Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	minE	2243012	2243078	67	21 [0]	[0] 22	nfi	endonuclease V

CCGAGGCCACCGCGTCCGCCCAGCGCGTTGGCTCCGGCAGACGAT  >  minE/2242967‑2243011                                             | ccGAGGCCACCGCGTCCGCCCAGCGCGTTGGCTCCGGCAGCCGAt  <  1:2130/45‑1 (MQ=255) ccGAGGCCACCGCGTCCGCCCAGCGCGTTGGCTCCGGCAGACGAt  <  1:2078039/45‑1 (MQ=255) ccGAGGCCACCGCGTCCGCCCAGCGCGTTGGCTCCGGCAGACGAt  <  1:995984/45‑1 (MQ=255) ccGAGGCCACCGCGTCCGCCCAGCGCGTTGGCTCCGGCAGACGAt  <  1:925379/45‑1 (MQ=255) ccGAGGCCACCGCGTCCGCCCAGCGCGTTGGCTCCGGCAGACGAt  <  1:628870/45‑1 (MQ=255) ccGAGGCCACCGCGTCCGCCCAGCGCGTTGGCTCCGGCAGACGAt  <  1:563104/45‑1 (MQ=255) ccGAGGCCACCGCGTCCGCCCAGCGCGTTGGCTCCGGCAGACGAt  <  1:44648/45‑1 (MQ=255) ccGAGGCCACCGCGTCCGCCCAGCGCGTTGGCTCCGGCAGACGAt  <  1:380075/45‑1 (MQ=255) ccGAGGCCACCGCGTCCGCCCAGCGCGTTGGCTCCGGCAGACGAt  <  1:2113849/45‑1 (MQ=255) ccGAGGCCACCGCGTCCGCCCAGCGCGTTGGCTCCGGCAGACGAt  <  1:1006710/45‑1 (MQ=255) ccGAGGCCACCGCGTCCGCCCAGCGCGTTGGCTCCGGCAGACGAt  <  1:15986/45‑1 (MQ=255) ccGAGGCCACCGCGTCCGCCCAGCGCGTTGGCTCCGGCAGACGAt  <  1:1415947/45‑1 (MQ=255) ccGAGGCCACCGCGTCCGCCCAGCGCGTTGGCTCCGGCAGACGAt  <  1:1294272/45‑1 (MQ=255) ccGAGGCCACCGCGTCCGCCCAGCGCGTTGGCTCCGGCAGACGAt  <  1:127807/45‑1 (MQ=255) ccGAGGCCACCGCGTCCGCCCAGCGCGTTGGCTCCGGCAGACGAt  <  1:1277960/45‑1 (MQ=255) ccGAGGCCACCGCGTCCGCCCAGCGCGTTGGCTCCGGCAGACGAt  <  1:1138114/45‑1 (MQ=255) ccGAGGCCACCGCGTCCGCCCAGCGCGTTGGCTCCGGCAGACGAt  <  1:1017303/45‑1 (MQ=255)  cGAGGCCACCGCGTCCGCCCAGCGCGTTGGCTCCGGCAGACGAt  <  1:587014/44‑1 (MQ=255)       ccACCGCGTCCGCCCAGCGCGTTGGCTCCGGCAGACGAt  <  1:1170662/39‑1 (MQ=255)        cACCGCGGCCGCCCAGCGCGTTGGCTCCGGCAGACTAt  <  1:1387394/38‑1 (MQ=37)         aCCGCGTCCGCCCAGCGCGTTGGCTCCGGCAGACGAt  <  1:855245/37‑1 (MQ=255)                                             | CCGAGGCCACCGCGTCCGCCCAGCGCGTTGGCTCCGGCAGACGAT  >  minE/2242967‑2243011

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑