Missing coverage evidence...
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AACACGGCTGAGGAAAAAACGGTTAAGCAGCGACTCGCTATTTTCTCGTGGTTTATCCGAAGCTGCG  >  minE/2482240‑2482306                                                                   | aacaCGGCTGAGGAAAAAACGGTTAAGCAGCGACTCGCTATTTTCTCTTGGTTTATCCGAAGCTGCg  >  1:1742108/1‑67 (MQ=255) aacaCGGCTGAGGAAAAAACGGTTAAGCAGCGACTCGCTATTTTCTCGTGGTTTATCCGAAGCTGCg  >  1:1075654/1‑67 (MQ=255) aacaCGGCTGAGGAAAAAACGGTTAAGCAGCGACTCGCTATTTTCTCGTGGTTTATCCGAAGCTGCg  >  1:888383/1‑67 (MQ=255) aacaCGGCTGAGGAAAAAACGGTTAAGCAGCGACTCGCTATTTTCTCGTGGTTTATCCGAAGCTGCg  >  1:669092/1‑67 (MQ=255) aacaCGGCTGAGGAAAAAACGGTTAAGCAGCGACTCGCTATTTTCTCGTGGTTTATCCGAAGCTGCg  >  1:664707/1‑67 (MQ=255) aacaCGGCTGAGGAAAAAACGGTTAAGCAGCGACTCGCTATTTTCTCGTGGTTTATCCGAAGCTGCg  >  1:64779/1‑67 (MQ=255) aacaCGGCTGAGGAAAAAACGGTTAAGCAGCGACTCGCTATTTTCTCGTGGTTTATCCGAAGCTGCg  >  1:541032/1‑67 (MQ=255) aacaCGGCTGAGGAAAAAACGGTTAAGCAGCGACTCGCTATTTTCTCGTGGTTTATCCGAAGCTGCg  >  1:501180/1‑67 (MQ=255) aacaCGGCTGAGGAAAAAACGGTTAAGCAGCGACTCGCTATTTTCTCGTGGTTTATCCGAAGCTGCg  >  1:279582/1‑67 (MQ=255) aacaCGGCTGAGGAAAAAACGGTTAAGCAGCGACTCGCTATTTTCTCGTGGTTTATCCGAAGCTGCg  >  1:235239/1‑67 (MQ=255) aacaCGGCTGAGGAAAAAACGGTTAAGCAGCGACTCGCTATTTTCTCGTGGTTTATCCGAAGCTGCg  >  1:2126272/1‑67 (MQ=255) aacaCGGCTGAGGAAAAAACGGTTAAGCAGCGACTCGCTATTTTCTCGTGGTTTATCCGAAGCTGCg  >  1:2063172/1‑67 (MQ=255) aacaCGGCTGAGGAAAAAACGGTTAAGCAGCGACTCGCTATTTTCTCGTGGTTTATCCGAAGCTGCg  >  1:2044124/1‑67 (MQ=255) aacaCGGCTGAGGAAAAAACGGTTAAGCAGCGACTCGCTATTTTCTCGTGGTTTATCCGAAGCTGCg  >  1:2032715/1‑67 (MQ=255) aacaCGGCTGAGGAAAAAACGGTTAAGCAGCGACTCGCTATTTTCTCGTGGTTTATCCGAAGCTGCg  >  1:1972723/1‑67 (MQ=255) aacaCGGCTGAGGAAAAAACGGTTAAGCAGCGACTCGCTATTTTCTCGTGGTTTATCCGAAGCTGCg  >  1:1947439/1‑67 (MQ=255) aacaCGGCTGAGGAAAAAACGGTTAAGCAGCGACTCGCTATTTTCTCGTGGTTTATCCGAAGCTGCg  >  1:1617434/1‑67 (MQ=255) aacaCGGCTGAGGAAAAAACGGTTAAGCAGCGACTCGCTATTTTCTCGTGGTTTATCCGAAGCTGCg  >  1:1547154/1‑67 (MQ=255) aacaCGGCTGAGGAAAAAACGGTTAAGCAGCGACTCGCTATTTTCTCGTGGTTTATCCGAAGCTGCg  >  1:1491545/1‑67 (MQ=255) aacaCGGCTGAGGAAAAAACGGTTAAGCAGCGACTCGCTATTTTCTCGTGGTTTATCCGAAGCTGCg  >  1:1483736/1‑67 (MQ=255) aacaCGGCTGAGGAAAAAACGGTTAAGCAGCGACTCGCTATTTTCTCGTGGTTTATCCGAAGCTGCg  >  1:1469505/1‑67 (MQ=255) aacaCGGCTGAGGAAAAAACGGTTAAGCAGCGACTCGCTATTTTCTCGTGGTTTATCCGAAGCTGCg  >  1:1457084/1‑67 (MQ=255) aacaCGGCTGAGGAAAAAACGGTTAAGCAGCGACTCGCTATTTTCTCGTGGTTTATCCGAAGCTGCg  >  1:1445593/1‑67 (MQ=255) aacaCGGCTGAGGAAAAAACGGTTAAGCAGCGACTCGCTATTTTCTCGTGGTTTATCCGAAGCTGCg  >  1:1431392/1‑67 (MQ=255) aacaCGGCTGAGGAAAAAACGGTTAAGCAGCGACTCGCTATTTTCTCGTGGTTTATCCGAAGCTGCg  >  1:1371532/1‑67 (MQ=255) aacaCGGCTGAGGAAAAAACGGTTAAGCAGCGACTCGCTATTTTCTCGTGGTTTATCCGAAGCTGCg  >  1:1221935/1‑67 (MQ=255) aacaCGGCTGAGGAAAAAACGGTTAAGCAGCGACTCGCTATTTTCTCGTGGTTTATCCGAAGCTGCg  >  1:1196962/1‑67 (MQ=255) aacaCGGCTGAGGAAAAAACGGTTAAGCAGCGACTCGCTATTTTCTCGTGGTTTATCCGAAGCTGCg  >  1:1101212/1‑67 (MQ=255) aacaCGGCTGAGGAAAAAACGGTTAAGCAGCGACTCGCTATTTTCTCGTGGTTTATCCGAAGCTGCg  >  1:110075/1‑67 (MQ=255) aacaCGGCTGAGGAAAAAACGGTTAAGCAGCGACTCGCTATTTTCTCGTGGTTTATCCGAAGCTGCg  >  1:1000937/1‑67 (MQ=255) aacaCGGCTGAGGAAAAAACGGTTAAGCAGCGACTCGCTATTTTCTCGTGGTTTATCCGAAGATGCg  >  1:960701/1‑67 (MQ=255)                                                                   | AACACGGCTGAGGAAAAAACGGTTAAGCAGCGACTCGCTATTTTCTCGTGGTTTATCCGAAGCTGCG  >  minE/2482240‑2482306

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑