Missing coverage evidence...
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GGAGACGGAATACGCCGAGTTAAAGCAACTTGGTCTGGATGGCGTGATGGTTTATCAGGAGACAT  >  minE/2251007‑2251071                                                                 | ggAGACGGAATACGCCGAGTTAAAGCAACTTGGTCTGGATGGCGTGATGGTTTATCAGGAGACat  <  1:189564/65‑1 (MQ=255) ggAGACGGAATACGCCGAGTTAAAGCAACTTGGTCTGGATGGCGTGATGGTTTATCAGGAGACat  <  1:996209/65‑1 (MQ=255) ggAGACGGAATACGCCGAGTTAAAGCAACTTGGTCTGGATGGCGTGATGGTTTATCAGGAGACat  <  1:813159/65‑1 (MQ=255) ggAGACGGAATACGCCGAGTTAAAGCAACTTGGTCTGGATGGCGTGATGGTTTATCAGGAGACat  <  1:71724/65‑1 (MQ=255) ggAGACGGAATACGCCGAGTTAAAGCAACTTGGTCTGGATGGCGTGATGGTTTATCAGGAGACat  <  1:689542/65‑1 (MQ=255) ggAGACGGAATACGCCGAGTTAAAGCAACTTGGTCTGGATGGCGTGATGGTTTATCAGGAGACat  <  1:677223/65‑1 (MQ=255) ggAGACGGAATACGCCGAGTTAAAGCAACTTGGTCTGGATGGCGTGATGGTTTATCAGGAGACat  <  1:675301/65‑1 (MQ=255) ggAGACGGAATACGCCGAGTTAAAGCAACTTGGTCTGGATGGCGTGATGGTTTATCAGGAGACat  <  1:537552/65‑1 (MQ=255) ggAGACGGAATACGCCGAGTTAAAGCAACTTGGTCTGGATGGCGTGATGGTTTATCAGGAGACat  <  1:514372/65‑1 (MQ=255) ggAGACGGAATACGCCGAGTTAAAGCAACTTGGTCTGGATGGCGTGATGGTTTATCAGGAGACat  <  1:513940/65‑1 (MQ=255) ggAGACGGAATACGCCGAGTTAAAGCAACTTGGTCTGGATGGCGTGATGGTTTATCAGGAGACat  <  1:493585/65‑1 (MQ=255) ggAGACGGAATACGCCGAGTTAAAGCAACTTGGTCTGGATGGCGTGATGGTTTATCAGGAGACat  <  1:460302/65‑1 (MQ=255) ggAGACGGAATACGCCGAGTTAAAGCAACTTGGTCTGGATGGCGTGATGGTTTATCAGGAGACat  <  1:443982/65‑1 (MQ=255) ggAGACGGAATACGCCGAGTTAAAGCAACTTGGTCTGGATGGCGTGATGGTTTATCAGGAGACat  <  1:345616/65‑1 (MQ=255) ggAGACGGAATACGCCGAGTTAAAGCAACTTGGTCTGGATGGCGTGATGGTTTATCAGGAGACat  <  1:309599/65‑1 (MQ=255) ggAGACGGAATACGCCGAGTTAAAGCAACTTGGTCTGGATGGCGTGATGGTTTATCAGGAGACat  <  1:282772/65‑1 (MQ=255) ggAGACGGAATACGCCGAGTTAAAGCAACTTGGTCTGGATGGCGTGATGGTTTATCAGGAGACat  <  1:1256632/65‑1 (MQ=255) ggAGACGGAATACGCCGAGTTAAAGCAACTTGGTCTGGATGGCGTGATGGTTTATCAGGAGACat  <  1:1060109/65‑1 (MQ=255) ggAGACGGAATACGCCGAGTTAAAGCAACTTGGTCTGGATGGCGTGATGGTTTATCAGGAGACat  <  1:1071461/65‑1 (MQ=255) ggAGACGGAATACGCCGAGTTAAAGCAACTTGGTCTGGATGGCGTGATGGTTTATCAGGAGACat  <  1:1136795/65‑1 (MQ=255) ggAGACGGAATACGCCGAGTTAAAGCAACTTGGTCTGGATGGCGTGATGGTTTATCAGGAGACat  <  1:1145179/65‑1 (MQ=255) ggAGACGGAATACGCCGAGTTAAAGCAACTTGGTCTGGATGGCGTGATGGTTTATCAGGAGACat  <  1:1167325/65‑1 (MQ=255) ggAGACGGAATACGCCGAGTTAAAGCAACTTGGTCTGGATGGCGTGATGGTTTATCAGGAGACat  <  1:1195680/65‑1 (MQ=255) ggAGACGGAATACGCCGAGTTAAAGCAACTTGGTCTGGATGGCGTGATGGTTTATCAGGAGACat  <  1:1246823/65‑1 (MQ=255) ggAGACGGAATACGCCGAGTTAAAGCAACTTGGTCTGGATGGCGTGATGGTTTATCAGGAGACat  <  1:1010804/65‑1 (MQ=255) ggAGACGGAATACGCCGAGTTAAAGCAACTTGGTCTGGATGGCGTGATGGTTTATCAGGAGACat  <  1:1455483/65‑1 (MQ=255) ggAGACGGAATACGCCGAGTTAAAGCAACTTGGTCTGGATGGCGTGATGGTTTATCAGGAGACat  <  1:1546034/65‑1 (MQ=255) ggAGACGGAATACGCCGAGTTAAAGCAACTTGGTCTGGATGGCGTGATGGTTTATCAGGAGACat  <  1:1583944/65‑1 (MQ=255) ggAGACGGAATACGCCGAGTTAAAGCAACTTGGTCTGGATGGCGTGATGGTTTATCAGGAGACat  <  1:1684083/65‑1 (MQ=255) ggAGACGGAATACGCCGAGTTAAAGCAACTTGGTCTGGATGGCGTGATGGTTTATCAGGAGACat  <  1:1727024/65‑1 (MQ=255) ggAGACGGAATACGCCGAGTTAAAGCAACTTGGTCTGGATGGCGTGATGGTTTATCAGGAGACat  <  1:1759719/65‑1 (MQ=255) ggAGACGGAATACGCCGAGTTAAAGCAACTTGGTCTGGATGGCGTGATGGTTTATCAGGAGACat  <  1:1890549/65‑1 (MQ=255) ggAGACGGAATACGCCGAGTTAAAGCAACTTGGCCTGGATGGCGTGATGGTTTATCAGGAGACat  <  1:568880/65‑1 (MQ=255)                                                                 | GGAGACGGAATACGCCGAGTTAAAGCAACTTGGTCTGGATGGCGTGATGGTTTATCAGGAGACAT  >  minE/2251007‑2251071

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑