Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	minE	2444484	2444491	8	24 [0]	[0] 5	ilvD	dihydroxyacid dehydratase

GCATTAAGGAACAGCTGCTTACGGTCGGCGTGGGTTGCCAGCAGCGAGCCGT  >  minE/2444432‑2444483                                                    | gCATTAAGGAACAGCTGCTTACGGTCGGCGTGGGTTGCCAGCAGCGAGCCGt  <  1:1865313/52‑1 (MQ=255) gCATTAAGGAACAGCTGCTTACGGTCGGCGTGGGTTGCCAGCAGCGAGCCGt  <  1:969518/52‑1 (MQ=255) gCATTAAGGAACAGCTGCTTACGGTCGGCGTGGGTTGCCAGCAGCGAGCCGt  <  1:964989/52‑1 (MQ=255) gCATTAAGGAACAGCTGCTTACGGTCGGCGTGGGTTGCCAGCAGCGAGCCGt  <  1:938252/52‑1 (MQ=255) gCATTAAGGAACAGCTGCTTACGGTCGGCGTGGGTTGCCAGCAGCGAGCCGt  <  1:774903/52‑1 (MQ=255) gCATTAAGGAACAGCTGCTTACGGTCGGCGTGGGTTGCCAGCAGCGAGCCGt  <  1:751198/52‑1 (MQ=255) gCATTAAGGAACAGCTGCTTACGGTCGGCGTGGGTTGCCAGCAGCGAGCCGt  <  1:691693/52‑1 (MQ=255) gCATTAAGGAACAGCTGCTTACGGTCGGCGTGGGTTGCCAGCAGCGAGCCGt  <  1:487251/52‑1 (MQ=255) gCATTAAGGAACAGCTGCTTACGGTCGGCGTGGGTTGCCAGCAGCGAGCCGt  <  1:354267/52‑1 (MQ=255) gCATTAAGGAACAGCTGCTTACGGTCGGCGTGGGTTGCCAGCAGCGAGCCGt  <  1:330402/52‑1 (MQ=255) gCATTAAGGAACAGCTGCTTACGGTCGGCGTGGGTTGCCAGCAGCGAGCCGt  <  1:304929/52‑1 (MQ=255) gCATTAAGGAACAGCTGCTTACGGTCGGCGTGGGTTGCCAGCAGCGAGCCGt  <  1:1024099/52‑1 (MQ=255) gCATTAAGGAACAGCTGCTTACGGTCGGCGTGGGTTGCCAGCAGCGAGCCGt  <  1:1775238/52‑1 (MQ=255) gCATTAAGGAACAGCTGCTTACGGTCGGCGTGGGTTGCCAGCAGCGAGCCGt  <  1:1706652/52‑1 (MQ=255) gCATTAAGGAACAGCTGCTTACGGTCGGCGTGGGTTGCCAGCAGCGAGCCGt  <  1:1619497/52‑1 (MQ=255) gCATTAAGGAACAGCTGCTTACGGTCGGCGTGGGTTGCCAGCAGCGAGCCGt  <  1:1222116/52‑1 (MQ=255) gCATTAAGGAACAGCTGCTTACGGTCGGCGTGGGTTGCCAGCAGCGAGCCGt  <  1:1206211/52‑1 (MQ=255) gCATTAAGGAACAGCTGCTTACGGTCGGCGTGGGTTGCCAGCAGCGAGCCGt  <  1:1175661/52‑1 (MQ=255) gCATTAAGGAACAGCTGCTTACGGTCGGCGTGGGTTGCCAGCAGCGAGCCGt  <  1:1173177/52‑1 (MQ=255) gCATTAAGGAACAGCTGCTTACGGTCGGCGTGGGTTGCCAGCAGCGAGCCGt  <  1:1170290/52‑1 (MQ=255) gCATTAAGGAACAGCTGCTTACGGTCGGCGTGGGTTGCCAGCAGCGAGCCGt  <  1:1120944/52‑1 (MQ=255) gCATTAAGGAACAGCTGCTTACGGTCGGCGTGGGTTGCCAGCAGCGAGCCGt  <  1:1115888/52‑1 (MQ=255) gCATTAAGGAACAGCTGCTTACGGTCGGCGTGGGTTGCCAGCAGCGAGCCGt  <  1:1072124/52‑1 (MQ=255)                tgctTACGGTCGGCGTGGGTTGCCAGCAGCGAGCCGt  <  1:517554/37‑1 (MQ=255)                                                    | GCATTAAGGAACAGCTGCTTACGGTCGGCGTGGGTTGCCAGCAGCGAGCCGT  >  minE/2444432‑2444483

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑