Missing coverage evidence...
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ACGTCTGCGCAGCAAGCAGATATCACTGTGGCTGATGGAAGCCACGTCATTAACTTTTGTGCCAACA  >  minE/2549008‑2549074                                                                   | aCGTCTGCGCAGCAAGCAGATATCACTGTGGCTGATGGAAGCCACGTCATTAACTTTTGTGCcaaca  <  1:2143197/67‑1 (MQ=255) aCGTCTGCGCAGCAAGCAGATATCACTGTGGCTGATGGAAGCCACGTCATTAACTTTTGTGCcaaca  <  1:966618/67‑1 (MQ=255) aCGTCTGCGCAGCAAGCAGATATCACTGTGGCTGATGGAAGCCACGTCATTAACTTTTGTGCcaaca  <  1:832445/67‑1 (MQ=255) aCGTCTGCGCAGCAAGCAGATATCACTGTGGCTGATGGAAGCCACGTCATTAACTTTTGTGCcaaca  <  1:716450/67‑1 (MQ=255) aCGTCTGCGCAGCAAGCAGATATCACTGTGGCTGATGGAAGCCACGTCATTAACTTTTGTGCcaaca  <  1:669987/67‑1 (MQ=255) aCGTCTGCGCAGCAAGCAGATATCACTGTGGCTGATGGAAGCCACGTCATTAACTTTTGTGCcaaca  <  1:622967/67‑1 (MQ=255) aCGTCTGCGCAGCAAGCAGATATCACTGTGGCTGATGGAAGCCACGTCATTAACTTTTGTGCcaaca  <  1:565595/67‑1 (MQ=255) aCGTCTGCGCAGCAAGCAGATATCACTGTGGCTGATGGAAGCCACGTCATTAACTTTTGTGCcaaca  <  1:549589/67‑1 (MQ=255) aCGTCTGCGCAGCAAGCAGATATCACTGTGGCTGATGGAAGCCACGTCATTAACTTTTGTGCcaaca  <  1:512359/67‑1 (MQ=255) aCGTCTGCGCAGCAAGCAGATATCACTGTGGCTGATGGAAGCCACGTCATTAACTTTTGTGCcaaca  <  1:443078/67‑1 (MQ=255) aCGTCTGCGCAGCAAGCAGATATCACTGTGGCTGATGGAAGCCACGTCATTAACTTTTGTGCcaaca  <  1:388925/67‑1 (MQ=255) aCGTCTGCGCAGCAAGCAGATATCACTGTGGCTGATGGAAGCCACGTCATTAACTTTTGTGCcaaca  <  1:340774/67‑1 (MQ=255) aCGTCTGCGCAGCAAGCAGATATCACTGTGGCTGATGGAAGCCACGTCATTAACTTTTGTGCcaaca  <  1:265724/67‑1 (MQ=255) aCGTCTGCGCAGCAAGCAGATATCACTGTGGCTGATGGAAGCCACGTCATTAACTTTTGTGCcaaca  <  1:2148996/67‑1 (MQ=255) aCGTCTGCGCAGCAAGCAGATATCACTGTGGCTGATGGAAGCCACGTCATTAACTTTTGTGCcaaca  <  1:1221187/67‑1 (MQ=255) aCGTCTGCGCAGCAAGCAGATATCACTGTGGCTGATGGAAGCCACGTCATTAACTTTTGTGCcaaca  <  1:2080390/67‑1 (MQ=255) aCGTCTGCGCAGCAAGCAGATATCACTGTGGCTGATGGAAGCCACGTCATTAACTTTTGTGCcaaca  <  1:1927167/67‑1 (MQ=255) aCGTCTGCGCAGCAAGCAGATATCACTGTGGCTGATGGAAGCCACGTCATTAACTTTTGTGCcaaca  <  1:1924736/67‑1 (MQ=255) aCGTCTGCGCAGCAAGCAGATATCACTGTGGCTGATGGAAGCCACGTCATTAACTTTTGTGCcaaca  <  1:1893252/67‑1 (MQ=255) aCGTCTGCGCAGCAAGCAGATATCACTGTGGCTGATGGAAGCCACGTCATTAACTTTTGTGCcaaca  <  1:1818658/67‑1 (MQ=255) aCGTCTGCGCAGCAAGCAGATATCACTGTGGCTGATGGAAGCCACGTCATTAACTTTTGTGCcaaca  <  1:1658085/67‑1 (MQ=255) aCGTCTGCGCAGCAAGCAGATATCACTGTGGCTGATGGAAGCCACGTCATTAACTTTTGTGCcaaca  <  1:1654892/67‑1 (MQ=255) aCGTCTGCGCAGCAAGCAGATATCACTGTGGCTGATGGAAGCCACGTCATTAACTTTTGTGCcaaca  <  1:164177/67‑1 (MQ=255) aCGTCTGCGCAGCAAGCAGATATCACTGTGGCTGATGGAAGCCACGTCATTAACTTTTGTGCcaaca  <  1:1565393/67‑1 (MQ=255) aCGTCTGCGCAGCAAGCAGATATCACTGTGGCTGATGGAAGCCACGTCATTAACTTTTGTGCcaaca  <  1:1563931/67‑1 (MQ=255) aCGTCTGCGCAGCAAGCAGATATCACTGTGGCTGATGGAAGCCACGTCATTAACTTTTGTGCcaaca  <  1:1441195/67‑1 (MQ=255) aCGTCTGCGCAGCAAGCAGATATCACTGTGGCTGATGGAAGCCACGTCATTAACTTTTGTGCcaaca  <  1:1439277/67‑1 (MQ=255)  cGTCTGCGCAGCAAGCAGATATCACTGTGGCTGATGGAAGCCACGTCATTAACTTTTGTGCcaaca  <  1:286818/66‑1 (MQ=255)  cGTCTGCGCAGCAAGCAGATATCACTGTGGCTGATGGAAGCCACGTCATTAACTTTTGTGCcaaca  <  1:1882695/66‑1 (MQ=255)  cGTCTGCGCAGCAAGCAGATATCACTGTGGCTGATGGAAGCCACGTCATTAACTTTTGTGCcaaca  <  1:55611/66‑1 (MQ=255)  cGTCTGCGCAGCAAGCAGATATCACTGTGGCTGATGGAAGCCACGTCATTAACTTTTGTGCcaaca  <  1:1602245/66‑1 (MQ=255)                                                                   | ACGTCTGCGCAGCAAGCAGATATCACTGTGGCTGATGGAAGCCACGTCATTAACTTTTGTGCCAACA  >  minE/2549008‑2549074

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑