Missing coverage evidence...
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TTTAAATTCACCGCCTTTATCCCAGATAAGAAGCGCACCCGCGACCGGCGCACGCGGCGAGCCGTT  >  minE/2000902‑2000967                                                                  | tttAATTTCACCGCCTTTATCCCAGATAAGAAGCGCACCCGCGACCGGCGCACGCGGCGAGCCGtt  >  1:2005383/1‑66 (MQ=255) tttAAATTCACCGCCTTTATCCCAGATAAGAAGCGCACCCGCGACCGGCGCACGCGGCGAGCCGtt  >  1:401971/1‑66 (MQ=255) tttAAATTCACCGCCTTTATCCCAGATAAGAAGCGCACCCGCGACCGGCGCACGCGGCGAGCCGtt  >  1:1872067/1‑66 (MQ=255) tttAAATTCACCGCCTTTATCCCAGATAAGAAGCGCACCCGCGACCGGCGCACGCGGCGAGCCGtt  >  1:1887962/1‑66 (MQ=255) tttAAATTCACCGCCTTTATCCCAGATAAGAAGCGCACCCGCGACCGGCGCACGCGGCGAGCCGtt  >  1:1997511/1‑66 (MQ=255) tttAAATTCACCGCCTTTATCCCAGATAAGAAGCGCACCCGCGACCGGCGCACGCGGCGAGCCGtt  >  1:259486/1‑66 (MQ=255) tttAAATTCACCGCCTTTATCCCAGATAAGAAGCGCACCCGCGACCGGCGCACGCGGCGAGCCGtt  >  1:302399/1‑66 (MQ=255) tttAAATTCACCGCCTTTATCCCAGATAAGAAGCGCACCCGCGACCGGCGCACGCGGCGAGCCGtt  >  1:319093/1‑66 (MQ=255) tttAAATTCACCGCCTTTATCCCAGATAAGAAGCGCACCCGCGACCGGCGCACGCGGCGAGCCGtt  >  1:397841/1‑66 (MQ=255) tttAAATTCACCGCCTTTATCCCAGATAAGAAGCGCACCCGCGACCGGCGCACGCGGCGAGCCGtt  >  1:399516/1‑66 (MQ=255) tttAAATTCACCGCCTTTATCCCAGATAAGAAGCGCACCCGCGACCGGCGCACGCGGCGAGCCGtt  >  1:1818954/1‑66 (MQ=255) tttAAATTCACCGCCTTTATCCCAGATAAGAAGCGCACCCGCGACCGGCGCACGCGGCGAGCCGtt  >  1:429662/1‑66 (MQ=255) tttAAATTCACCGCCTTTATCCCAGATAAGAAGCGCACCCGCGACCGGCGCACGCGGCGAGCCGtt  >  1:537680/1‑66 (MQ=255) tttAAATTCACCGCCTTTATCCCAGATAAGAAGCGCACCCGCGACCGGCGCACGCGGCGAGCCGtt  >  1:683546/1‑66 (MQ=255) tttAAATTCACCGCCTTTATCCCAGATAAGAAGCGCACCCGCGACCGGCGCACGCGGCGAGCCGtt  >  1:712955/1‑66 (MQ=255) tttAAATTCACCGCCTTTATCCCAGATAAGAAGCGCACCCGCGACCGGCGCACGCGGCGAGCCGtt  >  1:749427/1‑66 (MQ=255) tttAAATTCACCGCCTTTATCCCAGATAAGAAGCGCACCCGCGACCGGCGCACGCGGCGAGCCGtt  >  1:753555/1‑66 (MQ=255) tttAAATTCACCGCCTTTATCCCAGATAAGAAGCGCACCCGCGACCGGCGCACGCGGCGAGCCGtt  >  1:756389/1‑66 (MQ=255) tttAAATTCACCGCCTTTATCCCAGATAAGAAGCGCACCCGCGACCGGCGCACGCGGCGAGCCGtt  >  1:792130/1‑66 (MQ=255) tttAAATTCACCGCCTTTATCCCAGATAAGAAGCGCACCCGCGACCGGCGCACGCGGCGAGCCGtt  >  1:974263/1‑66 (MQ=255) tttAAATTCACCGCCTTTATCCCAGATAAGAAGCGCACCCGCGACCGGCGCACGCGGCGAGCCGtt  >  1:1436398/1‑66 (MQ=255) tttAAATTCACCGCCTTTATCCCAGATAAGAAGCGCACCCGCGACCGGCGCACGCGGCGAGCCGtt  >  1:1077785/1‑66 (MQ=255) tttAAATTCACCGCCTTTATCCCAGATAAGAAGCGCACCCGCGACCGGCGCACGCGGCGAGCCGtt  >  1:1175463/1‑66 (MQ=255) tttAAATTCACCGCCTTTATCCCAGATAAGAAGCGCACCCGCGACCGGCGCACGCGGCGAGCCGtt  >  1:1199793/1‑66 (MQ=255) tttAAATTCACCGCCTTTATCCCAGATAAGAAGCGCACCCGCGACCGGCGCACGCGGCGAGCCGtt  >  1:1205670/1‑66 (MQ=255) tttAAATTCACCGCCTTTATCCCAGATAAGAAGCGCACCCGCGACCGGCGCACGCGGCGAGCCGtt  >  1:1210071/1‑66 (MQ=255) tttAAATTCACCGCCTTTATCCCAGATAAGAAGCGCACCCGCGACCGGCGCACGCGGCGAGCCGtt  >  1:1262185/1‑66 (MQ=255) tttAAATTCACCGCCTTTATCCCAGATAAGAAGCGCACCCGCGACCGGCGCACGCGGCGAGCCGtt  >  1:1294840/1‑66 (MQ=255) tttAAATTCACCGCCTTTATCCCAGATAAGAAGCGCACCCGCGACCGGCGCACGCGGCGAGCCGtt  >  1:1321057/1‑66 (MQ=255) tttAAATTCACCGCCTTTATCCCAGATAAGAAGCGCACCCGCGACCGGCGCACGCGGCGAGCCGtt  >  1:1365407/1‑66 (MQ=255) tttAAATTCACCGCCTTTATCCCAGATAAGAAGCGCACCCGCGACCGGCGCACGCGGCGAGCCGtt  >  1:1400076/1‑66 (MQ=255) tttAAATTCACCGCCTTTATCCCAGATAAGAAGCGCACCCGCGACCGGCGCACGCGGCGAGCCGtt  >  1:1044451/1‑66 (MQ=255) tttAAATTCACCGCCTTTATCCCAGATAAGAAGCGCACCCGCGACCGGCGCACGCGGCGAGCCGtt  >  1:1498200/1‑66 (MQ=255) tttAAATTCACCGCCTTTATCCCAGATAAGAAGCGCACCCGCGACCGGCGCACGCGGCGAGCCGtt  >  1:1651480/1‑66 (MQ=255) tttAAATTCACCGCCTTTATCCCAGATAAGAAGCGCACCCGCGACCGGCGCACGCGGCGAGCCGtt  >  1:1655283/1‑66 (MQ=255) tttAAATTCACCGCCTTTATCCCAGATAAGAAGCGCACCCGCGACCGGCGCACGCGGCGAGCCGtt  >  1:1689361/1‑66 (MQ=255) tttAAATTCACCGCCTTTATCCCAGATAAGAAGCGCACCCGCGACCGGCGCACGCGGCGAGCCGtt  >  1:1691876/1‑66 (MQ=255) tttAAATTCACCGCCTTTATCCCAGATAAGAAGCGCACCCGCGACCGGCGCACGCGGCGAGCCGtt  >  1:16959/1‑66 (MQ=255) tttAAATTCACCGCCTTTATCCCAGATAAGAAGCGCACCCGCGACCGGCGCACGCGGCGAGCCGtt  >  1:1727755/1‑66 (MQ=255) tttAAATTCACCGCCTTTATCCCAGATAAGAAGCGCACCCGCGACCGGCGCACGCGGCGAGCCGtt  >  1:1778349/1‑66 (MQ=255) tttAAATTCACCGCCTTTATCCCAGATAAGAAGCGCACCCGCGACCGGCGCACG‑GGCGAGCCGtt  >  1:1961686/1‑65 (MQ=255)                                                                  | TTTAAATTCACCGCCTTTATCCCAGATAAGAAGCGCACCCGCGACCGGCGCACGCGGCGAGCCGTT  >  minE/2000902‑2000967

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑