Missing coverage evidence...
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TACCCCTTAAAACACCAGCAAACAGATAAAAAAGGGCCAGCCAATTGGCCAGCCCTTCTTAACAGGA  >  minE/1776784‑1776850                                                                   | tacCCCTTAAAACACCAGCAAACAGATAAAAAAGGGCCAGCCAATTGGCCAGCCCTTCTTAACAGGa  >  1:376480/1‑67 (MQ=255) tacCCCTTAAAACACCAGCAAACAGATAAAAAAGGGCCAGCCAATTGGCCAGCCCTTCTTAACAGGa  >  1:867893/1‑67 (MQ=255) tacCCCTTAAAACACCAGCAAACAGATAAAAAAGGGCCAGCCAATTGGCCAGCCCTTCTTAACAGGa  >  1:853682/1‑67 (MQ=255) tacCCCTTAAAACACCAGCAAACAGATAAAAAAGGGCCAGCCAATTGGCCAGCCCTTCTTAACAGGa  >  1:81609/1‑67 (MQ=255) tacCCCTTAAAACACCAGCAAACAGATAAAAAAGGGCCAGCCAATTGGCCAGCCCTTCTTAACAGGa  >  1:692558/1‑67 (MQ=255) tacCCCTTAAAACACCAGCAAACAGATAAAAAAGGGCCAGCCAATTGGCCAGCCCTTCTTAACAGGa  >  1:682080/1‑67 (MQ=255) tacCCCTTAAAACACCAGCAAACAGATAAAAAAGGGCCAGCCAATTGGCCAGCCCTTCTTAACAGGa  >  1:658134/1‑67 (MQ=255) tacCCCTTAAAACACCAGCAAACAGATAAAAAAGGGCCAGCCAATTGGCCAGCCCTTCTTAACAGGa  >  1:623667/1‑67 (MQ=255) tacCCCTTAAAACACCAGCAAACAGATAAAAAAGGGCCAGCCAATTGGCCAGCCCTTCTTAACAGGa  >  1:607814/1‑67 (MQ=255) tacCCCTTAAAACACCAGCAAACAGATAAAAAAGGGCCAGCCAATTGGCCAGCCCTTCTTAACAGGa  >  1:589810/1‑67 (MQ=255) tacCCCTTAAAACACCAGCAAACAGATAAAAAAGGGCCAGCCAATTGGCCAGCCCTTCTTAACAGGa  >  1:434702/1‑67 (MQ=255) tacCCCTTAAAACACCAGCAAACAGATAAAAAAGGGCCAGCCAATTGGCCAGCCCTTCTTAACAGGa  >  1:1036951/1‑67 (MQ=255) tacCCCTTAAAACACCAGCAAACAGATAAAAAAGGGCCAGCCAATTGGCCAGCCCTTCTTAACAGGa  >  1:29448/1‑67 (MQ=255) tacCCCTTAAAACACCAGCAAACAGATAAAAAAGGGCCAGCCAATTGGCCAGCCCTTCTTAACAGGa  >  1:283765/1‑67 (MQ=255) tacCCCTTAAAACACCAGCAAACAGATAAAAAAGGGCCAGCCAATTGGCCAGCCCTTCTTAACAGGa  >  1:1894632/1‑67 (MQ=255) tacCCCTTAAAACACCAGCAAACAGATAAAAAAGGGCCAGCCAATTGGCCAGCCCTTCTTAACAGGa  >  1:1835879/1‑67 (MQ=255) tacCCCTTAAAACACCAGCAAACAGATAAAAAAGGGCCAGCCAATTGGCCAGCCCTTCTTAACAGGa  >  1:1756723/1‑67 (MQ=255) tacCCCTTAAAACACCAGCAAACAGATAAAAAAGGGCCAGCCAATTGGCCAGCCCTTCTTAACAGGa  >  1:1702248/1‑67 (MQ=255) tacCCCTTAAAACACCAGCAAACAGATAAAAAAGGGCCAGCCAATTGGCCAGCCCTTCTTAACAGGa  >  1:1533628/1‑67 (MQ=255) tacCCCTTAAAACACCAGCAAACAGATAAAAAAGGGCCAGCCAATTGGCCAGCCCTTCTTAACAGGa  >  1:140810/1‑67 (MQ=255) tacCCCTTAAAACACCAGCAAACAGATAAAAAAGGGCCAGCCAATTGGCCAGCCCTTCTTAACAGGa  >  1:1331045/1‑67 (MQ=255)                                                                   | TACCCCTTAAAACACCAGCAAACAGATAAAAAAGGGCCAGCCAATTGGCCAGCCCTTCTTAACAGGA  >  minE/1776784‑1776850

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑