Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	minE	2561908	2561908	1	38 [0]	[0] 15	lldR	DNA‑binding transcriptional repressor

GAAAAAACCGGTGGCACCAGATACATCCGCTGACGGCTATGCTTCACTGAGGATTGCAGGACAT  >  minE/2561844‑2561907                                                                | gAAAAAACCGGTGGCACCAGATACATCCGCTGACGGCTATGCTTCACTGAGGATTGCAGGACAt  >  1:58249/1‑64 (MQ=255) gAAAAAACCGGTGGCACCAGATACATCCGCTGACGGCTATGCTTCACTGAGGATTGCAGGACAt  >  1:2069560/1‑64 (MQ=255) gAAAAAACCGGTGGCACCAGATACATCCGCTGACGGCTATGCTTCACTGAGGATTGCAGGACAt  >  1:2114559/1‑64 (MQ=255) gAAAAAACCGGTGGCACCAGATACATCCGCTGACGGCTATGCTTCACTGAGGATTGCAGGACAt  >  1:250003/1‑64 (MQ=255) gAAAAAACCGGTGGCACCAGATACATCCGCTGACGGCTATGCTTCACTGAGGATTGCAGGACAt  >  1:252250/1‑64 (MQ=255) gAAAAAACCGGTGGCACCAGATACATCCGCTGACGGCTATGCTTCACTGAGGATTGCAGGACAt  >  1:264784/1‑64 (MQ=255) gAAAAAACCGGTGGCACCAGATACATCCGCTGACGGCTATGCTTCACTGAGGATTGCAGGACAt  >  1:401915/1‑64 (MQ=255) gAAAAAACCGGTGGCACCAGATACATCCGCTGACGGCTATGCTTCACTGAGGATTGCAGGACAt  >  1:457632/1‑64 (MQ=255) gAAAAAACCGGTGGCACCAGATACATCCGCTGACGGCTATGCTTCACTGAGGATTGCAGGACAt  >  1:527654/1‑64 (MQ=255) gAAAAAACCGGTGGCACCAGATACATCCGCTGACGGCTATGCTTCACTGAGGATTGCAGGACAt  >  1:541662/1‑64 (MQ=255) gAAAAAACCGGTGGCACCAGATACATCCGCTGACGGCTATGCTTCACTGAGGATTGCAGGACAt  >  1:20673/1‑64 (MQ=255) gAAAAAACCGGTGGCACCAGATACATCCGCTGACGGCTATGCTTCACTGAGGATTGCAGGACAt  >  1:744650/1‑64 (MQ=255) gAAAAAACCGGTGGCACCAGATACATCCGCTGACGGCTATGCTTCACTGAGGATTGCAGGACAt  >  1:851312/1‑64 (MQ=255) gAAAAAACCGGTGGCACCAGATACATCCGCTGACGGCTATGCTTCACTGAGGATTGCAGGACAt  >  1:899255/1‑64 (MQ=255) gAAAAAACCGGTGGCACCAGATACATCCGCTGACGGCTATGCTTCACTGAGGATTGCAGGACAt  >  1:915440/1‑64 (MQ=255) gAAAAAACCGGTGGCACCAGATACATCCGCTGACGGCTATGCTTCACTGAGGATTGCAGGACAt  >  1:919725/1‑64 (MQ=255) gAAAAAACCGGTGGCACCAGATACATCCGCTGACGGCTATGCTTCACTGAGGATTGCAGGACAt  >  1:962890/1‑64 (MQ=255) gAAAAAACCGGTGGCACCAGATACATCCGCTGACGGCTATGCTTCACTGAGGATTGCAGGACAt  >  1:988170/1‑64 (MQ=255) gAAAAAACCGGTGGCACCAGATACATCCGCTGACGGCTATGCTTCACTGAGGATTGCAGGACAt  >  1:992784/1‑64 (MQ=255) gAAAAAACCGGTGGCACCAGATACATCCGCTGACGGCTATGCTTCACTGAGGATTGCAGGACAt  >  1:1598017/1‑64 (MQ=255) gAAAAAACCGGTGGCACCAGATACATCCGCTGACGGCTATGCTTCACTGAGGATTGCAGGACAt  >  1:1130122/1‑64 (MQ=255) gAAAAAACCGGTGGCACCAGATACATCCGCTGACGGCTATGCTTCACTGAGGATTGCAGGACAt  >  1:1354012/1‑64 (MQ=255) gAAAAAACCGGTGGCACCAGATACATCCGCTGACGGCTATGCTTCACTGAGGATTGCAGGACAt  >  1:1376555/1‑64 (MQ=255) gAAAAAACCGGTGGCACCAGATACATCCGCTGACGGCTATGCTTCACTGAGGATTGCAGGACAt  >  1:146057/1‑64 (MQ=255) gAAAAAACCGGTGGCACCAGATACATCCGCTGACGGCTATGCTTCACTGAGGATTGCAGGACAt  >  1:1472026/1‑64 (MQ=255) gAAAAAACCGGTGGCACCAGATACATCCGCTGACGGCTATGCTTCACTGAGGATTGCAGGACAt  >  1:1486202/1‑64 (MQ=255) gAAAAAACCGGTGGCACCAGATACATCCGCTGACGGCTATGCTTCACTGAGGATTGCAGGACAt  >  1:1525123/1‑64 (MQ=255) gAAAAAACCGGTGGCACCAGATACATCCGCTGACGGCTATGCTTCACTGAGGATTGCAGGACAt  >  1:1531246/1‑64 (MQ=255) gAAAAAACCGGTGGCACCAGATACATCCGCTGACGGCTATGCTTCACTGAGGATTGCAGGACAt  >  1:1568328/1‑64 (MQ=255) gAAAAAACCGGTGGCACCAGATACATCCGCTGACGGCTATGCTTCACTGAGGATTGCAGGACAt  >  1:108860/1‑64 (MQ=255) gAAAAAACCGGTGGCACCAGATACATCCGCTGACGGCTATGCTTCACTGAGGATTGCAGGACAt  >  1:1668383/1‑64 (MQ=255) gAAAAAACCGGTGGCACCAGATACATCCGCTGACGGCTATGCTTCACTGAGGATTGCAGGACAt  >  1:1721/1‑64 (MQ=255) gAAAAAACCGGTGGCACCAGATACATCCGCTGACGGCTATGCTTCACTGAGGATTGCAGGACAt  >  1:1729903/1‑64 (MQ=255) gAAAAAACCGGTGGCACCAGATACATCCGCTGACGGCTATGCTTCACTGAGGATTGCAGGACAt  >  1:1766226/1‑64 (MQ=255) gAAAAAACCGGTGGCACCAGATACATCCGCTGACGGCTATGCTTCACTGAGGATTGCAGGACAt  >  1:1909200/1‑64 (MQ=255) gAAAAAACCGGTGGCACCAGATACATCCGCTGACGGCTATGCTTCACTGAGGATTGCAGGACAt  >  1:1910936/1‑64 (MQ=255) gAAAAAACCGGTGGCACCAGATACATCCGCTGACGGCTATGCTTCACTGAGGATTGCAGGACAt  >  1:1924151/1‑64 (MQ=255) gAAAAAACCGGTGGCACCAGATACATCCGCTGACGGCTATGCTTCACTGAGGATTGCAGGACAt  >  1:198025/1‑64 (MQ=255)                                                                | GAAAAAACCGGTGGCACCAGATACATCCGCTGACGGCTATGCTTCACTGAGGATTGCAGGACAT  >  minE/2561844‑2561907

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑