Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	minE	2822135	2822138	4	39 [0]	[0] 7	nrfE	heme lyase (NrfEFG) for insertion of heme into c552, subunit NrfE

CGTTTTTATGAAGCACGCCGTCAACAAATGATGGAACCGTCAATTCGCTGGAACGGCATCCATGACT  >  minE/2822068‑2822134                                                                   | cgTTTTTATGAAGCACGCCGTCAACAAATGTTGGAACCGTCAATTCGCTGGAACGGCATCCATGACt  <  1:1203278/67‑1 (MQ=255) cgTTTTTATGAAGCACGCCGTCAACAAATGATGGAACCGTCAATTCGCTGGAACGGCATCCATGACt  <  1:1733028/67‑1 (MQ=255) cgTTTTTATGAAGCACGCCGTCAACAAATGATGGAACCGTCAATTCGCTGGAACGGCATCCATGACt  <  1:477441/67‑1 (MQ=255) cgTTTTTATGAAGCACGCCGTCAACAAATGATGGAACCGTCAATTCGCTGGAACGGCATCCATGACt  <  1:456615/67‑1 (MQ=255) cgTTTTTATGAAGCACGCCGTCAACAAATGATGGAACCGTCAATTCGCTGGAACGGCATCCATGACt  <  1:435693/67‑1 (MQ=255) cgTTTTTATGAAGCACGCCGTCAACAAATGATGGAACCGTCAATTCGCTGGAACGGCATCCATGACt  <  1:358437/67‑1 (MQ=255) cgTTTTTATGAAGCACGCCGTCAACAAATGATGGAACCGTCAATTCGCTGGAACGGCATCCATGACt  <  1:506431/67‑1 (MQ=255) cgTTTTTATGAAGCACGCCGTCAACAAATGATGGAACCGTCAATTCGCTGGAACGGCATCCATGACt  <  1:533463/67‑1 (MQ=255) cgTTTTTATGAAGCACGCCGTCAACAAATGATGGAACCGTCAATTCGCTGGAACGGCATCCATGACt  <  1:233826/67‑1 (MQ=255) cgTTTTTATGAAGCACGCCGTCAACAAATGATGGAACCGTCAATTCGCTGGAACGGCATCCATGACt  <  1:2099940/67‑1 (MQ=255) cgTTTTTATGAAGCACGCCGTCAACAAATGATGGAACCGTCAATTCGCTGGAACGGCATCCATGACt  <  1:2088706/67‑1 (MQ=255) cgTTTTTATGAAGCACGCCGTCAACAAATGATGGAACCGTCAATTCGCTGGAACGGCATCCATGACt  <  1:2026971/67‑1 (MQ=255) cgTTTTTATGAAGCACGCCGTCAACAAATGATGGAACCGTCAATTCGCTGGAACGGCATCCATGACt  <  1:647044/67‑1 (MQ=255) cgTTTTTATGAAGCACGCCGTCAACAAATGATGGAACCGTCAATTCGCTGGAACGGCATCCATGACt  <  1:2019041/67‑1 (MQ=255) cgTTTTTATGAAGCACGCCGTCAACAAATGATGGAACCGTCAATTCGCTGGAACGGCATCCATGACt  <  1:1847865/67‑1 (MQ=255) cgTTTTTATGAAGCACGCCGTCAACAAATGATGGAACCGTCAATTCGCTGGAACGGCATCCATGACt  <  1:1832976/67‑1 (MQ=255) cgTTTTTATGAAGCACGCCGTCAACAAATGATGGAACCGTCAATTCGCTGGAACGGCATCCATGACt  <  1:65764/67‑1 (MQ=255) cgTTTTTATGAAGCACGCCGTCAACAAATGATGGAACCGTCAATTCGCTGGAACGGCATCCATGACt  <  1:1583376/67‑1 (MQ=255) cgTTTTTATGAAGCACGCCGTCAACAAATGATGGAACCGTCAATTCGCTGGAACGGCATCCATGACt  <  1:79185/67‑1 (MQ=255) cgTTTTTATGAAGCACGCCGTCAACAAATGATGGAACCGTCAATTCGCTGGAACGGCATCCATGACt  <  1:1395588/67‑1 (MQ=255) cgTTTTTATGAAGCACGCCGTCAACAAATGATGGAACCGTCAATTCGCTGGAACGGCATCCATGACt  <  1:1356669/67‑1 (MQ=255) cgTTTTTATGAAGCACGCCGTCAACAAATGATGGAACCGTCAATTCGCTGGAACGGCATCCATGACt  <  1:1325024/67‑1 (MQ=255) cgTTTTTATGAAGCACGCCGTCAACAAATGATGGAACCGTCAATTCGCTGGAACGGCATCCATGACt  <  1:1307220/67‑1 (MQ=255) cgTTTTTATGAAGCACGCCGTCAACAAATGATGGAACCGTCAATTCGCTGGAACGGCATCCATGACt  <  1:1201500/67‑1 (MQ=255) cgTTTTTATGAAGCACGCCGTCAACAAATGATGGAACCGTCAATTCGCTGGAACGGCATCCATGACt  <  1:821183/67‑1 (MQ=255) cgTTTTTATGAAGCACGCCGTCAACAAATGATGGAACCGTCAATTCGCTGGAACGGCATCCATGACt  <  1:928243/67‑1 (MQ=255) cgTTTTTATGAAGCACGCCGTCAACAAATGATGGAACCGTCAATTCGCTGGAACGGCATCCATGACt  <  1:1084276/67‑1 (MQ=255) cgTTTTTATGAAGCACGCCGTCAACAAATGATGGAACCGTCAATTCGCTGGAACGGCATCCATGACt  <  1:1037663/67‑1 (MQ=255)  gTTTTTATGAAGCACGCCGTCAACAAATGATGGAACCGTCAATTCGCTGGAACGGCATCCATGACt  <  1:2024562/66‑1 (MQ=255)  gTTTTTATGAAGCACGCCGTCAACAAATGATGGAACCGTCAATTCGCTGGAACGGCATCCATGACt  <  1:679875/66‑1 (MQ=255)  gTTTTTATGAAGCACGCCGTCAACAAATGATGGAACCGTCAATTCGCTGGAACGGCATCCATGACt  <  1:286754/66‑1 (MQ=255)  gTTTTTATGAAGCACGCCGTCAACAAATGATGGAACCGTCAATTCGCTGGAACGGCATCCATGACt  <  1:1600398/66‑1 (MQ=255)  gTTTTTATGAAGCACGCCGTCAACAAATGATGGAACCGTCAATTCGCTGGAACGGCATCCATGACt  <  1:1527525/66‑1 (MQ=255)  gTTTTTATGAAGCACGCCGTCAACAAATGATGGAACCGTCAATTCGCTGGAACGGCATCCATGACt  <  1:1447129/66‑1 (MQ=255)  gTTTTTATGAAGCACGCCGTCAACAAATGATGGAACCGTCAATTCGCTGGAACGGCATCCATGACt  <  1:110684/66‑1 (MQ=255)  gTTTTTATGAAGCACGCCGTCAACAAATGATGGAACCGTCAATTCGCTGGAACGGCATCCATGACt  <  1:1105944/66‑1 (MQ=255)           aaGCACGCCGTCAACAAATGATGGAACCGTCAATTCGCTGGAACGGCATCCATGACt  <  1:948634/57‑1 (MQ=255)                 gCCGTCAACAAATGATGGAACCGTCAATTCGCTGGAACGGCATCCATGACt  <  1:235829/51‑1 (MQ=255)                      caacaaATGATGGAACCGTCAATTCGCTGGAACGGCATCCATGACt  <  1:1034738/46‑1 (MQ=255)                                                                   | CGTTTTTATGAAGCACGCCGTCAACAAATGATGGAACCGTCAATTCGCTGGAACGGCATCCATGACT  >  minE/2822068‑2822134

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑