Missing coverage evidence... | ||||||||||
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seq id | start | end | size | ←reads | reads→ | gene | description | |||
* | * | ÷ | minE | 2447583 | 2447598 | 16 | 44 [1] | [0] 14 | ilvG | Mutation in protein compared to W3110: p.Glu327_Ilefs*223 Restoration of IlvG found in MG1655 (548 amino acids), fusion of N‑ter and C‑ter fragments ECK3760:JW3740+JW3741:b4488; large subunit of acetolactate synthase II |
AGTCACTTCGTTTTCAACGGTGGTGAACCACGGTTCCAGGTCACCGCTGGCTAACTGGATATCTTTTGGGATAT > minE/2447516‑2447589 | aGTCACTTCGTTTTCAACGGTGGTGAACCACGGTTCCAGGTCACCGCTGGCTAACTGGATATCtttt < 1:461559/67‑1 (MQ=255) aGTCACTTCGTTTTCAACGGTGGTGAACCACGGTTCCAGGTCACCGCTGGCTAACTGGATATCtttt < 1:198107/67‑1 (MQ=255) aGTCACTTCGTTTTCAACGGTGGTGAACCACGGTTCCAGGTCACCGCTGGCTAACTGGATATCtttt < 1:2006143/67‑1 (MQ=255) aGTCACTTCGTTTTCAACGGTGGTGAACCACGGTTCCAGGTCACCGCTGGCTAACTGGATATCtttt < 1:2013793/67‑1 (MQ=255) aGTCACTTCGTTTTCAACGGTGGTGAACCACGGTTCCAGGTCACCGCTGGCTAACTGGATATCtttt < 1:2132046/67‑1 (MQ=255) aGTCACTTCGTTTTCAACGGTGGTGAACCACGGTTCCAGGTCACCGCTGGCTAACTGGATATCtttt < 1:2133066/67‑1 (MQ=255) aGTCACTTCGTTTTCAACGGTGGTGAACCACGGTTCCAGGTCACCGCTGGCTAACTGGATATCtttt < 1:2144984/67‑1 (MQ=255) aGTCACTTCGTTTTCAACGGTGGTGAACCACGGTTCCAGGTCACCGCTGGCTAACTGGATATCtttt < 1:243748/67‑1 (MQ=255) aGTCACTTCGTTTTCAACGGTGGTGAACCACGGTTCCAGGTCACCGCTGGCTAACTGGATATCtttt < 1:349149/67‑1 (MQ=255) aGTCACTTCGTTTTCAACGGTGGTGAACCACGGTTCCAGGTCACCGCTGGCTAACTGGATATCtttt < 1:362826/67‑1 (MQ=255) aGTCACTTCGTTTTCAACGGTGGTGAACCACGGTTCCAGGTCACCGCTGGCTAACTGGATATCtttt < 1:394506/67‑1 (MQ=255) aGTCACTTCGTTTTCAACGGTGGTGAACCACGGTTCCAGGTCACCGCTGGCTAACTGGATATCtttt < 1:1106352/67‑1 (MQ=255) aGTCACTTCGTTTTCAACGGTGGTGAACCACGGTTCCAGGTCACCGCTGGCTAACTGGATATCtttt < 1:49251/67‑1 (MQ=255) aGTCACTTCGTTTTCAACGGTGGTGAACCACGGTTCCAGGTCACCGCTGGCTAACTGGATATCtttt < 1:609064/67‑1 (MQ=255) aGTCACTTCGTTTTCAACGGTGGTGAACCACGGTTCCAGGTCACCGCTGGCTAACTGGATATCtttt < 1:631385/67‑1 (MQ=255) aGTCACTTCGTTTTCAACGGTGGTGAACCACGGTTCCAGGTCACCGCTGGCTAACTGGATATCtttt < 1:688560/67‑1 (MQ=255) aGTCACTTCGTTTTCAACGGTGGTGAACCACGGTTCCAGGTCACCGCTGGCTAACTGGATATCtttt < 1:692029/67‑1 (MQ=255) aGTCACTTCGTTTTCAACGGTGGTGAACCACGGTTCCAGGTCACCGCTGGCTAACTGGATATCtttt < 1:75981/67‑1 (MQ=255) aGTCACTTCGTTTTCAACGGTGGTGAACCACGGTTCCAGGTCACCGCTGGCTAACTGGATATCtttt < 1:810251/67‑1 (MQ=255) aGTCACTTCGTTTTCAACGGTGGTGAACCACGGTTCCAGGTCACCGCTGGCTAACTGGATATCtttt < 1:846502/67‑1 (MQ=255) aGTCACTTCGTTTTCAACGGTGGTGAACCACGGTTCCAGGTCACCGCTGGCTAACTGGATATCtttt < 1:8804/67‑1 (MQ=255) aGTCACTTCGTTTTCAACGGTGGTGAACCACGGTTCCAGGTCACCGCTGGCTAACTGGATATCtttt < 1:1550649/67‑1 (MQ=255) aGTCACTTCGTTTTCAACGGTGGTGAACCACGGTTCCAGGTCACCGCTGGCTAACTGGATATCtttt < 1:1048239/67‑1 (MQ=255) aGTCACTTCGTTTTCAACGGTGGTGAACCACGGTTCCAGGTCACCGCTGGCTAACTGGATATCtttt < 1:1136395/67‑1 (MQ=255) aGTCACTTCGTTTTCAACGGTGGTGAACCACGGTTCCAGGTCACCGCTGGCTAACTGGATATCtttt < 1:1211185/67‑1 (MQ=255) aGTCACTTCGTTTTCAACGGTGGTGAACCACGGTTCCAGGTCACCGCTGGCTAACTGGATATCtttt < 1:1222227/67‑1 (MQ=255) aGTCACTTCGTTTTCAACGGTGGTGAACCACGGTTCCAGGTCACCGCTGGCTAACTGGATATCtttt < 1:1278763/67‑1 (MQ=255) aGTCACTTCGTTTTCAACGGTGGTGAACCACGGTTCCAGGTCACCGCTGGCTAACTGGATATCtttt < 1:131103/67‑1 (MQ=255) aGTCACTTCGTTTTCAACGGTGGTGAACCACGGTTCCAGGTCACCGCTGGCTAACTGGATATCtttt < 1:1324544/67‑1 (MQ=255) aGTCACTTCGTTTTCAACGGTGGTGAACCACGGTTCCAGGTCACCGCTGGCTAACTGGATATCtttt < 1:1514361/67‑1 (MQ=255) aGTCACTTCGTTTTCAACGGTGGTGAACCACGGTTCCAGGTCACCGCTGGCTAACTGGATATCtttt < 1:1542281/67‑1 (MQ=255) aGTCACTTCGTTTTCAACGGTGGTGAACCACGGTTCCAGGTCACCGCTGGCTAACTGGATATCtttt < 1:1611454/67‑1 (MQ=255) aGTCACTTCGTTTTCAACGGTGGTGAACCACGGTTCCAGGTCACCGCTGGCTAACTGGATATCtttt < 1:1707798/67‑1 (MQ=255) aGTCACTTCGTTTTCAACGGTGGTGAACCACGGTTCCAGGTCACCGCTGGCTAACTGGATATCtttt < 1:170814/67‑1 (MQ=255) aGTCACTTCGTTTTCAACGGTGGTGAACCACGGTTCCAGGTCACCGCTGGCTAACTGGATATCtttt < 1:1723997/67‑1 (MQ=255) aGTCACTTCGTTTTCAACGGTGGTGAACCACGGTTCCAGGTCACCGCTGGCTAACTGGATATCtttt < 1:1725843/67‑1 (MQ=255) aGTCACTTCGTTTTCAACGGTGGTGAACCACGGTTCCAGGTCACCGCTGGCTAACTGGATATCtttt < 1:1743339/67‑1 (MQ=255) aGTCACTTCGTTTTCAACGGTGGTGAACCACGGTTCCAGGTCACCGCTGGCTAACTGGATATCtttt < 1:1843630/67‑1 (MQ=255) aGTCACTTCGTTTTCAACGGTGGTGAACCACGGTTCCAGGTCACCGCTGGCTAACTGGATATCtttt < 1:1948990/67‑1 (MQ=255) aGTCACTTCGTTTTCAACGGTGGTGAACAACGGTTCCAGGTCACCGCTGGCTAACTGGATATCtttt < 1:1746857/67‑1 (MQ=255) aGTCACTTCGTTTTCAACGGCGGTGAACCACGGTTCCAGGTCACCGCTGGCTAACTGGATATCtttt < 1:498599/67‑1 (MQ=255) gTCACTTCGTTTTCAACGGTGGTGAACCACGGTTCCAGGTCACCGCTGTCTAACTGGATATCtttt < 1:1751334/66‑1 (MQ=255) tCGTTTTCAACGGTGGTGAACCACGGTTCCAGGTCACCGCTGGCTAACTGGATATCTTTTGGGatat < 1:928821/67‑1 (MQ=255) gTTCCAGGTCACCGCTGGCTAACTGTATATCtttt < 1:1869448/35‑1 (MQ=255) | AGTCACTTCGTTTTCAACGGTGGTGAACCACGGTTCCAGGTCACCGCTGGCTAACTGGATATCTTTTGGGATAT > minE/2447516‑2447589 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |