Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	minE	2204965	2204971	7	28 [0]	[0] 5	aaeR	predicted DNA‑binding transcriptional regulator, efflux system

TCAGTCAGACGGTATCAAAACTGGAAGATGAGTTGCAGGTAAAGCTGTTAAACCGTAGCACACGCA  >  minE/2204899‑2204964                                                                  | tcagtcagACTGTATCAAAACTGGAAGATGAGTTGCAGGTAAAGCTGTTAAACCGTAGCACACgca  <  1:1941590/66‑1 (MQ=255) tcagtcagACGGTATCAAAACTGGAAGATGAGTTGCAGGTAAAGCTGTTAAACCGTAGCACACgca  <  1:1945753/66‑1 (MQ=255) tcagtcagACGGTATCAAAACTGGAAGATGAGTTGCAGGTAAAGCTGTTAAACCGTAGCACACgca  <  1:989919/66‑1 (MQ=255) tcagtcagACGGTATCAAAACTGGAAGATGAGTTGCAGGTAAAGCTGTTAAACCGTAGCACACgca  <  1:953079/66‑1 (MQ=255) tcagtcagACGGTATCAAAACTGGAAGATGAGTTGCAGGTAAAGCTGTTAAACCGTAGCACACgca  <  1:719142/66‑1 (MQ=255) tcagtcagACGGTATCAAAACTGGAAGATGAGTTGCAGGTAAAGCTGTTAAACCGTAGCACACgca  <  1:64468/66‑1 (MQ=255) tcagtcagACGGTATCAAAACTGGAAGATGAGTTGCAGGTAAAGCTGTTAAACCGTAGCACACgca  <  1:594970/66‑1 (MQ=255) tcagtcagACGGTATCAAAACTGGAAGATGAGTTGCAGGTAAAGCTGTTAAACCGTAGCACACgca  <  1:555260/66‑1 (MQ=255) tcagtcagACGGTATCAAAACTGGAAGATGAGTTGCAGGTAAAGCTGTTAAACCGTAGCACACgca  <  1:449402/66‑1 (MQ=255) tcagtcagACGGTATCAAAACTGGAAGATGAGTTGCAGGTAAAGCTGTTAAACCGTAGCACACgca  <  1:28624/66‑1 (MQ=255) tcagtcagACGGTATCAAAACTGGAAGATGAGTTGCAGGTAAAGCTGTTAAACCGTAGCACACgca  <  1:26709/66‑1 (MQ=255) tcagtcagACGGTATCAAAACTGGAAGATGAGTTGCAGGTAAAGCTGTTAAACCGTAGCACACgca  <  1:259169/66‑1 (MQ=255) tcagtcagACGGTATCAAAACTGGAAGATGAGTTGCAGGTAAAGCTGTTAAACCGTAGCACACgca  <  1:2127261/66‑1 (MQ=255) tcagtcagACGGTATCAAAACTGGAAGATGAGTTGCAGGTAAAGCTGTTAAACCGTAGCACACgca  <  1:2004174/66‑1 (MQ=255) tcagtcagACGGTATCAAAACTGGAAGATGAGTTGCAGGTAAAGCTGTTAAACCGTAGCACACgca  <  1:1071216/66‑1 (MQ=255) tcagtcagACGGTATCAAAACTGGAAGATGAGTTGCAGGTAAAGCTGTTAAACCGTAGCACACgca  <  1:1893306/66‑1 (MQ=255) tcagtcagACGGTATCAAAACTGGAAGATGAGTTGCAGGTAAAGCTGTTAAACCGTAGCACACgca  <  1:1857722/66‑1 (MQ=255) tcagtcagACGGTATCAAAACTGGAAGATGAGTTGCAGGTAAAGCTGTTAAACCGTAGCACACgca  <  1:173847/66‑1 (MQ=255) tcagtcagACGGTATCAAAACTGGAAGATGAGTTGCAGGTAAAGCTGTTAAACCGTAGCACACgca  <  1:1565284/66‑1 (MQ=255) tcagtcagACGGTATCAAAACTGGAAGATGAGTTGCAGGTAAAGCTGTTAAACCGTAGCACACgca  <  1:1513728/66‑1 (MQ=255) tcagtcagACGGTATCAAAACTGGAAGATGAGTTGCAGGTAAAGCTGTTAAACCGTAGCACACgca  <  1:1487172/66‑1 (MQ=255) tcagtcagACGGTATCAAAACTGGAAGATGAGTTGCAGGTAAAGCTGTTAAACCGTAGCACACgca  <  1:1449933/66‑1 (MQ=255) tcagtcagACGGTATCAAAACTGGAAGATGAGTTGCAGGTAAAGCTGTTAAACCGTAGCACACgca  <  1:1381260/66‑1 (MQ=255) tcagtcagACGGTATCAAAACTGGAAGATGAGTTGCAGGTAAAGCTGTTAAACCGTAGCACACgca  <  1:1379857/66‑1 (MQ=255) tcagtcagACGGTATCAAAACTGGAAGATGAGTTGCAGGTAAAGCTGTTAAACCGTAGCACACgca  <  1:1285293/66‑1 (MQ=255) tcagtcagACGGTATCAAAACTGGAAGATGAGTTGCAGGTAAAGCTGTTAAACCGTAGCACACgca  <  1:1190834/66‑1 (MQ=255)  cagtcagACGGTATCAAAACTGGAAGATGAGTTGCAGGTAAAGCTGTTAAACCGTAGCACACgca  <  1:359892/65‑1 (MQ=255)                              gAGTTGCAGGTAAAGCTGTTAAACCGTAGCACACgca  <  1:1304019/37‑1 (MQ=255)                                                                  | TCAGTCAGACGGTATCAAAACTGGAAGATGAGTTGCAGGTAAAGCTGTTAAACCGTAGCACACGCA  >  minE/2204899‑2204964

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑