Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	minE	1840076	1840103	28	32 [0]	[0] 22	truD	pseudoruidine synthase

GGATCTCTACGGTGACGTCATCCCACCAATTCCAGCTTAATTGTTGCGGATACAGCAGCATCGCTCT  >  minE/1840009‑1840075                                                                   | ggATCTCTACGGTGACGTCATCCCACCAATTCCAGCTTTATTGTTGCGGATACAGCAGCATCGctct  >  1:1866719/1‑67 (MQ=255) ggATCTCTACGGTGACGTCATCCCACCAATTCCAGCTTAATTGTTGCGGATACAGCAGCATCGctct  >  1:331352/1‑67 (MQ=255) ggATCTCTACGGTGACGTCATCCCACCAATTCCAGCTTAATTGTTGCGGATACAGCAGCATCGctct  >  1:1980484/1‑67 (MQ=255) ggATCTCTACGGTGACGTCATCCCACCAATTCCAGCTTAATTGTTGCGGATACAGCAGCATCGctct  >  1:2051665/1‑67 (MQ=255) ggATCTCTACGGTGACGTCATCCCACCAATTCCAGCTTAATTGTTGCGGATACAGCAGCATCGctct  >  1:2060323/1‑67 (MQ=255) ggATCTCTACGGTGACGTCATCCCACCAATTCCAGCTTAATTGTTGCGGATACAGCAGCATCGctct  >  1:221529/1‑67 (MQ=255) ggATCTCTACGGTGACGTCATCCCACCAATTCCAGCTTAATTGTTGCGGATACAGCAGCATCGctct  >  1:227535/1‑67 (MQ=255) ggATCTCTACGGTGACGTCATCCCACCAATTCCAGCTTAATTGTTGCGGATACAGCAGCATCGctct  >  1:291878/1‑67 (MQ=255) ggATCTCTACGGTGACGTCATCCCACCAATTCCAGCTTAATTGTTGCGGATACAGCAGCATCGctct  >  1:317735/1‑67 (MQ=255) ggATCTCTACGGTGACGTCATCCCACCAATTCCAGCTTAATTGTTGCGGATACAGCAGCATCGctct  >  1:1979979/1‑67 (MQ=255) ggATCTCTACGGTGACGTCATCCCACCAATTCCAGCTTAATTGTTGCGGATACAGCAGCATCGctct  >  1:517809/1‑67 (MQ=255) ggATCTCTACGGTGACGTCATCCCACCAATTCCAGCTTAATTGTTGCGGATACAGCAGCATCGctct  >  1:552620/1‑67 (MQ=255) ggATCTCTACGGTGACGTCATCCCACCAATTCCAGCTTAATTGTTGCGGATACAGCAGCATCGctct  >  1:721708/1‑67 (MQ=255) ggATCTCTACGGTGACGTCATCCCACCAATTCCAGCTTAATTGTTGCGGATACAGCAGCATCGctct  >  1:877262/1‑67 (MQ=255) ggATCTCTACGGTGACGTCATCCCACCAATTCCAGCTTAATTGTTGCGGATACAGCAGCATCGctct  >  1:88221/1‑67 (MQ=255) ggATCTCTACGGTGACGTCATCCCACCAATTCCAGCTTAATTGTTGCGGATACAGCAGCATCGctct  >  1:955284/1‑67 (MQ=255) ggATCTCTACGGTGACGTCATCCCACCAATTCCAGCTTAATTGTTGCGGATACAGCAGCATCGctct  >  1:991101/1‑67 (MQ=255) ggATCTCTACGGTGACGTCATCCCACCAATTCCAGCTTAATTGTTGCGGATACAGCAGCATCGctct  >  1:1197209/1‑67 (MQ=255) ggATCTCTACGGTGACGTCATCCCACCAATTCCAGCTTAATTGTTGCGGATACAGCAGCATCGctct  >  1:1946843/1‑67 (MQ=255) ggATCTCTACGGTGACGTCATCCCACCAATTCCAGCTTAATTGTTGCGGATACAGCAGCATCGctct  >  1:1879478/1‑67 (MQ=255) ggATCTCTACGGTGACGTCATCCCACCAATTCCAGCTTAATTGTTGCGGATACAGCAGCATCGctct  >  1:1878605/1‑67 (MQ=255) ggATCTCTACGGTGACGTCATCCCACCAATTCCAGCTTAATTGTTGCGGATACAGCAGCATCGctct  >  1:1839571/1‑67 (MQ=255) ggATCTCTACGGTGACGTCATCCCACCAATTCCAGCTTAATTGTTGCGGATACAGCAGCATCGctct  >  1:1821980/1‑67 (MQ=255) ggATCTCTACGGTGACGTCATCCCACCAATTCCAGCTTAATTGTTGCGGATACAGCAGCATCGctct  >  1:1794497/1‑67 (MQ=255) ggATCTCTACGGTGACGTCATCCCACCAATTCCAGCTTAATTGTTGCGGATACAGCAGCATCGctct  >  1:1639541/1‑67 (MQ=255) ggATCTCTACGGTGACGTCATCCCACCAATTCCAGCTTAATTGTTGCGGATACAGCAGCATCGctct  >  1:1499408/1‑67 (MQ=255) ggATCTCTACGGTGACGTCATCCCACCAATTCCAGCTTAATTGTTGCGGATACAGCAGCATCGctct  >  1:1408089/1‑67 (MQ=255) ggATCTCTACGGTGACGTCATCCCACCAATTCCAGCTTAATTGTTGCGGATACAGCAGCATCGctct  >  1:1401296/1‑67 (MQ=255) ggATCTCTACGGTGACGTCATCCCACCAATTCCAGCTTAATTGTTGCGGATACAGCAGCATCGctct  >  1:1246361/1‑67 (MQ=255) ggATCTCTACGGTGACGTCATCCCACCAATTCCAGCTTAATTGTTGCGGATACAGCAGCATCGctct  >  1:1237052/1‑67 (MQ=255) ggATCTCTACGGTGACGTCATCCCACCAATTCCAGCTTAATTGTTGCGGATACAGCAGCATCGctct  >  1:1226430/1‑67 (MQ=255) ggATCACTACGGTGACGTCATCCCACCAATTCCAGCTTAATTGTTGCGGATACAGCAGCATCGctct  >  1:1741558/1‑67 (MQ=255)                                                                   | GGATCTCTACGGTGACGTCATCCCACCAATTCCAGCTTAATTGTTGCGGATACAGCAGCATCGCTCT  >  minE/1840009‑1840075

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑