Missing coverage evidence...
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CGTAAGGACCGACGTCATCATTGAAGTTACGCGGACCAGAGTTCCAGGTTGATGGAACAACCGCCTG  >  minE/2004195‑2004261                                                                   | cGTAAGGACCGACGTCATCATTGAAGTTACGCGGACCAGAGTTCCAGGTTGATGGAACAACCGCCTg  <  1:1085201/67‑1 (MQ=255) cGTAAGGACCGACGTCATCATTGAAGTTACGCGGACCAGAGTTCCAGGTTGATGGAACAACCGCCTg  <  1:863316/67‑1 (MQ=255) cGTAAGGACCGACGTCATCATTGAAGTTACGCGGACCAGAGTTCCAGGTTGATGGAACAACCGCCTg  <  1:784824/67‑1 (MQ=255) cGTAAGGACCGACGTCATCATTGAAGTTACGCGGACCAGAGTTCCAGGTTGATGGAACAACCGCCTg  <  1:62286/67‑1 (MQ=255) cGTAAGGACCGACGTCATCATTGAAGTTACGCGGACCAGAGTTCCAGGTTGATGGAACAACCGCCTg  <  1:359046/67‑1 (MQ=255) cGTAAGGACCGACGTCATCATTGAAGTTACGCGGACCAGAGTTCCAGGTTGATGGAACAACCGCCTg  <  1:326440/67‑1 (MQ=255) cGTAAGGACCGACGTCATCATTGAAGTTACGCGGACCAGAGTTCCAGGTTGATGGAACAACCGCCTg  <  1:306111/67‑1 (MQ=255) cGTAAGGACCGACGTCATCATTGAAGTTACGCGGACCAGAGTTCCAGGTTGATGGAACAACCGCCTg  <  1:224436/67‑1 (MQ=255) cGTAAGGACCGACGTCATCATTGAAGTTACGCGGACCAGAGTTCCAGGTTGATGGAACAACCGCCTg  <  1:2026685/67‑1 (MQ=255) cGTAAGGACCGACGTCATCATTGAAGTTACGCGGACCAGAGTTCCAGGTTGATGGAACAACCGCCTg  <  1:1990447/67‑1 (MQ=255) cGTAAGGACCGACGTCATCATTGAAGTTACGCGGACCAGAGTTCCAGGTTGATGGAACAACCGCCTg  <  1:1909779/67‑1 (MQ=255) cGTAAGGACCGACGTCATCATTGAAGTTACGCGGACCAGAGTTCCAGGTTGATGGAACAACCGCCTg  <  1:1860488/67‑1 (MQ=255) cGTAAGGACCGACGTCATCATTGAAGTTACGCGGACCAGAGTTCCAGGTTGATGGAACAACCGCCTg  <  1:1555744/67‑1 (MQ=255) cGTAAGGACCGACGTCATCATTGAAGTTACGCGGACCAGAGTTCCAGGTTGATGGAACAACCGCCTg  <  1:1389443/67‑1 (MQ=255) cGTAAGGACCGACGTCATCATTGAAGTTACGCGGACCAGAGTTCCAGGTTGATGGAACAACCGCCTg  <  1:1388166/67‑1 (MQ=255) cGTAAGGACCGACGTCATCATTGAAGTTACGCGGACCAGAGTTCCAGGTTGATGGAACAACCGCCTg  <  1:133155/67‑1 (MQ=255) cGTAAGGACCGACGTCATCATTGAAGTTACGCGGACCAGAGTTCCAGGTTGATGGAACAACCGCCTg  <  1:1250607/67‑1 (MQ=255) cGTAAGGACCGACGTCATCATTGAAGTTACGCGGACCAGAGTTCCAGGTTGATGGAACAACCGCCTg  <  1:1146736/67‑1 (MQ=255) cGTAAGGACCGACGTCATCATTGAAGTTACGCGGACCAGAGTTCCAGGTTGATGGAACAACCGCCTg  <  1:103819/67‑1 (MQ=255) cGTAAGGACCGACGTCATCATTGAAGTTACGCGGACCAGAGTTCCAGGTTGACGGAACAACCGCCTg  <  1:1452618/67‑1 (MQ=255)  ttAAGGACCGACGTCATCATTGAAGTTACGCGGACCAGAGTTCCAGGTTGATGGAACAACCGCCTg  <  1:1376916/65‑1 (MQ=255)  gTAAGGACCGACGTCATCATTGAAGTTACGCGGACCAGAGTTCCAGGTTGATGGAACAACCGCCTg  <  1:1544203/66‑1 (MQ=255)  gTAAGGACCGACGTCATCATTGAAGTTACGCGGACCAGAGTTCCAGGTTGATGGAACAACCGCCTg  <  1:781974/66‑1 (MQ=255)  gTAAGGACCGACGTCATCATTGAAGTTACGCGGACCAGAGTTCCAGGTTGATGGAACAACCGCCTg  <  1:792894/66‑1 (MQ=255)              gTCATGATTGAAGTTACGCGGACCAGAGTTCCAGGTTGATGGAACAACCGCCTg  <  1:1888371/54‑1 (MQ=255)                             aCGCGGACCAGAGTTCCAGGTTGATGGAACAACCGCCTg  <  1:115681/39‑1 (MQ=255)                                                                   | CGTAAGGACCGACGTCATCATTGAAGTTACGCGGACCAGAGTTCCAGGTTGATGGAACAACCGCCTG  >  minE/2004195‑2004261

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑