Missing coverage evidence...
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CGCATCGCCCGGTTAGTTTTAACCTTGTCCACCGTGATTCACGTTCGTGAACATGTCCTTTCAGGG  >  minE/231408‑231473                                                                  | cGCATCGCCCGGTTAGTTTTATCCTTGTCCACCGTGATTCACGTTCGTGATCATGTCCTTTCAggg  >  1:1076264/1‑66 (MQ=255) cGCATCGCCCGGTTAGTTTTAACCTTGTCCACCGTGATTCACGTTCGTGAACATGTCCTTTCAggg  >  1:1074730/1‑66 (MQ=255) cGCATCGCCCGGTTAGTTTTAACCTTGTCCACCGTGATTCACGTTCGTGAACATGTCCTTTCAggg  >  1:1328621/1‑66 (MQ=255) cGCATCGCCCGGTTAGTTTTAACCTTGTCCACCGTGATTCACGTTCGTGAACATGTCCTTTCAggg  >  1:1349787/1‑66 (MQ=255) cGCATCGCCCGGTTAGTTTTAACCTTGTCCACCGTGATTCACGTTCGTGAACATGTCCTTTCAggg  >  1:1405356/1‑66 (MQ=255) cGCATCGCCCGGTTAGTTTTAACCTTGTCCACCGTGATTCACGTTCGTGAACATGTCCTTTCAggg  >  1:14064/1‑66 (MQ=255) cGCATCGCCCGGTTAGTTTTAACCTTGTCCACCGTGATTCACGTTCGTGAACATGTCCTTTCAggg  >  1:1439693/1‑66 (MQ=255) cGCATCGCCCGGTTAGTTTTAACCTTGTCCACCGTGATTCACGTTCGTGAACATGTCCTTTCAggg  >  1:1451245/1‑66 (MQ=255) cGCATCGCCCGGTTAGTTTTAACCTTGTCCACCGTGATTCACGTTCGTGAACATGTCCTTTCAggg  >  1:1699132/1‑66 (MQ=255) cGCATCGCCCGGTTAGTTTTAACCTTGTCCACCGTGATTCACGTTCGTGAACATGTCCTTTCAggg  >  1:1737108/1‑66 (MQ=255) cGCATCGCCCGGTTAGTTTTAACCTTGTCCACCGTGATTCACGTTCGTGAACATGTCCTTTCAggg  >  1:488123/1‑66 (MQ=255) cGCATCGCCCGGTTAGTTTTAACCTTGTCCACCGTGATTCACGTTCGTGAACATGTCCTTTCAggg  >  1:514506/1‑66 (MQ=255) cGCATCGCCCGGTTAGTTTTAACCTTGTCCACCGTGATTCACGTTCGTGAACATGTCCTTTCAggg  >  1:577741/1‑66 (MQ=255) cGCATCGCCCGGTTAGTTTTAACCTTGTCCACCGTGATTCACGTTCGTGAACATGTCCTTTCAggg  >  1:731714/1‑66 (MQ=255) cGCATCGCCCGGTTAGTTTTAACCTTGTCCACCGTGATTCACGTTCGTGAACATGTCCTTTCAggg  >  1:761391/1‑66 (MQ=255) cGCATCGCCCGGTTAGTTTTAACCTTGTCCACCGTGATTCACGTTCGTGAACATGTCCTTTCAggg  >  1:826472/1‑66 (MQ=255)                                                                  | CGCATCGCCCGGTTAGTTTTAACCTTGTCCACCGTGATTCACGTTCGTGAACATGTCCTTTCAGGG  >  minE/231408‑231473

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑