Missing coverage evidence...
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*	*	÷	minE	2662141	2662189	49	34 [0]	[0] 33	rtcR	sigma 54‑dependent transcriptional regulator of rtcBA expression

CGCGCAGGGTGGCGCAGTTCACTTCCACAAACGCGCCGCTAAACTGATGCCGCGCCTGTTTTAACT  >  minE/2662075‑2662140                                                                  | cgcgCAGGGTGGCGCAGTTCACTTCCACAAACGCGCCGCTAAACTGATGCCGCGCCTGTTTTAAct  >  1:583270/1‑66 (MQ=255) cgcgCAGGGTGGCGCAGTTCACTTCCACAAACGCGCCGCTAAACTGATGCCGCGCCTGTTTTAAct  >  1:342395/1‑66 (MQ=255) cgcgCAGGGTGGCGCAGTTCACTTCCACAAACGCGCCGCTAAACTGATGCCGCGCCTGTTTTAAct  >  1:377068/1‑66 (MQ=255) cgcgCAGGGTGGCGCAGTTCACTTCCACAAACGCGCCGCTAAACTGATGCCGCGCCTGTTTTAAct  >  1:453573/1‑66 (MQ=255) cgcgCAGGGTGGCGCAGTTCACTTCCACAAACGCGCCGCTAAACTGATGCCGCGCCTGTTTTAAct  >  1:502919/1‑66 (MQ=255) cgcgCAGGGTGGCGCAGTTCACTTCCACAAACGCGCCGCTAAACTGATGCCGCGCCTGTTTTAAct  >  1:510484/1‑66 (MQ=255) cgcgCAGGGTGGCGCAGTTCACTTCCACAAACGCGCCGCTAAACTGATGCCGCGCCTGTTTTAAct  >  1:518599/1‑66 (MQ=255) cgcgCAGGGTGGCGCAGTTCACTTCCACAAACGCGCCGCTAAACTGATGCCGCGCCTGTTTTAAct  >  1:558849/1‑66 (MQ=255) cgcgCAGGGTGGCGCAGTTCACTTCCACAAACGCGCCGCTAAACTGATGCCGCGCCTGTTTTAAct  >  1:573789/1‑66 (MQ=255) cgcgCAGGGTGGCGCAGTTCACTTCCACAAACGCGCCGCTAAACTGATGCCGCGCCTGTTTTAAct  >  1:297248/1‑66 (MQ=255) cgcgCAGGGTGGCGCAGTTCACTTCCACAAACGCGCCGCTAAACTGATGCCGCGCCTGTTTTAAct  >  1:62980/1‑66 (MQ=255) cgcgCAGGGTGGCGCAGTTCACTTCCACAAACGCGCCGCTAAACTGATGCCGCGCCTGTTTTAAct  >  1:683338/1‑66 (MQ=255) cgcgCAGGGTGGCGCAGTTCACTTCCACAAACGCGCCGCTAAACTGATGCCGCGCCTGTTTTAAct  >  1:838590/1‑66 (MQ=255) cgcgCAGGGTGGCGCAGTTCACTTCCACAAACGCGCCGCTAAACTGATGCCGCGCCTGTTTTAAct  >  1:843926/1‑66 (MQ=255) cgcgCAGGGTGGCGCAGTTCACTTCCACAAACGCGCCGCTAAACTGATGCCGCGCCTGTTTTAAct  >  1:895661/1‑66 (MQ=255) cgcgCAGGGTGGCGCAGTTCACTTCCACAAACGCGCCGCTAAACTGATGCCGCGCCTGTTTTAAct  >  1:946903/1‑66 (MQ=255) cgcgCAGGGTGGCGCAGTTCACTTCCACAAACGCGCCGCTAAACTGATGCCGCGCCTGTTTTAAct  >  1:988328/1‑66 (MQ=255) cgcgCAGGGTGGCGCAGTTCACTTCCACAAACGCGCCGCTAAACTGATGCCGCGCCTGTTTTAAct  >  1:187350/1‑66 (MQ=255) cgcgCAGGGTGGCGCAGTTCACTTCCACAAACGCGCCGCTAAACTGATGCCGCGCCTGTTTTAAct  >  1:1071311/1‑66 (MQ=255) cgcgCAGGGTGGCGCAGTTCACTTCCACAAACGCGCCGCTAAACTGATGCCGCGCCTGTTTTAAct  >  1:1286952/1‑66 (MQ=255) cgcgCAGGGTGGCGCAGTTCACTTCCACAAACGCGCCGCTAAACTGATGCCGCGCCTGTTTTAAct  >  1:1312793/1‑66 (MQ=255) cgcgCAGGGTGGCGCAGTTCACTTCCACAAACGCGCCGCTAAACTGATGCCGCGCCTGTTTTAAct  >  1:1313812/1‑66 (MQ=255) cgcgCAGGGTGGCGCAGTTCACTTCCACAAACGCGCCGCTAAACTGATGCCGCGCCTGTTTTAAct  >  1:1397746/1‑66 (MQ=255) cgcgCAGGGTGGCGCAGTTCACTTCCACAAACGCGCCGCTAAACTGATGCCGCGCCTGTTTTAAct  >  1:1400051/1‑66 (MQ=255) cgcgCAGGGTGGCGCAGTTCACTTCCACAAACGCGCCGCTAAACTGATGCCGCGCCTGTTTTAAct  >  1:1628197/1‑66 (MQ=255) cgcgCAGGGTGGCGCAGTTCACTTCCACAAACGCGCCGCTAAACTGATGCCGCGCCTGTTTTAAct  >  1:1780/1‑66 (MQ=255) cgcgCAGGGTGGCGCAGTTCACTTCCACAAACGCGCCGCTAAACTGATGCCGCGCCTGTTTTAAct  >  1:1031167/1‑66 (MQ=255) cgcgCAGGGTGGCGCAGTTCACTTCCACAAACGCGCCGCTAAACTGATGCCGCGCCTGTTTTAAct  >  1:1904263/1‑66 (MQ=255) cgcgCAGGGTGGCGCAGTTCACTTCCACAAACGCGCCGCTAAACTGATGCCGCGCCTGTTTTAAct  >  1:1946176/1‑66 (MQ=255) cgcgCAGGGTGGCGCAGTTCACTTCCACAAACGCGCCGCTAAACTGATGCCGCGCCTGTTTTAAct  >  1:1967273/1‑66 (MQ=255) cgcgCAGGGTGGCGCAGTTCACTTCCACAAACGCGCCGCTAAACTGATGCCGCGCCTGTTTTAAct  >  1:1999857/1‑66 (MQ=255) cgcgCAGGGTGGCGCAGTTCACTTCCACAAACGCGCCGCTAAACTGATGCCGCGCCTGTTTTAAct  >  1:2087534/1‑66 (MQ=255) cgcgCAGGGTGGCGCAGTTCACTTCCACAAACGCGCCGCTAAACTGATGCCGCGCCTGTTTTAAct  >  1:2105625/1‑66 (MQ=255) cgcgCAGGGTGGCGCAGTTCACTTCCACAAACGCGCCGCTAAACTGATGCCGCGCCTGTTTTAAct  >  1:279641/1‑66 (MQ=255)                                                                  | CGCGCAGGGTGGCGCAGTTCACTTCCACAAACGCGCCGCTAAACTGATGCCGCGCCTGTTTTAACT  >  minE/2662075‑2662140

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑