Missing coverage evidence...
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CGCCGCTGAAGCTCACCCGGTCGGGTTCCGCTGGGCGATGGAAGCCAAAATTCACAACGGCGCGAAG  >  minE/2333247‑2333313                                                                   | cgccgcTGAAGCTCACCCGGTCGGGTTCCGCTGGGCGATGGAAGCCAAAATTCACAACGGCGCGAAg  >  1:2097287/1‑67 (MQ=255) cgccgcTGAAGCTCACCCGGTCGGGTTCCGCTGGGCGATGGAAGCCAAAATTCACAACGGCGCGAAg  >  1:959339/1‑67 (MQ=255) cgccgcTGAAGCTCACCCGGTCGGGTTCCGCTGGGCGATGGAAGCCAAAATTCACAACGGCGCGAAg  >  1:895386/1‑67 (MQ=255) cgccgcTGAAGCTCACCCGGTCGGGTTCCGCTGGGCGATGGAAGCCAAAATTCACAACGGCGCGAAg  >  1:830474/1‑67 (MQ=255) cgccgcTGAAGCTCACCCGGTCGGGTTCCGCTGGGCGATGGAAGCCAAAATTCACAACGGCGCGAAg  >  1:790544/1‑67 (MQ=255) cgccgcTGAAGCTCACCCGGTCGGGTTCCGCTGGGCGATGGAAGCCAAAATTCACAACGGCGCGAAg  >  1:732250/1‑67 (MQ=255) cgccgcTGAAGCTCACCCGGTCGGGTTCCGCTGGGCGATGGAAGCCAAAATTCACAACGGCGCGAAg  >  1:65485/1‑67 (MQ=255) cgccgcTGAAGCTCACCCGGTCGGGTTCCGCTGGGCGATGGAAGCCAAAATTCACAACGGCGCGAAg  >  1:595605/1‑67 (MQ=255) cgccgcTGAAGCTCACCCGGTCGGGTTCCGCTGGGCGATGGAAGCCAAAATTCACAACGGCGCGAAg  >  1:526910/1‑67 (MQ=255) cgccgcTGAAGCTCACCCGGTCGGGTTCCGCTGGGCGATGGAAGCCAAAATTCACAACGGCGCGAAg  >  1:486360/1‑67 (MQ=255) cgccgcTGAAGCTCACCCGGTCGGGTTCCGCTGGGCGATGGAAGCCAAAATTCACAACGGCGCGAAg  >  1:41470/1‑67 (MQ=255) cgccgcTGAAGCTCACCCGGTCGGGTTCCGCTGGGCGATGGAAGCCAAAATTCACAACGGCGCGAAg  >  1:368189/1‑67 (MQ=255) cgccgcTGAAGCTCACCCGGTCGGGTTCCGCTGGGCGATGGAAGCCAAAATTCACAACGGCGCGAAg  >  1:302697/1‑67 (MQ=255) cgccgcTGAAGCTCACCCGGTCGGGTTCCGCTGGGCGATGGAAGCCAAAATTCACAACGGCGCGAAg  >  1:1026765/1‑67 (MQ=255) cgccgcTGAAGCTCACCCGGTCGGGTTCCGCTGGGCGATGGAAGCCAAAATTCACAACGGCGCGAAg  >  1:1911548/1‑67 (MQ=255) cgccgcTGAAGCTCACCCGGTCGGGTTCCGCTGGGCGATGGAAGCCAAAATTCACAACGGCGCGAAg  >  1:190147/1‑67 (MQ=255) cgccgcTGAAGCTCACCCGGTCGGGTTCCGCTGGGCGATGGAAGCCAAAATTCACAACGGCGCGAAg  >  1:1889523/1‑67 (MQ=255) cgccgcTGAAGCTCACCCGGTCGGGTTCCGCTGGGCGATGGAAGCCAAAATTCACAACGGCGCGAAg  >  1:1834113/1‑67 (MQ=255) cgccgcTGAAGCTCACCCGGTCGGGTTCCGCTGGGCGATGGAAGCCAAAATTCACAACGGCGCGAAg  >  1:1802768/1‑67 (MQ=255) cgccgcTGAAGCTCACCCGGTCGGGTTCCGCTGGGCGATGGAAGCCAAAATTCACAACGGCGCGAAg  >  1:1636006/1‑67 (MQ=255) cgccgcTGAAGCTCACCCGGTCGGGTTCCGCTGGGCGATGGAAGCCAAAATTCACAACGGCGCGAAg  >  1:1611201/1‑67 (MQ=255) cgccgcTGAAGCTCACCCGGTCGGGTTCCGCTGGGCGATGGAAGCCAAAATTCACAACGGCGCGAAg  >  1:1579358/1‑67 (MQ=255) cgccgcTGAAGCTCACCCGGTCGGGTTCCGCTGGGCGATGGAAGCCAAAATTCACAACGGCGCGAAg  >  1:1571687/1‑67 (MQ=255) cgccgcTGAAGCTCACCCGGTCGGGTTCCGCTGGGCGATGGAAGCCAAAATTCACAACGGCGCGAAg  >  1:1273914/1‑67 (MQ=255) cgccgcTGAAGCTCACCCGGTCGGGTTCCGCTGGGCGATGGAAGCCAAAATTCACAACGGCGCGAAg  >  1:1213705/1‑67 (MQ=255) cgccgcTGAAGCTCACCCGGTCGGGTTCCGCTGGGCGATGGAAGCCAAAATTCACAACGGCGCGAAg  >  1:1121024/1‑67 (MQ=255)                                                                   | CGCCGCTGAAGCTCACCCGGTCGGGTTCCGCTGGGCGATGGAAGCCAAAATTCACAACGGCGCGAAG  >  minE/2333247‑2333313

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑