Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	minE	2252133	2252134	2	34 [0]	[0] 4	htrC	heat shock protein

TTTGAGGGCTGAGGAAGCTGCTTATTTCTCAATAAGTTGTAGGCAATGGTGAAAAATTTCACTGATT  >  minE/2252066‑2252132                                                                   | tttGAGGGCTGAGGAAGCTGCTTATTTCTCAATAAGTTGTAGGCAATGGTGAAAAATTTCACTGAtt  >  1:39945/1‑67 (MQ=255) tttGAGGGCTGAGGAAGCTGCTTATTTCTCAATAAGTTGTAGGCAATGGTGAAAAATTTCACTGAtt  >  1:1848616/1‑67 (MQ=255) tttGAGGGCTGAGGAAGCTGCTTATTTCTCAATAAGTTGTAGGCAATGGTGAAAAATTTCACTGAtt  >  1:1872950/1‑67 (MQ=255) tttGAGGGCTGAGGAAGCTGCTTATTTCTCAATAAGTTGTAGGCAATGGTGAAAAATTTCACTGAtt  >  1:1903961/1‑67 (MQ=255) tttGAGGGCTGAGGAAGCTGCTTATTTCTCAATAAGTTGTAGGCAATGGTGAAAAATTTCACTGAtt  >  1:196564/1‑67 (MQ=255) tttGAGGGCTGAGGAAGCTGCTTATTTCTCAATAAGTTGTAGGCAATGGTGAAAAATTTCACTGAtt  >  1:2005524/1‑67 (MQ=255) tttGAGGGCTGAGGAAGCTGCTTATTTCTCAATAAGTTGTAGGCAATGGTGAAAAATTTCACTGAtt  >  1:2084200/1‑67 (MQ=255) tttGAGGGCTGAGGAAGCTGCTTATTTCTCAATAAGTTGTAGGCAATGGTGAAAAATTTCACTGAtt  >  1:2140383/1‑67 (MQ=255) tttGAGGGCTGAGGAAGCTGCTTATTTCTCAATAAGTTGTAGGCAATGGTGAAAAATTTCACTGAtt  >  1:36445/1‑67 (MQ=255) tttGAGGGCTGAGGAAGCTGCTTATTTCTCAATAAGTTGTAGGCAATGGTGAAAAATTTCACTGAtt  >  1:1842856/1‑67 (MQ=255) tttGAGGGCTGAGGAAGCTGCTTATTTCTCAATAAGTTGTAGGCAATGGTGAAAAATTTCACTGAtt  >  1:412830/1‑67 (MQ=255) tttGAGGGCTGAGGAAGCTGCTTATTTCTCAATAAGTTGTAGGCAATGGTGAAAAATTTCACTGAtt  >  1:436289/1‑67 (MQ=255) tttGAGGGCTGAGGAAGCTGCTTATTTCTCAATAAGTTGTAGGCAATGGTGAAAAATTTCACTGAtt  >  1:6220/1‑67 (MQ=255) tttGAGGGCTGAGGAAGCTGCTTATTTCTCAATAAGTTGTAGGCAATGGTGAAAAATTTCACTGAtt  >  1:717892/1‑67 (MQ=255) tttGAGGGCTGAGGAAGCTGCTTATTTCTCAATAAGTTGTAGGCAATGGTGAAAAATTTCACTGAtt  >  1:959005/1‑67 (MQ=255) tttGAGGGCTGAGGAAGCTGCTTATTTCTCAATAAGTTGTAGGCAATGGTGAAAAATTTCACTGAtt  >  1:962284/1‑67 (MQ=255) tttGAGGGCTGAGGAAGCTGCTTATTTCTCAATAAGTTGTAGGCAATGGTGAAAAATTTCACTGAtt  >  1:967707/1‑67 (MQ=255) tttGAGGGCTGAGGAAGCTGCTTATTTCTCAATAAGTTGTAGGCAATGGTGAAAAATTTCACTGAtt  >  1:1627125/1‑67 (MQ=255) tttGAGGGCTGAGGAAGCTGCTTATTTCTCAATAAGTTGTAGGCAATGGTGAAAAATTTCACTGAtt  >  1:1154382/1‑67 (MQ=255) tttGAGGGCTGAGGAAGCTGCTTATTTCTCAATAAGTTGTAGGCAATGGTGAAAAATTTCACTGAtt  >  1:1154437/1‑67 (MQ=255) tttGAGGGCTGAGGAAGCTGCTTATTTCTCAATAAGTTGTAGGCAATGGTGAAAAATTTCACTGAtt  >  1:1211785/1‑67 (MQ=255) tttGAGGGCTGAGGAAGCTGCTTATTTCTCAATAAGTTGTAGGCAATGGTGAAAAATTTCACTGAtt  >  1:1287708/1‑67 (MQ=255) tttGAGGGCTGAGGAAGCTGCTTATTTCTCAATAAGTTGTAGGCAATGGTGAAAAATTTCACTGAtt  >  1:1362256/1‑67 (MQ=255) tttGAGGGCTGAGGAAGCTGCTTATTTCTCAATAAGTTGTAGGCAATGGTGAAAAATTTCACTGAtt  >  1:1439652/1‑67 (MQ=255) tttGAGGGCTGAGGAAGCTGCTTATTTCTCAATAAGTTGTAGGCAATGGTGAAAAATTTCACTGAtt  >  1:1470832/1‑67 (MQ=255) tttGAGGGCTGAGGAAGCTGCTTATTTCTCAATAAGTTGTAGGCAATGGTGAAAAATTTCACTGAtt  >  1:1591976/1‑67 (MQ=255) tttGAGGGCTGAGGAAGCTGCTTATTTCTCAATAAGTTGTAGGCAATGGTGAAAAATTTCACTGAtt  >  1:1114613/1‑67 (MQ=255) tttGAGGGCTGAGGAAGCTGCTTATTTCTCAATAAGTTGTAGGCAATGGTGAAAAATTTCACTGAtt  >  1:1632107/1‑67 (MQ=255) tttGAGGGCTGAGGAAGCTGCTTATTTCTCAATAAGTTGTAGGCAATGGTGAAAAATTTCACTGAtt  >  1:1639931/1‑67 (MQ=255) tttGAGGGCTGAGGAAGCTGCTTATTTCTCAATAAGTTGTAGGCAATGGTGAAAAATTTCACTGAtt  >  1:1710219/1‑67 (MQ=255) tttGAGGGCTGAGGAAGCTGCTTATTTCTCAATAAGTTGTAGGCAATGGTGAAAAATTTCACTGAtt  >  1:1712173/1‑67 (MQ=255) tttGAGGGCTGAGGAAGCTGCTTATTTCTCAATAAGTTGTAGGCAATGGTGAAAAATTTCACTGAtt  >  1:176690/1‑67 (MQ=255) tttGAGGGCTGAGGAAGCTGCTTATTTCTCAATAAGTTGTAGGCAATGGTGAAAAATTTCACTGAtt  >  1:1788662/1‑67 (MQ=255) tttGAGGGCTGAGGAAGCTGCTTATTTCTCAATAAGTTGTAGGCAATGGTGAAAAATTTCACTGAtt  >  1:1829478/1‑67 (MQ=255)                                                                   | TTTGAGGGCTGAGGAAGCTGCTTATTTCTCAATAAGTTGTAGGCAATGGTGAAAAATTTCACTGATT  >  minE/2252066‑2252132

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑