Missing coverage evidence...
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*	*	÷	minE	1768561	1768565	5	42 [0]	[0] 43	rluD	23S rRNA pseudouridine synthase

GTTGATGGCAACCTGCTCGCCACCCAATACTTTTTCTTTCGGCTTATCACAAACTTTGCCGTTAACC  >  minE/1768494‑1768560                                                                   | gTTGATGGCAACCTGCTCGCCACCCAATACTTTTTCTTTCGGCTTATCACAAACTTTGCCGTTAAcc  <  1:568433/67‑1 (MQ=255) gTTGATGGCAACCTGCTCGCCACCCAATACTTTTTCTTTCGGCTTATCACAAACTTTGCCGTTAAcc  <  1:2011186/67‑1 (MQ=255) gTTGATGGCAACCTGCTCGCCACCCAATACTTTTTCTTTCGGCTTATCACAAACTTTGCCGTTAAcc  <  1:1098276/67‑1 (MQ=255) gTTGATGGCAACCTGCTCGCCACCCAATACTTTTTCTTTCGGCTTATCACAAACTTTGCCGTTAAcc  <  1:272466/67‑1 (MQ=255) gTTGATGGCAACCTGCTCGCCACCCAATACTTTTTCTTTCGGCTTATCACAAACTTTGCCGTTAAcc  <  1:322578/67‑1 (MQ=255) gTTGATGGCAACCTGCTCGCCACCCAATACTTTTTCTTTCGGCTTATCACAAACTTTGCCGTTAAcc  <  1:335719/67‑1 (MQ=255) gTTGATGGCAACCTGCTCGCCACCCAATACTTTTTCTTTCGGCTTATCACAAACTTTGCCGTTAAcc  <  1:412792/67‑1 (MQ=255) gTTGATGGCAACCTGCTCGCCACCCAATACTTTTTCTTTCGGCTTATCACAAACTTTGCCGTTAAcc  <  1:432228/67‑1 (MQ=255) gTTGATGGCAACCTGCTCGCCACCCAATACTTTTTCTTTCGGCTTATCACAAACTTTGCCGTTAAcc  <  1:439411/67‑1 (MQ=255) gTTGATGGCAACCTGCTCGCCACCCAATACTTTTTCTTTCGGCTTATCACAAACTTTGCCGTTAAcc  <  1:512866/67‑1 (MQ=255) gTTGATGGCAACCTGCTCGCCACCCAATACTTTTTCTTTCGGCTTATCACAAACTTTGCCGTTAAcc  <  1:2100655/67‑1 (MQ=255) gTTGATGGCAACCTGCTCGCCACCCAATACTTTTTCTTTCGGCTTATCACAAACTTTGCCGTTAAcc  <  1:58584/67‑1 (MQ=255) gTTGATGGCAACCTGCTCGCCACCCAATACTTTTTCTTTCGGCTTATCACAAACTTTGCCGTTAAcc  <  1:600048/67‑1 (MQ=255) gTTGATGGCAACCTGCTCGCCACCCAATACTTTTTCTTTCGGCTTATCACAAACTTTGCCGTTAAcc  <  1:658461/67‑1 (MQ=255) gTTGATGGCAACCTGCTCGCCACCCAATACTTTTTCTTTCGGCTTATCACAAACTTTGCCGTTAAcc  <  1:671885/67‑1 (MQ=255) gTTGATGGCAACCTGCTCGCCACCCAATACTTTTTCTTTCGGCTTATCACAAACTTTGCCGTTAAcc  <  1:689860/67‑1 (MQ=255) gTTGATGGCAACCTGCTCGCCACCCAATACTTTTTCTTTCGGCTTATCACAAACTTTGCCGTTAAcc  <  1:724098/67‑1 (MQ=255) gTTGATGGCAACCTGCTCGCCACCCAATACTTTTTCTTTCGGCTTATCACAAACTTTGCCGTTAAcc  <  1:740900/67‑1 (MQ=255) gTTGATGGCAACCTGCTCGCCACCCAATACTTTTTCTTTCGGCTTATCACAAACTTTGCCGTTAAcc  <  1:880075/67‑1 (MQ=255) gTTGATGGCAACCTGCTCGCCACCCAATACTTTTTCTTTCGGCTTATCACAAACTTTGCCGTTAAcc  <  1:931780/67‑1 (MQ=255) gTTGATGGCAACCTGCTCGCCACCCAATACTTTTTCTTTCGGCTTATCACAAACTTTGCCGTTAAcc  <  1:1728597/67‑1 (MQ=255) gTTGATGGCAACCTGCTCGCCACCCAATACTTTTTCTTTCGGCTTATCACAAACTTTGCCGTTAAcc  <  1:1216671/67‑1 (MQ=255) gTTGATGGCAACCTGCTCGCCACCCAATACTTTTTCTTTCGGCTTATCACAAACTTTGCCGTTAAcc  <  1:1223268/67‑1 (MQ=255) gTTGATGGCAACCTGCTCGCCACCCAATACTTTTTCTTTCGGCTTATCACAAACTTTGCCGTTAAcc  <  1:1238698/67‑1 (MQ=255) gTTGATGGCAACCTGCTCGCCACCCAATACTTTTTCTTTCGGCTTATCACAAACTTTGCCGTTAAcc  <  1:1295734/67‑1 (MQ=255) gTTGATGGCAACCTGCTCGCCACCCAATACTTTTTCTTTCGGCTTATCACAAACTTTGCCGTTAAcc  <  1:1407009/67‑1 (MQ=255) gTTGATGGCAACCTGCTCGCCACCCAATACTTTTTCTTTCGGCTTATCACAAACTTTGCCGTTAAcc  <  1:1529345/67‑1 (MQ=255) gTTGATGGCAACCTGCTCGCCACCCAATACTTTTTCTTTCGGCTTATCACAAACTTTGCCGTTAAcc  <  1:1560598/67‑1 (MQ=255) gTTGATGGCAACCTGCTCGCCACCCAATACTTTTTCTTTCGGCTTATCACAAACTTTGCCGTTAAcc  <  1:1671924/67‑1 (MQ=255) gTTGATGGCAACCTGCTCGCCACCCAATACTTTTTCTTTCGGCTTATCACAAACTTTGCCGTTAAcc  <  1:1939514/67‑1 (MQ=255) gTTGATGGCAACCTGCTCGCCACCCAATACTTTTTCTTTCGGCTTATCACAAACTTTGCCGTTAAcc  <  1:1740113/67‑1 (MQ=255) gTTGATGGCAACCTGCTCGCCACCCAATACTTTTTCTTTCGGCTTATCACAAACTTTGCCGTTAAcc  <  1:1831273/67‑1 (MQ=255) gTTGATGGCAACCTGCTCGCCACCCAATACTTTTTCTTTCGGCTTATCACAAACTTTGCCGTTAAcc  <  1:1876102/67‑1 (MQ=255) gTTGATGGCAACCTGCTCACCACCCAATACTTTTTCTTTCGGCTTATCACAAACTTTGCCGTTAAcc  <  1:1840960/67‑1 (MQ=255)  ttGATGGCAACCTGCTCGCCACCCAATACTTTTTCTTTCGGCTTATCACAAACTTTGCCGTTAAcc  <  1:1835677/66‑1 (MQ=255)  ttGATGGCAACCTGCTCGCCACCCAATACTTTTTCTTTCGGCTTATCACAAACTTTGCCGTTAAcc  <  1:1365529/66‑1 (MQ=255)  ttGATGGCAACCTGCTCGCCACCCAATACTTTTTCTTTCGGCTTATCACAAACTTTGCCGTTAAcc  <  1:272886/66‑1 (MQ=255)  ttGATGGCAACCTGCTCGCCACCCAATACTTTTTCTTTCGGCTTATCACAAACTTTGCCGTTAAcc  <  1:1888573/66‑1 (MQ=255)  ttGATGGCAACCTGCTCGCCACCCAATACTTTTTCTTTCGGCTTATCACAAACTTTGCCGTTAAcc  <  1:2155561/66‑1 (MQ=255)  ttGATGGCAACCTGCTCGCCACCCAATACTTTTTCTTTCGGCTTATCACAAACTTTGCCGTTAAcc  <  1:1937160/66‑1 (MQ=255)   tGATGGCAACCTGCTCGCCACCCAATACTTTTTCTTTCGGCTTATCACAAACTTTGCCGTTAAcc  <  1:1479012/65‑1 (MQ=255)                           aTACTTTTTCTTTCGGCTTATCACAAACTTTGCCGTTAAcc  <  1:39111/41‑1 (MQ=255)                                                                   | GTTGATGGCAACCTGCTCGCCACCCAATACTTTTTCTTTCGGCTTATCACAAACTTTGCCGTTAACC  >  minE/1768494‑1768560

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑