Missing coverage evidence...
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CAGGTCTGCCCCCCAGATATGCCAGAAAAACTGGCTGGGCTTAATGCCACCACTCAGCAG  >  minE/2420750‑2420809                                                            | cAGGTCTGCCCCCCAGATATGCCAGAAAAACTGGCTGGGCTTAATGCCACCACTcagcag  <  1:35053/60‑1 (MQ=255) cAGGTCTGCCCCCCAGATATGCCAGAAAAACTGGCTGGGCTTAATGCCACCACTcagcag  <  1:941592/60‑1 (MQ=255) cAGGTCTGCCCCCCAGATATGCCAGAAAAACTGGCTGGGCTTAATGCCACCACTcagcag  <  1:850898/60‑1 (MQ=255) cAGGTCTGCCCCCCAGATATGCCAGAAAAACTGGCTGGGCTTAATGCCACCACTcagcag  <  1:619243/60‑1 (MQ=255) cAGGTCTGCCCCCCAGATATGCCAGAAAAACTGGCTGGGCTTAATGCCACCACTcagcag  <  1:416798/60‑1 (MQ=255) cAGGTCTGCCCCCCAGATATGCCAGAAAAACTGGCTGGGCTTAATGCCACCACTcagcag  <  1:376140/60‑1 (MQ=255) cAGGTCTGCCCCCCAGATATGCCAGAAAAACTGGCTGGGCTTAATGCCACCACTcagcag  <  1:100771/60‑1 (MQ=255) cAGGTCTGCCCCCCAGATATGCCAGAAAAACTGGCTGGGCTTAATGCCACCACTcagcag  <  1:250369/60‑1 (MQ=255) cAGGTCTGCCCCCCAGATATGCCAGAAAAACTGGCTGGGCTTAATGCCACCACTcagcag  <  1:233306/60‑1 (MQ=255) cAGGTCTGCCCCCCAGATATGCCAGAAAAACTGGCTGGGCTTAATGCCACCACTcagcag  <  1:2039177/60‑1 (MQ=255) cAGGTCTGCCCCCCAGATATGCCAGAAAAACTGGCTGGGCTTAATGCCACCACTcagcag  <  1:1812527/60‑1 (MQ=255) cAGGTCTGCCCCCCAGATATGCCAGAAAAACTGGCTGGGCTTAATGCCACCACTcagcag  <  1:1728582/60‑1 (MQ=255) cAGGTCTGCCCCCCAGATATGCCAGAAAAACTGGCTGGGCTTAATGCCACCACTcagcag  <  1:1320414/60‑1 (MQ=255) cAGGTCTGCCCCCCAGATATGCCAGAAAAACTGGCTGGGCTTAATGCCACCACTcagcag  <  1:1047830/60‑1 (MQ=255) cAGGGCTGCCCCCCAGATATGCCAGAAAAACTGGCTGGGCTTAATGCCACCACTcagcag  <  1:450269/60‑1 (MQ=255)       tGCCCCCCAGATATGCCAGAAAAACTGGCTGGGCTTAATGCCACCACTcagcag  <  1:39133/54‑1 (MQ=255)              cAGATATGCCAGAAAAACTGGCTGGGCTTAATGCCACCACTcagcag  <  1:701547/47‑1 (MQ=255)                                                            | CAGGTCTGCCCCCCAGATATGCCAGAAAAACTGGCTGGGCTTAATGCCACCACTCAGCAG  >  minE/2420750‑2420809

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑