Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	minE	2395398	2395405	8	33 [0]	[0] 15	rarD/yigG	predicted chloramphenical resistance permease/predicted inner membrane protein

AAATATATTCTGAAAAAATATGCCGACTCTTGCATGAGAGTGGGCATATTGCCATGCTGACCGGAGA  >  minE/2395331‑2395397                                                                   | aaatgTATTCTGAAAAAATATGCCGACTCTTGCATGAGAGTGGGCATATTGCCATGCTGACCGgaga  <  1:1122946/67‑1 (MQ=255) aaatgTATTCTGAAAAAATATGCCGACTCTTGCATGAGAGTGGGCATATTGCCATGCTGACCGgaga  <  1:1120462/67‑1 (MQ=255) aaataTATTCTGAAAAAATATGCCGACTCTTGCATGAGAGTGGGCATATTGCCATGCTGACCGgaga  <  1:2006329/67‑1 (MQ=255) aaataTATTCTGAAAAAATATGCCGACTCTTGCATGAGAGTGGGCATATTGCCATGCTGACCGgaga  <  1:967690/67‑1 (MQ=255) aaataTATTCTGAAAAAATATGCCGACTCTTGCATGAGAGTGGGCATATTGCCATGCTGACCGgaga  <  1:872154/67‑1 (MQ=255) aaataTATTCTGAAAAAATATGCCGACTCTTGCATGAGAGTGGGCATATTGCCATGCTGACCGgaga  <  1:834876/67‑1 (MQ=255) aaataTATTCTGAAAAAATATGCCGACTCTTGCATGAGAGTGGGCATATTGCCATGCTGACCGgaga  <  1:825511/67‑1 (MQ=255) aaataTATTCTGAAAAAATATGCCGACTCTTGCATGAGAGTGGGCATATTGCCATGCTGACCGgaga  <  1:778687/67‑1 (MQ=255) aaataTATTCTGAAAAAATATGCCGACTCTTGCATGAGAGTGGGCATATTGCCATGCTGACCGgaga  <  1:748072/67‑1 (MQ=255) aaataTATTCTGAAAAAATATGCCGACTCTTGCATGAGAGTGGGCATATTGCCATGCTGACCGgaga  <  1:560378/67‑1 (MQ=255) aaataTATTCTGAAAAAATATGCCGACTCTTGCATGAGAGTGGGCATATTGCCATGCTGACCGgaga  <  1:439718/67‑1 (MQ=255) aaataTATTCTGAAAAAATATGCCGACTCTTGCATGAGAGTGGGCATATTGCCATGCTGACCGgaga  <  1:420560/67‑1 (MQ=255) aaataTATTCTGAAAAAATATGCCGACTCTTGCATGAGAGTGGGCATATTGCCATGCTGACCGgaga  <  1:378446/67‑1 (MQ=255) aaataTATTCTGAAAAAATATGCCGACTCTTGCATGAGAGTGGGCATATTGCCATGCTGACCGgaga  <  1:344643/67‑1 (MQ=255) aaataTATTCTGAAAAAATATGCCGACTCTTGCATGAGAGTGGGCATATTGCCATGCTGACCGgaga  <  1:265728/67‑1 (MQ=255) aaataTATTCTGAAAAAATATGCCGACTCTTGCATGAGAGTGGGCATATTGCCATGCTGACCGgaga  <  1:2130941/67‑1 (MQ=255) aaataTATTCTGAAAAAATATGCCGACTCTTGCATGAGAGTGGGCATATTGCCATGCTGACCGgaga  <  1:1854943/67‑1 (MQ=255) aaataTATTCTGAAAAAATATGCCGACTCTTGCATGAGAGTGGGCATATTGCCATGCTGACCGgaga  <  1:1905810/67‑1 (MQ=255) aaataTATTCTGAAAAAATATGCCGACTCTTGCATGAGAGTGGGCATATTGCCATGCTGACCGgaga  <  1:185001/67‑1 (MQ=255) aaataTATTCTGAAAAAATATGCCGACTCTTGCATGAGAGTGGGCATATTGCCATGCTGACCGgaga  <  1:1782501/67‑1 (MQ=255) aaataTATTCTGAAAAAATATGCCGACTCTTGCATGAGAGTGGGCATATTGCCATGCTGACCGgaga  <  1:113678/67‑1 (MQ=255) aaataTATTCTGAAAAAATATGCCGACTCTTGCATGAGAGTGGGCATATTGCCATGCTGACCGgaga  <  1:1759307/67‑1 (MQ=255) aaataTATTCTGAAAAAATATGCCGACTCTTGCATGAGAGTGGGCATATTGCCATGCTGACCGgaga  <  1:1723442/67‑1 (MQ=255) aaataTATTCTGAAAAAATATGCCGACTCTTGCATGAGAGTGGGCATATTGCCATGCTGACCGgaga  <  1:1581002/67‑1 (MQ=255) aaataTATTCTGAAAAAATATGCCGACTCTTGCATGAGAGTGGGCATATTGCCATGCTGACCGgaga  <  1:1411879/67‑1 (MQ=255) aaataTATTCTGAAAAAATATGCCGACTCTTGCATGAGAGTGGGCATATTGCCATGCTGACCGgaga  <  1:1360984/67‑1 (MQ=255) aaataTATTCTGAAAAAATATGCCGACTCTTGCATGAGAGTGGGCATATTGCCATGCTGACCGgaga  <  1:1314704/67‑1 (MQ=255)  aataTATTCTTAAAAAATATGCCGACTCTTGCATGAGAGTGGGCATATTGCCATGCTGACCGgaga  <  1:1284406/66‑1 (MQ=255)  aataTATTCTGAAAAAATATGCCGACTCTTGCATGAGAGTGGGCATATTGCCATGCTGACCGgaga  <  1:993632/66‑1 (MQ=255)                aaaTATGCCGACTCTTGCATGAGAGTGGGCATATTGCCATGCTGACCGgaga  <  1:938388/52‑1 (MQ=255)                aaaTATGCCGACTCTTGCATGAGAGTGGGCATATTGCCATGCTGACCGgaga  <  1:2151863/52‑1 (MQ=255)                  atatGCCGACTCTTGCATGAGAGTGGGCATATTGCCATGCTGACCGgaga  <  1:1773465/50‑1 (MQ=255)                         gACTCTTGCATGAGAGTGGGCATATTGCCATGCTGACCGgaga  <  1:1638425/43‑1 (MQ=255)                                                                   | AAATATATTCTGAAAAAATATGCCGACTCTTGCATGAGAGTGGGCATATTGCCATGCTGACCGGAGA  >  minE/2395331‑2395397

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑