Missing coverage evidence...
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TCGATACCACGTTTGATCAGCAGCCTACCCTGGCCATCCGGGCTTGGATCGCCAGCCACCACGTTAC  >  minE/196372‑196438                                                                   | tCGATACCACGTTTGATCAGCAGCCTACCCTGGCCATCCGTGCTTGGATCGCCAGCCACCACGTTAc  <  1:152117/67‑1 (MQ=255) tCGATACCACGTTTGATCAGCAGCCTACCCTGGCCATCCGGGCTTGGATCGCCAGCCACCACGTTAc  <  1:606472/67‑1 (MQ=255) tCGATACCACGTTTGATCAGCAGCCTACCCTGGCCATCCGGGCTTGGATCGCCAGCCACCACGTTAc  <  1:2140333/67‑1 (MQ=255) tCGATACCACGTTTGATCAGCAGCCTACCCTGGCCATCCGGGCTTGGATCGCCAGCCACCACGTTAc  <  1:2152717/67‑1 (MQ=255) tCGATACCACGTTTGATCAGCAGCCTACCCTGGCCATCCGGGCTTGGATCGCCAGCCACCACGTTAc  <  1:2154160/67‑1 (MQ=255) tCGATACCACGTTTGATCAGCAGCCTACCCTGGCCATCCGGGCTTGGATCGCCAGCCACCACGTTAc  <  1:308639/67‑1 (MQ=255) tCGATACCACGTTTGATCAGCAGCCTACCCTGGCCATCCGGGCTTGGATCGCCAGCCACCACGTTAc  <  1:391305/67‑1 (MQ=255) tCGATACCACGTTTGATCAGCAGCCTACCCTGGCCATCCGGGCTTGGATCGCCAGCCACCACGTTAc  <  1:396475/67‑1 (MQ=255) tCGATACCACGTTTGATCAGCAGCCTACCCTGGCCATCCGGGCTTGGATCGCCAGCCACCACGTTAc  <  1:482451/67‑1 (MQ=255) tCGATACCACGTTTGATCAGCAGCCTACCCTGGCCATCCGGGCTTGGATCGCCAGCCACCACGTTAc  <  1:487717/67‑1 (MQ=255) tCGATACCACGTTTGATCAGCAGCCTACCCTGGCCATCCGGGCTTGGATCGCCAGCCACCACGTTAc  <  1:519715/67‑1 (MQ=255) tCGATACCACGTTTGATCAGCAGCCTACCCTGGCCATCCGGGCTTGGATCGCCAGCCACCACGTTAc  <  1:531954/67‑1 (MQ=255) tCGATACCACGTTTGATCAGCAGCCTACCCTGGCCATCCGGGCTTGGATCGCCAGCCACCACGTTAc  <  1:599933/67‑1 (MQ=255) tCGATACCACGTTTGATCAGCAGCCTACCCTGGCCATCCGGGCTTGGATCGCCAGCCACCACGTTAc  <  1:2124477/67‑1 (MQ=255) tCGATACCACGTTTGATCAGCAGCCTACCCTGGCCATCCGGGCTTGGATCGCCAGCCACCACGTTAc  <  1:651942/67‑1 (MQ=255) tCGATACCACGTTTGATCAGCAGCCTACCCTGGCCATCCGGGCTTGGATCGCCAGCCACCACGTTAc  <  1:666988/67‑1 (MQ=255) tCGATACCACGTTTGATCAGCAGCCTACCCTGGCCATCCGGGCTTGGATCGCCAGCCACCACGTTAc  <  1:710080/67‑1 (MQ=255) tCGATACCACGTTTGATCAGCAGCCTACCCTGGCCATCCGGGCTTGGATCGCCAGCCACCACGTTAc  <  1:732566/67‑1 (MQ=255) tCGATACCACGTTTGATCAGCAGCCTACCCTGGCCATCCGGGCTTGGATCGCCAGCCACCACGTTAc  <  1:738140/67‑1 (MQ=255) tCGATACCACGTTTGATCAGCAGCCTACCCTGGCCATCCGGGCTTGGATCGCCAGCCACCACGTTAc  <  1:79133/67‑1 (MQ=255) tCGATACCACGTTTGATCAGCAGCCTACCCTGGCCATCCGGGCTTGGATCGCCAGCCACCACGTTAc  <  1:821869/67‑1 (MQ=255) tCGATACCACGTTTGATCAGCAGCCTACCCTGGCCATCCGGGCTTGGATCGCCAGCCACCACGTTAc  <  1:872012/67‑1 (MQ=255) tCGATACCACGTTTGATCAGCAGCCTACCCTGGCCATCCGGGCTTGGATCGCCAGCCACCACGTTAc  <  1:882262/67‑1 (MQ=255) tCGATACCACGTTTGATCAGCAGCCTACCCTGGCCATCCGGGCTTGGATCGCCAGCCACCACGTTAc  <  1:917404/67‑1 (MQ=255) tCGATACCACGTTTGATCAGCAGCCTACCCTGGCCATCCGGGCTTGGATCGCCAGCCACCACGTTAc  <  1:1654897/67‑1 (MQ=255) tCGATACCACGTTTGATCAGCAGCCTACCCTGGCCATCCGGGCTTGGATCGCCAGCCACCACGTTAc  <  1:1123191/67‑1 (MQ=255) tCGATACCACGTTTGATCAGCAGCCTACCCTGGCCATCCGGGCTTGGATCGCCAGCCACCACGTTAc  <  1:1129208/67‑1 (MQ=255) tCGATACCACGTTTGATCAGCAGCCTACCCTGGCCATCCGGGCTTGGATCGCCAGCCACCACGTTAc  <  1:1176883/67‑1 (MQ=255) tCGATACCACGTTTGATCAGCAGCCTACCCTGGCCATCCGGGCTTGGATCGCCAGCCACCACGTTAc  <  1:1304260/67‑1 (MQ=255) tCGATACCACGTTTGATCAGCAGCCTACCCTGGCCATCCGGGCTTGGATCGCCAGCCACCACGTTAc  <  1:1366680/67‑1 (MQ=255) tCGATACCACGTTTGATCAGCAGCCTACCCTGGCCATCCGGGCTTGGATCGCCAGCCACCACGTTAc  <  1:1460989/67‑1 (MQ=255) tCGATACCACGTTTGATCAGCAGCCTACCCTGGCCATCCGGGCTTGGATCGCCAGCCACCACGTTAc  <  1:1526014/67‑1 (MQ=255) tCGATACCACGTTTGATCAGCAGCCTACCCTGGCCATCCGGGCTTGGATCGCCAGCCACCACGTTAc  <  1:1527683/67‑1 (MQ=255) tCGATACCACGTTTGATCAGCAGCCTACCCTGGCCATCCGGGCTTGGATCGCCAGCCACCACGTTAc  <  1:1582692/67‑1 (MQ=255) tCGATACCACGTTTGATCAGCAGCCTACCCTGGCCATCCGGGCTTGGATCGCCAGCCACCACGTTAc  <  1:1651451/67‑1 (MQ=255) tCGATACCACGTTTGATCAGCAGCCTACCCTGGCCATCCGGGCTTGGATCGCCAGCCACCACGTTAc  <  1:1113119/67‑1 (MQ=255) tCGATACCACGTTTGATCAGCAGCCTACCCTGGCCATCCGGGCTTGGATCGCCAGCCACCACGTTAc  <  1:1725178/67‑1 (MQ=255) tCGATACCACGTTTGATCAGCAGCCTACCCTGGCCATCCGGGCTTGGATCGCCAGCCACCACGTTAc  <  1:1768426/67‑1 (MQ=255) tCGATACCACGTTTGATCAGCAGCCTACCCTGGCCATCCGGGCTTGGATCGCCAGCCACCACGTTAc  <  1:1770574/67‑1 (MQ=255) tCGATACCACGTTTGATCAGCAGCCTACCCTGGCCATCCGGGCTTGGATCGCCAGCCACCACGTTAc  <  1:1818717/67‑1 (MQ=255) tCGATACCACGTTTGATCAGCAGCCTACCCTGGCCATCCGGGCTTGGATCGCCAGCCACCACGTTAc  <  1:19983/67‑1 (MQ=255) tCGATACCACGTTTGATCAGCAGCCTACCCTGGCCATCCGGGCTTGGATCGCCAGCCACCACGTTAc  <  1:2017498/67‑1 (MQ=255) tCGATACCACGTTTGATCAGCAGCCTACCCTGGCCATCCGGGCTTGGATCGCCAGCCACCACGTTAc  <  1:2063255/67‑1 (MQ=255) tCGATACCACGTTTGATCAGCAGCCTACCCTGGCCATCCGGGCTTGGAGCGCCAGCCACCACGTTAc  <  1:1788954/67‑1 (MQ=255) tCGATACCACGTTTGATCAGCAGCCTACCCTGGCCATCCCGGCTTGGATCGCCAGCCACCACGTTAc  <  1:1938005/67‑1 (MQ=255)  cGATACCACGTTTGATCAGCAGCCTACCCTGGCCATCCGGGCTTGGATCGCCAGCCACCACGTTAc  <  1:1874482/66‑1 (MQ=255)                                                                   | TCGATACCACGTTTGATCAGCAGCCTACCCTGGCCATCCGGGCTTGGATCGCCAGCCACCACGTTAC  >  minE/196372‑196438

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑