Missing coverage evidence...
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CATCGCAGGGATGATTGCACTGGCAATTTCACACACCGCTATGGCTGACGATATTAAAGTCGCCGTT  >  minE/2629652‑2629718                                                                   | catcGCAGGGATGATTGGACTGGCAATTTCACACACCGCTATGGCTGACGATATTAAAGTCGCCGtt  >  1:263016/1‑67 (MQ=255) catcGCAGGGATGATTGCACTGGCAATTTCACACACCGCTATGGCTGACGATATTAAAGTCGCCGtt  >  1:1799108/1‑67 (MQ=255) catcGCAGGGATGATTGCACTGGCAATTTCACACACCGCTATGGCTGACGATATTAAAGTCGCCGtt  >  1:906193/1‑67 (MQ=255) catcGCAGGGATGATTGCACTGGCAATTTCACACACCGCTATGGCTGACGATATTAAAGTCGCCGtt  >  1:89849/1‑67 (MQ=255) catcGCAGGGATGATTGCACTGGCAATTTCACACACCGCTATGGCTGACGATATTAAAGTCGCCGtt  >  1:803009/1‑67 (MQ=255) catcGCAGGGATGATTGCACTGGCAATTTCACACACCGCTATGGCTGACGATATTAAAGTCGCCGtt  >  1:786715/1‑67 (MQ=255) catcGCAGGGATGATTGCACTGGCAATTTCACACACCGCTATGGCTGACGATATTAAAGTCGCCGtt  >  1:612399/1‑67 (MQ=255) catcGCAGGGATGATTGCACTGGCAATTTCACACACCGCTATGGCTGACGATATTAAAGTCGCCGtt  >  1:437762/1‑67 (MQ=255) catcGCAGGGATGATTGCACTGGCAATTTCACACACCGCTATGGCTGACGATATTAAAGTCGCCGtt  >  1:348699/1‑67 (MQ=255) catcGCAGGGATGATTGCACTGGCAATTTCACACACCGCTATGGCTGACGATATTAAAGTCGCCGtt  >  1:297438/1‑67 (MQ=255) catcGCAGGGATGATTGCACTGGCAATTTCACACACCGCTATGGCTGACGATATTAAAGTCGCCGtt  >  1:2113087/1‑67 (MQ=255) catcGCAGGGATGATTGCACTGGCAATTTCACACACCGCTATGGCTGACGATATTAAAGTCGCCGtt  >  1:2100539/1‑67 (MQ=255) catcGCAGGGATGATTGCACTGGCAATTTCACACACCGCTATGGCTGACGATATTAAAGTCGCCGtt  >  1:105108/1‑67 (MQ=255) catcGCAGGGATGATTGCACTGGCAATTTCACACACCGCTATGGCTGACGATATTAAAGTCGCCGtt  >  1:1687727/1‑67 (MQ=255) catcGCAGGGATGATTGCACTGGCAATTTCACACACCGCTATGGCTGACGATATTAAAGTCGCCGtt  >  1:1606929/1‑67 (MQ=255) catcGCAGGGATGATTGCACTGGCAATTTCACACACCGCTATGGCTGACGATATTAAAGTCGCCGtt  >  1:1598654/1‑67 (MQ=255) catcGCAGGGATGATTGCACTGGCAATTTCACACACCGCTATGGCTGACGATATTAAAGTCGCCGtt  >  1:1514895/1‑67 (MQ=255) catcGCAGGGATGATTGCACTGGCAATTTCACACACCGCTATGGCTGACGATATTAAAGTCGCCGtt  >  1:1283089/1‑67 (MQ=255) catcGCAGGGATGATTGCACTGGCAATTTCACACACCGCTATGGCTGACGATATTAAAGTCGCCGtt  >  1:1266820/1‑67 (MQ=255) catcGCAGGGATGATTGCACTGGCAATTTCACACACCGCTATGGCTGACGATATTAAAGTCGCCGtt  >  1:1258976/1‑67 (MQ=255) catcGCAGGGATGATTGCACTGGCAATTTCACACACCGCTATGGCTGACGATATTAAAGTCGCCGtt  >  1:1220410/1‑67 (MQ=255) catcGCAGGGATGATTGCACTGGCAATTTCACACACCGCTATGGCTGACGATATTAAAGTCGCCGtt  >  1:1204696/1‑67 (MQ=255) catcGCAGGGATGATTGCACTGGCAATTTCACACACCGCTATGGCTGACGATATTAAAGTCGCCGtt  >  1:1065791/1‑67 (MQ=255) catcGCAGGGATGATTGCACTGGCAATTTCACACACCGCTATGGCTGACGATATTAAAGTCGCCGtt  >  1:1061772/1‑67 (MQ=255)                                                                   | CATCGCAGGGATGATTGCACTGGCAATTTCACACACCGCTATGGCTGACGATATTAAAGTCGCCGTT  >  minE/2629652‑2629718

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑