Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	minE	2356587	2356617	31	51 [0]	[0] 2	[mobA]	[mobA]

CTTCATTCAGACGTTTACATTTCATAGTGATGCTCCTTACTCTTGAGACAGACACGTTAGCAGGGTC  >  minE/2356520‑2356586                                                                   | gttcattcaGACGTTTACATTTCATAGTGATGCTCCTTACTCTTGAGACAGACACGTTAGCAGGGTc  >  1:516925/2‑67 (MQ=255) cTTCATTCAGACTTTTACATTTCATAGTGATGCTCCTTACTCTTGAGACAGACACGTTAGCAGGGTc  >  1:1261269/1‑67 (MQ=255) cTTCATTCAGACGTTTACATTTCATAGTGATGCTCCTTACTCTTGAGACGGACACGTTAGCAGGGTc  >  1:1231983/1‑67 (MQ=255) cTTCATTCAGACGTTTACATTTCATAGTGATGCTCCTTACTCTTGAGACAGACACGTTAGCCGGGTc  >  1:87963/1‑67 (MQ=255) cTTCATTCAGACGTTTACATTTCATAGTGATGCTCCTTACTCTTGAGACAGACACGTTAGCAGGGTc  >  1:42050/1‑67 (MQ=255) cTTCATTCAGACGTTTACATTTCATAGTGATGCTCCTTACTCTTGAGACAGACACGTTAGCAGGGTc  >  1:1946252/1‑67 (MQ=255) cTTCATTCAGACGTTTACATTTCATAGTGATGCTCCTTACTCTTGAGACAGACACGTTAGCAGGGTc  >  1:1967397/1‑67 (MQ=255) cTTCATTCAGACGTTTACATTTCATAGTGATGCTCCTTACTCTTGAGACAGACACGTTAGCAGGGTc  >  1:2006502/1‑67 (MQ=255) cTTCATTCAGACGTTTACATTTCATAGTGATGCTCCTTACTCTTGAGACAGACACGTTAGCAGGGTc  >  1:2013977/1‑67 (MQ=255) cTTCATTCAGACGTTTACATTTCATAGTGATGCTCCTTACTCTTGAGACAGACACGTTAGCAGGGTc  >  1:2028384/1‑67 (MQ=255) cTTCATTCAGACGTTTACATTTCATAGTGATGCTCCTTACTCTTGAGACAGACACGTTAGCAGGGTc  >  1:2091935/1‑67 (MQ=255) cTTCATTCAGACGTTTACATTTCATAGTGATGCTCCTTACTCTTGAGACAGACACGTTAGCAGGGTc  >  1:2098437/1‑67 (MQ=255) cTTCATTCAGACGTTTACATTTCATAGTGATGCTCCTTACTCTTGAGACAGACACGTTAGCAGGGTc  >  1:235098/1‑67 (MQ=255) cTTCATTCAGACGTTTACATTTCATAGTGATGCTCCTTACTCTTGAGACAGACACGTTAGCAGGGTc  >  1:27215/1‑67 (MQ=255) cTTCATTCAGACGTTTACATTTCATAGTGATGCTCCTTACTCTTGAGACAGACACGTTAGCAGGGTc  >  1:304407/1‑67 (MQ=255) cTTCATTCAGACGTTTACATTTCATAGTGATGCTCCTTACTCTTGAGACAGACACGTTAGCAGGGTc  >  1:357079/1‑67 (MQ=255) cTTCATTCAGACGTTTACATTTCATAGTGATGCTCCTTACTCTTGAGACAGACACGTTAGCAGGGTc  >  1:380194/1‑67 (MQ=255) cTTCATTCAGACGTTTACATTTCATAGTGATGCTCCTTACTCTTGAGACAGACACGTTAGCAGGGTc  >  1:1802304/1‑67 (MQ=255) cTTCATTCAGACGTTTACATTTCATAGTGATGCTCCTTACTCTTGAGACAGACACGTTAGCAGGGTc  >  1:421221/1‑67 (MQ=255) cTTCATTCAGACGTTTACATTTCATAGTGATGCTCCTTACTCTTGAGACAGACACGTTAGCAGGGTc  >  1:429388/1‑67 (MQ=255) cTTCATTCAGACGTTTACATTTCATAGTGATGCTCCTTACTCTTGAGACAGACACGTTAGCAGGGTc  >  1:501374/1‑67 (MQ=255) cTTCATTCAGACGTTTACATTTCATAGTGATGCTCCTTACTCTTGAGACAGACACGTTAGCAGGGTc  >  1:560149/1‑67 (MQ=255) cTTCATTCAGACGTTTACATTTCATAGTGATGCTCCTTACTCTTGAGACAGACACGTTAGCAGGGTc  >  1:779450/1‑67 (MQ=255) cTTCATTCAGACGTTTACATTTCATAGTGATGCTCCTTACTCTTGAGACAGACACGTTAGCAGGGTc  >  1:849594/1‑67 (MQ=255) cTTCATTCAGACGTTTACATTTCATAGTGATGCTCCTTACTCTTGAGACAGACACGTTAGCAGGGTc  >  1:92210/1‑67 (MQ=255) cTTCATTCAGACGTTTACATTTCATAGTGATGCTCCTTACTCTTGAGACAGACACGTTAGCAGGGTc  >  1:991968/1‑67 (MQ=255) cTTCATTCAGACGTTTACATTTCATAGTGATGCTCCTTACTCTTGAGACAGACACGTTAGCAGGGTc  >  1:1430664/1‑67 (MQ=255) cTTCATTCAGACGTTTACATTTCATAGTGATGCTCCTTACTCTTGAGACAGACACGTTAGCAGGGTc  >  1:1055766/1‑67 (MQ=255) cTTCATTCAGACGTTTACATTTCATAGTGATGCTCCTTACTCTTGAGACAGACACGTTAGCAGGGTc  >  1:1084108/1‑67 (MQ=255) cTTCATTCAGACGTTTACATTTCATAGTGATGCTCCTTACTCTTGAGACAGACACGTTAGCAGGGTc  >  1:1106502/1‑67 (MQ=255) cTTCATTCAGACGTTTACATTTCATAGTGATGCTCCTTACTCTTGAGACAGACACGTTAGCAGGGTc  >  1:1108920/1‑67 (MQ=255) cTTCATTCAGACGTTTACATTTCATAGTGATGCTCCTTACTCTTGAGACAGACACGTTAGCAGGGTc  >  1:1124964/1‑67 (MQ=255) cTTCATTCAGACGTTTACATTTCATAGTGATGCTCCTTACTCTTGAGACAGACACGTTAGCAGGGTc  >  1:1221123/1‑67 (MQ=255) cTTCATTCAGACGTTTACATTTCATAGTGATGCTCCTTACTCTTGAGACAGACACGTTAGCAGGGTc  >  1:126061/1‑67 (MQ=255) cTTCATTCAGACGTTTACATTTCATAGTGATGCTCCTTACTCTTGAGACAGACACGTTAGCAGGGTc  >  1:1260879/1‑67 (MQ=255) cTTCATTCAGACGTTTACATTTCATAGTGATGCTCCTTACTCTTGAGACAGACACGTTAGCAGGGTc  >  1:1278073/1‑67 (MQ=255) cTTCATTCAGACGTTTACATTTCATAGTGATGCTCCTTACTCTTGAGACAGACACGTTAGCAGGGTc  >  1:1285770/1‑67 (MQ=255) cTTCATTCAGACGTTTACATTTCATAGTGATGCTCCTTACTCTTGAGACAGACACGTTAGCAGGGTc  >  1:1380186/1‑67 (MQ=255) cTTCATTCAGACGTTTACATTTCATAGTGATGCTCCTTACTCTTGAGACAGACACGTTAGCAGGGTc  >  1:1386381/1‑67 (MQ=255) cTTCATTCAGACGTTTACATTTCATAGTGATGCTCCTTACTCTTGAGACAGACACGTTAGCAGGGTc  >  1:1943133/1‑67 (MQ=255) cTTCATTCAGACGTTTACATTTCATAGTGATGCTCCTTACTCTTGAGACAGACACGTTAGCAGGGTc  >  1:1500040/1‑67 (MQ=255) cTTCATTCAGACGTTTACATTTCATAGTGATGCTCCTTACTCTTGAGACAGACACGTTAGCAGGGTc  >  1:1514673/1‑67 (MQ=255) cTTCATTCAGACGTTTACATTTCATAGTGATGCTCCTTACTCTTGAGACAGACACGTTAGCAGGGTc  >  1:1545661/1‑67 (MQ=255) cTTCATTCAGACGTTTACATTTCATAGTGATGCTCCTTACTCTTGAGACAGACACGTTAGCAGGGTc  >  1:1551317/1‑67 (MQ=255) cTTCATTCAGACGTTTACATTTCATAGTGATGCTCCTTACTCTTGAGACAGACACGTTAGCAGGGTc  >  1:1587605/1‑67 (MQ=255) cTTCATTCAGACGTTTACATTTCATAGTGATGCTCCTTACTCTTGAGACAGACACGTTAGCAGGGTc  >  1:161375/1‑67 (MQ=255) cTTCATTCAGACGTTTACATTTCATAGTGATGCTCCTTACTCTTGAGACAGACACGTTAGCAGGGTc  >  1:1717120/1‑67 (MQ=255) cTTCATTCAGACGTTTACATTTCATAGTGATGCTCCTTACTCTTGAGACAGACACGTTAGCAGGGTc  >  1:1740295/1‑67 (MQ=255) cTTCATTCAGACGTTTACATTTCATAGTGATGCTCCTTACTCTTGAGACAGACACGTTAGCAGGGTc  >  1:1756603/1‑67 (MQ=255) cTTCATTCAGACGTTTACATTTCATAGTGATGCTCCTTACTCTTGAGACAGACACGTTAGCAGGGTc  >  1:1013710/1‑67 (MQ=255) cTTCATTCAGACGTTTACATTTCATAGTGATGCTCCTTACTCTTGAGACAGACACATTAGCAGGGTc  >  1:243229/1‑67 (MQ=255)                                                                   | CTTCATTCAGACGTTTACATTTCATAGTGATGCTCCTTACTCTTGAGACAGACACGTTAGCAGGGTC  >  minE/2356520‑2356586

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑