTCGATa  >  1:1858717/1‑67 (MQ=255) cACCGCAAAGCGCGGTAGGTAGCTGACCCCGATATTCGCCGCGACACAACGCTTGATGCTTTCGATa  >  1:1859863/1‑67 (MQ=255) cACCGCAAAGCGCGGTAGGTAGCTGACCCCGATATTCGCCGCGACACAACGCTTGATGCTTTCGATa  >  1:1912183/1‑67 (MQ=255) cACCGCAAAGCGCGGTAGGTAGCTGACCCCGATATTCGCCGCGACACAACGCTTGATGCTTTCGATa  >  1:2030387/1‑67 (MQ=255)                                                                   | CACCGCAAAGCGCGGTAGGTAGCTGACCCCGATATTCGCCGCGACACAACGCTTGATGCTTTCGATA  >  minE/1747281‑1747347

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑