Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	minE	2517890	2517939	50	53 [0]	[0] 6	spoT	bifunctional (p)ppGpp synthetase II and guanosine‑3',5'‑bis pyrophosphate 3'‑pyrophosphohydrolase

CGATATCGGTATGCACTGCATAAGCGAAGTCGACGGGCGTTGCACCGGCAGGCAGCTCGACAATGCG  >  minE/2517823‑2517889                                                                   | cgttatCGGTATGCACTGCATAAGCGAAGTCGACGGGCGTTGCACCGGCAGGCAGCTCGACAATgcg  >  1:934813/4‑67 (MQ=255) cGATATCGGTATGCACTGCATAAGCGAAGTCGACGGGCGTTGCACCGGCAGGCAGCTCGACAATgcg  >  1:605952/1‑67 (MQ=255) cGATATCGGTATGCACTGCATAAGCGAAGTCGACGGGCGTTGCACCGGCAGGCAGCTCGACAATgcg  >  1:219832/1‑67 (MQ=255) cGATATCGGTATGCACTGCATAAGCGAAGTCGACGGGCGTTGCACCGGCAGGCAGCTCGACAATgcg  >  1:265442/1‑67 (MQ=255) cGATATCGGTATGCACTGCATAAGCGAAGTCGACGGGCGTTGCACCGGCAGGCAGCTCGACAATgcg  >  1:270868/1‑67 (MQ=255) cGATATCGGTATGCACTGCATAAGCGAAGTCGACGGGCGTTGCACCGGCAGGCAGCTCGACAATgcg  >  1:292883/1‑67 (MQ=255) cGATATCGGTATGCACTGCATAAGCGAAGTCGACGGGCGTTGCACCGGCAGGCAGCTCGACAATgcg  >  1:316514/1‑67 (MQ=255) cGATATCGGTATGCACTGCATAAGCGAAGTCGACGGGCGTTGCACCGGCAGGCAGCTCGACAATgcg  >  1:399856/1‑67 (MQ=255) cGATATCGGTATGCACTGCATAAGCGAAGTCGACGGGCGTTGCACCGGCAGGCAGCTCGACAATgcg  >  1:401814/1‑67 (MQ=255) cGATATCGGTATGCACTGCATAAGCGAAGTCGACGGGCGTTGCACCGGCAGGCAGCTCGACAATgcg  >  1:402283/1‑67 (MQ=255) cGATATCGGTATGCACTGCATAAGCGAAGTCGACGGGCGTTGCACCGGCAGGCAGCTCGACAATgcg  >  1:445990/1‑67 (MQ=255) cGATATCGGTATGCACTGCATAAGCGAAGTCGACGGGCGTTGCACCGGCAGGCAGCTCGACAATgcg  >  1:462524/1‑67 (MQ=255) cGATATCGGTATGCACTGCATAAGCGAAGTCGACGGGCGTTGCACCGGCAGGCAGCTCGACAATgcg  >  1:552345/1‑67 (MQ=255) cGATATCGGTATGCACTGCATAAGCGAAGTCGACGGGCGTTGCACCGGCAGGCAGCTCGACAATgcg  >  1:57179/1‑67 (MQ=255) cGATATCGGTATGCACTGCATAAGCGAAGTCGACGGGCGTTGCACCGGCAGGCAGCTCGACAATgcg  >  1:603810/1‑67 (MQ=255) cGATATCGGTATGCACTGCATAAGCGAAGTCGACGGGCGTTGCACCGGCAGGCAGCTCGACAATgcg  >  1:206864/1‑67 (MQ=255) cGATATCGGTATGCACTGCATAAGCGAAGTCGACGGGCGTTGCACCGGCAGGCAGCTCGACAATgcg  >  1:615614/1‑67 (MQ=255) cGATATCGGTATGCACTGCATAAGCGAAGTCGACGGGCGTTGCACCGGCAGGCAGCTCGACAATgcg  >  1:65376/1‑67 (MQ=255) cGATATCGGTATGCACTGCATAAGCGAAGTCGACGGGCGTTGCACCGGCAGGCAGCTCGACAATgcg  >  1:734055/1‑67 (MQ=255) cGATATCGGTATGCACTGCATAAGCGAAGTCGACGGGCGTTGCACCGGCAGGCAGCTCGACAATgcg  >  1:797832/1‑67 (MQ=255) cGATATCGGTATGCACTGCATAAGCGAAGTCGACGGGCGTTGCACCGGCAGGCAGCTCGACAATgcg  >  1:823162/1‑67 (MQ=255) cGATATCGGTATGCACTGCATAAGCGAAGTCGACGGGCGTTGCACCGGCAGGCAGCTCGACAATgcg  >  1:830553/1‑67 (MQ=255) cGATATCGGTATGCACTGCATAAGCGAAGTCGACGGGCGTTGCACCGGCAGGCAGCTCGACAATgcg  >  1:873244/1‑67 (MQ=255) cGATATCGGTATGCACTGCATAAGCGAAGTCGACGGGCGTTGCACCGGCAGGCAGCTCGACAATgcg  >  1:917217/1‑67 (MQ=255) cGATATCGGTATGCACTGCATAAGCGAAGTCGACGGGCGTTGCACCGGCAGGCAGCTCGACAATgcg  >  1:918859/1‑67 (MQ=255) cGATATCGGTATGCACTGCATAAGCGAAGTCGACGGGCGTTGCACCGGCAGGCAGCTCGACAATgcg  >  1:946938/1‑67 (MQ=255) cGATATCGGTATGCACTGCATAAGCGAAGTCGACGGGCGTTGCACCGGCAGGCAGCTCGACAATgcg  >  1:960168/1‑67 (MQ=255) cGATATCGGTATGCACTGCATAAGCGAAGTCGACGGGCGTTGCACCGGCAGGCAGCTCGACAATgcg  >  1:1432606/1‑67 (MQ=255) cGATATCGGTATGCACTGCATAAGCGAAGTCGACGGGCGTTGCACCGGCAGGCAGCTCGACAATgcg  >  1:1145416/1‑67 (MQ=255) cGATATCGGTATGCACTGCATAAGCGAAGTCGACGGGCGTTGCACCGGCAGGCAGCTCGACAATgcg  >  1:1184184/1‑67 (MQ=255) cGATATCGGTATGCACTGCATAAGCGAAGTCGACGGGCGTTGCACCGGCAGGCAGCTCGACAATgcg  >  1:1204308/1‑67 (MQ=255) cGATATCGGTATGCACTGCATAAGCGAAGTCGACGGGCGTTGCACCGGCAGGCAGCTCGACAATgcg  >  1:1219977/1‑67 (MQ=255) cGATATCGGTATGCACTGCATAAGCGAAGTCGACGGGCGTTGCACCGGCAGGCAGCTCGACAATgcg  >  1:1220319/1‑67 (MQ=255) cGATATCGGTATGCACTGCATAAGCGAAGTCGACGGGCGTTGCACCGGCAGGCAGCTCGACAATgcg  >  1:1225517/1‑67 (MQ=255) cGATATCGGTATGCACTGCATAAGCGAAGTCGACGGGCGTTGCACCGGCAGGCAGCTCGACAATgcg  >  1:1272784/1‑67 (MQ=255) cGATATCGGTATGCACTGCATAAGCGAAGTCGACGGGCGTTGCACCGGCAGGCAGCTCGACAATgcg  >  1:1280153/1‑67 (MQ=255) cGATATCGGTATGCACTGCATAAGCGAAGTCGACGGGCGTTGCACCGGCAGGCAGCTCGACAATgcg  >  1:1289896/1‑67 (MQ=255) cGATATCGGTATGCACTGCATAAGCGAAGTCGACGGGCGTTGCACCGGCAGGCAGCTCGACAATgcg  >  1:1305662/1‑67 (MQ=255) cGATATCGGTATGCACTGCATAAGCGAAGTCGACGGGCGTTGCACCGGCAGGCAGCTCGACAATgcg  >  1:132157/1‑67 (MQ=255) cGATATCGGTATGCACTGCATAAGCGAAGTCGACGGGCGTTGCACCGGCAGGCAGCTCGACAATgcg  >  1:1343002/1‑67 (MQ=255) cGATATCGGTATGCACTGCATAAGCGAAGTCGACGGGCGTTGCACCGGCAGGCAGCTCGACAATgcg  >  1:1065672/1‑67 (MQ=255) cGATATCGGTATGCACTGCATAAGCGAAGTCGACGGGCGTTGCACCGGCAGGCAGCTCGACAATgcg  >  1:1469853/1‑67 (MQ=255) cGATATCGGTATGCACTGCATAAGCGAAGTCGACGGGCGTTGCACCGGCAGGCAGCTCGACAATgcg  >  1:1499676/1‑67 (MQ=255) cGATATCGGTATGCACTGCATAAGCGAAGTCGACGGGCGTTGCACCGGCAGGCAGCTCGACAATgcg  >  1:1512656/1‑67 (MQ=255) cGATATCGGTATGCACTGCATAAGCGAAGTCGACGGGCGTTGCACCGGCAGGCAGCTCGACAATgcg  >  1:1517326/1‑67 (MQ=255) cGATATCGGTATGCACTGCATAAGCGAAGTCGACGGGCGTTGCACCGGCAGGCAGCTCGACAATgcg  >  1:1548161/1‑67 (MQ=255) cGATATCGGTATGCACTGCATAAGCGAAGTCGACGGGCGTTGCACCGGCAGGCAGCTCGACAATgcg  >  1:1550515/1‑67 (MQ=255) cGATATCGGTATGCACTGCATAAGCGAAGTCGACGGGCGTTGCACCGGCAGGCAGCTCGACAATgcg  >  1:1673963/1‑67 (MQ=255) cGATATCGGTATGCACTGCATAAGCGAAGTCGACGGGCGTTGCACCGGCAGGCAGCTCGACAATgcg  >  1:1727869/1‑67 (MQ=255) cGATATCGGTATGCACTGCATAAGCGAAGTCGACGGGCGTTGCACCGGCAGGCAGCTCGACAATgcg  >  1:1782531/1‑67 (MQ=255) cGATATCGGTATGCACTGCATAAGCGAAGTCGACGGGCGTTGCACCGGCAGGCAGCTCGACAATgcg  >  1:1888276/1‑67 (MQ=255) cGATATCGGTATGCACTGCATAAGCGAAGTCGACGGGCGTTGCACCGGCAGGCAGCTCGACAATgcg  >  1:1964155/1‑67 (MQ=255) cGATATCGGTATGCACTGCATAAGCGAAGTCGACGGGCGTTGCACCGGCAGGCAGCTCGACAATgcg  >  1:1990063/1‑67 (MQ=255)                                                                   | CGATATCGGTATGCACTGCATAAGCGAAGTCGACGGGCGTTGCACCGGCAGGCAGCTCGACAATGCG  >  minE/2517823‑2517889

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑