Missing coverage evidence...
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GCAGGGTTATCGGGCTAAGCTGGCGCTCCACGCTCAGATAACGTAGGTAGCGTTCTACATCGGTGT  >  minE/2402248‑2402313                                                                  | gCAGGGTTATCGGGCTAAGCTGGCGCTCCACGCTCAGATAACTTAGGTAGCGTTCTACATCGgtgt  >  1:1156570/1‑66 (MQ=255) gCAGGGTTATCGGGCTAAGCTGGCGCTCCACGCTCAGATAACGTAGGTAGCGTTCTACATCGgtgt  >  1:2093703/1‑66 (MQ=255) gCAGGGTTATCGGGCTAAGCTGGCGCTCCACGCTCAGATAACGTAGGTAGCGTTCTACATCGgtgt  >  1:999801/1‑66 (MQ=255) gCAGGGTTATCGGGCTAAGCTGGCGCTCCACGCTCAGATAACGTAGGTAGCGTTCTACATCGgtgt  >  1:958111/1‑66 (MQ=255) gCAGGGTTATCGGGCTAAGCTGGCGCTCCACGCTCAGATAACGTAGGTAGCGTTCTACATCGgtgt  >  1:914027/1‑66 (MQ=255) gCAGGGTTATCGGGCTAAGCTGGCGCTCCACGCTCAGATAACGTAGGTAGCGTTCTACATCGgtgt  >  1:821973/1‑66 (MQ=255) gCAGGGTTATCGGGCTAAGCTGGCGCTCCACGCTCAGATAACGTAGGTAGCGTTCTACATCGgtgt  >  1:767142/1‑66 (MQ=255) gCAGGGTTATCGGGCTAAGCTGGCGCTCCACGCTCAGATAACGTAGGTAGCGTTCTACATCGgtgt  >  1:722696/1‑66 (MQ=255) gCAGGGTTATCGGGCTAAGCTGGCGCTCCACGCTCAGATAACGTAGGTAGCGTTCTACATCGgtgt  >  1:720277/1‑66 (MQ=255) gCAGGGTTATCGGGCTAAGCTGGCGCTCCACGCTCAGATAACGTAGGTAGCGTTCTACATCGgtgt  >  1:70042/1‑66 (MQ=255) gCAGGGTTATCGGGCTAAGCTGGCGCTCCACGCTCAGATAACGTAGGTAGCGTTCTACATCGgtgt  >  1:502731/1‑66 (MQ=255) gCAGGGTTATCGGGCTAAGCTGGCGCTCCACGCTCAGATAACGTAGGTAGCGTTCTACATCGgtgt  >  1:491942/1‑66 (MQ=255) gCAGGGTTATCGGGCTAAGCTGGCGCTCCACGCTCAGATAACGTAGGTAGCGTTCTACATCGgtgt  >  1:268473/1‑66 (MQ=255) gCAGGGTTATCGGGCTAAGCTGGCGCTCCACGCTCAGATAACGTAGGTAGCGTTCTACATCGgtgt  >  1:267507/1‑66 (MQ=255) gCAGGGTTATCGGGCTAAGCTGGCGCTCCACGCTCAGATAACGTAGGTAGCGTTCTACATCGgtgt  >  1:23003/1‑66 (MQ=255) gCAGGGTTATCGGGCTAAGCTGGCGCTCCACGCTCAGATAACGTAGGTAGCGTTCTACATCGgtgt  >  1:2119372/1‑66 (MQ=255) gCAGGGTTATCGGGCTAAGCTGGCGCTCCACGCTCAGATAACGTAGGTAGCGTTCTACATCGgtgt  >  1:1019236/1‑66 (MQ=255) gCAGGGTTATCGGGCTAAGCTGGCGCTCCACGCTCAGATAACGTAGGTAGCGTTCTACATCGgtgt  >  1:2084827/1‑66 (MQ=255) gCAGGGTTATCGGGCTAAGCTGGCGCTCCACGCTCAGATAACGTAGGTAGCGTTCTACATCGgtgt  >  1:1811366/1‑66 (MQ=255) gCAGGGTTATCGGGCTAAGCTGGCGCTCCACGCTCAGATAACGTAGGTAGCGTTCTACATCGgtgt  >  1:1795060/1‑66 (MQ=255) gCAGGGTTATCGGGCTAAGCTGGCGCTCCACGCTCAGATAACGTAGGTAGCGTTCTACATCGgtgt  >  1:1786822/1‑66 (MQ=255) gCAGGGTTATCGGGCTAAGCTGGCGCTCCACGCTCAGATAACGTAGGTAGCGTTCTACATCGgtgt  >  1:1774648/1‑66 (MQ=255) gCAGGGTTATCGGGCTAAGCTGGCGCTCCACGCTCAGATAACGTAGGTAGCGTTCTACATCGgtgt  >  1:1716034/1‑66 (MQ=255) gCAGGGTTATCGGGCTAAGCTGGCGCTCCACGCTCAGATAACGTAGGTAGCGTTCTACATCGgtgt  >  1:168795/1‑66 (MQ=255) gCAGGGTTATCGGGCTAAGCTGGCGCTCCACGCTCAGATAACGTAGGTAGCGTTCTACATCGgtgt  >  1:1606225/1‑66 (MQ=255) gCAGGGTTATCGGGCTAAGCTGGCGCTCCACGCTCAGATAACGTAGGTAGCGTTCTACATCGgtgt  >  1:1604225/1‑66 (MQ=255) gCAGGGTTATCGGGCTAAGCTGGCGCTCCACGCTCAGATAACGTAGGTAGCGTTCTACATCGgtgt  >  1:1596798/1‑66 (MQ=255) gCAGGGTTATCGGGCTAAGCTGGCGCTCCACGCTCAGATAACGTAGGTAGCGTTCTACATCGgtgt  >  1:1532364/1‑66 (MQ=255) gCAGGGTTATCGGGCTAAGCTGGCGCTCCACGCTCAGATAACGTAGGTAGCGTTCTACATCGgtgt  >  1:1100924/1‑66 (MQ=255) gCAGGGTTATCGGGCTAAGCTGGCGCTCCACGCTCAGATAACGTAGGTAGCGTTCTACATCGgtgt  >  1:1090027/1‑66 (MQ=255) gCAGGGTTATCGGGCTAAGCTGGCGCTCCACGCTCAGATAACGTAGGTAGCGTTCTACATCGgtgt  >  1:105647/1‑66 (MQ=255) gCAGGGTTATCGGGCTAAGCTGGCGCTACACGCTCAGATAACGTAGGTAGCGTTCTACATCGgtgt  >  1:921442/1‑66 (MQ=255)                                                                  | GCAGGGTTATCGGGCTAAGCTGGCGCTCCACGCTCAGATAACGTAGGTAGCGTTCTACATCGGTGT  >  minE/2402248‑2402313

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑