Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	minE	1884915	1884946	32	28 [0]	[0] 37	barA	hybrid sensory histidine kinase, in two‑component regulatory system with UvrY

TCCCTCATCAATGCAGCTCGGCAGCAACGTGCCGTTTCCTCGCCAGCTCACTGTCACTCGTGACG  >  minE/1884850‑1884914                                                                 | tCCCTCATCAATGCTGCTCGGCAGCAACGTGCCGTTTCCTCGCCAGCTCACTGTCACTCGTGACg  <  1:1200431/65‑1 (MQ=255) tCCCTCATCAATGCAGCTGGGCAGGAACGTGCCGTTTCCTCGCCAGCTCACTGTCACTCGTGACg  <  1:1876967/65‑1 (MQ=255) tCCCTCATCAATGCAGCTCGGCAGCAACGTGCCGTTTCCTCTCCAGCTCACTGTCACTCGTGACg  <  1:746227/65‑1 (MQ=255) tCCCTCATCAATGCAGCTCGGCAGCAACGTGCCGTTTCCTCGCCAGCTCACTGTCACTCGTGACg  <  1:199668/65‑1 (MQ=255) tCCCTCATCAATGCAGCTCGGCAGCAACGTGCCGTTTCCTCGCCAGCTCACTGTCACTCGTGACg  <  1:945073/65‑1 (MQ=255) tCCCTCATCAATGCAGCTCGGCAGCAACGTGCCGTTTCCTCGCCAGCTCACTGTCACTCGTGACg  <  1:911133/65‑1 (MQ=255) tCCCTCATCAATGCAGCTCGGCAGCAACGTGCCGTTTCCTCGCCAGCTCACTGTCACTCGTGACg  <  1:875619/65‑1 (MQ=255) tCCCTCATCAATGCAGCTCGGCAGCAACGTGCCGTTTCCTCGCCAGCTCACTGTCACTCGTGACg  <  1:83903/65‑1 (MQ=255) tCCCTCATCAATGCAGCTCGGCAGCAACGTGCCGTTTCCTCGCCAGCTCACTGTCACTCGTGACg  <  1:805975/65‑1 (MQ=255) tCCCTCATCAATGCAGCTCGGCAGCAACGTGCCGTTTCCTCGCCAGCTCACTGTCACTCGTGACg  <  1:768336/65‑1 (MQ=255) tCCCTCATCAATGCAGCTCGGCAGCAACGTGCCGTTTCCTCGCCAGCTCACTGTCACTCGTGACg  <  1:625808/65‑1 (MQ=255) tCCCTCATCAATGCAGCTCGGCAGCAACGTGCCGTTTCCTCGCCAGCTCACTGTCACTCGTGACg  <  1:527380/65‑1 (MQ=255) tCCCTCATCAATGCAGCTCGGCAGCAACGTGCCGTTTCCTCGCCAGCTCACTGTCACTCGTGACg  <  1:521087/65‑1 (MQ=255) tCCCTCATCAATGCAGCTCGGCAGCAACGTGCCGTTTCCTCGCCAGCTCACTGTCACTCGTGACg  <  1:415233/65‑1 (MQ=255) tCCCTCATCAATGCAGCTCGGCAGCAACGTGCCGTTTCCTCGCCAGCTCACTGTCACTCGTGACg  <  1:262818/65‑1 (MQ=255) tCCCTCATCAATGCAGCTCGGCAGCAACGTGCCGTTTCCTCGCCAGCTCACTGTCACTCGTGACg  <  1:1032678/65‑1 (MQ=255) tCCCTCATCAATGCAGCTCGGCAGCAACGTGCCGTTTCCTCGCCAGCTCACTGTCACTCGTGACg  <  1:1919264/65‑1 (MQ=255) tCCCTCATCAATGCAGCTCGGCAGCAACGTGCCGTTTCCTCGCCAGCTCACTGTCACTCGTGACg  <  1:1843711/65‑1 (MQ=255) tCCCTCATCAATGCAGCTCGGCAGCAACGTGCCGTTTCCTCGCCAGCTCACTGTCACTCGTGACg  <  1:1806951/65‑1 (MQ=255) tCCCTCATCAATGCAGCTCGGCAGCAACGTGCCGTTTCCTCGCCAGCTCACTGTCACTCGTGACg  <  1:1748897/65‑1 (MQ=255) tCCCTCATCAATGCAGCTCGGCAGCAACGTGCCGTTTCCTCGCCAGCTCACTGTCACTCGTGACg  <  1:1724041/65‑1 (MQ=255) tCCCTCATCAATGCAGCTCGGCAGCAACGTGCCGTTTCCTCGCCAGCTCACTGTCACTCGTGACg  <  1:1699617/65‑1 (MQ=255) tCCCTCATCAATGCAGCTCGGCAGCAACGTGCCGTTTCCTCGCCAGCTCACTGTCACTCGTGACg  <  1:1611432/65‑1 (MQ=255) tCCCTCATCAATGCAGCTCGGCAGCAACGTGCCGTTTCCTCGCCAGCTCACTGTCACTCGTGACg  <  1:141331/65‑1 (MQ=255) tCCCTCATCAATGCAGCTCGGCAGCAACGTGCCGTTTCCTCGCCAGCTCACTGTCACTCGTGACg  <  1:1196768/65‑1 (MQ=255) tCCCTCATCAATGCAGCTCGGCAGCAACGTGCCGTTTCCTCGCCAGCTCACTGTCACTCGTGACg  <  1:1107134/65‑1 (MQ=255)           aTGCAGCTCGGCAGCAACGTGCCGTTTCCTCGCCAGCTCACTGTCACTCGTGACg  <  1:1940836/55‑1 (MQ=255)                          aaCGTGCCGTTTCCTCGCCAGCTCACTGTCACTCGTGACg  <  1:342759/40‑1 (MQ=255)                                                                 | TCCCTCATCAATGCAGCTCGGCAGCAACGTGCCGTTTCCTCGCCAGCTCACTGTCACTCGTGACG  >  minE/1884850‑1884914

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑