Missing coverage evidence...
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TCGTGCCGTTTGTTTTTTCTGCGATAGTCACAAAGGTAATAGTTGAAATTCCCCTGCCACCTGGC  >  minE/2838385‑2838449                                                                 | tCGTGCCGTTTGTTTTTTCTGCGATAGTCACAAAGGTAATAGTTGAAATTCCCCTGCCACCTGGc  <  1:184271/65‑1 (MQ=255) tCGTGCCGTTTGTTTTTTCTGCGATAGTCACAAAGGTAATAGTTGAAATTCCCCTGCCACCTGGc  <  1:655714/65‑1 (MQ=255) tCGTGCCGTTTGTTTTTTCTGCGATAGTCACAAAGGTAATAGTTGAAATTCCCCTGCCACCTGGc  <  1:487079/65‑1 (MQ=255) tCGTGCCGTTTGTTTTTTCTGCGATAGTCACAAAGGTAATAGTTGAAATTCCCCTGCCACCTGGc  <  1:395598/65‑1 (MQ=255) tCGTGCCGTTTGTTTTTTCTGCGATAGTCACAAAGGTAATAGTTGAAATTCCCCTGCCACCTGGc  <  1:359520/65‑1 (MQ=255) tCGTGCCGTTTGTTTTTTCTGCGATAGTCACAAAGGTAATAGTTGAAATTCCCCTGCCACCTGGc  <  1:333926/65‑1 (MQ=255) tCGTGCCGTTTGTTTTTTCTGCGATAGTCACAAAGGTAATAGTTGAAATTCCCCTGCCACCTGGc  <  1:248325/65‑1 (MQ=255) tCGTGCCGTTTGTTTTTTCTGCGATAGTCACAAAGGTAATAGTTGAAATTCCCCTGCCACCTGGc  <  1:233762/65‑1 (MQ=255) tCGTGCCGTTTGTTTTTTCTGCGATAGTCACAAAGGTAATAGTTGAAATTCCCCTGCCACCTGGc  <  1:228601/65‑1 (MQ=255) tCGTGCCGTTTGTTTTTTCTGCGATAGTCACAAAGGTAATAGTTGAAATTCCCCTGCCACCTGGc  <  1:2155755/65‑1 (MQ=255) tCGTGCCGTTTGTTTTTTCTGCGATAGTCACAAAGGTAATAGTTGAAATTCCCCTGCCACCTGGc  <  1:1948183/65‑1 (MQ=255) tCGTGCCGTTTGTTTTTTCTGCGATAGTCACAAAGGTAATAGTTGAAATTCCCCTGCCACCTGGc  <  1:1943643/65‑1 (MQ=255) tCGTGCCGTTTGTTTTTTCTGCGATAGTCACAAAGGTAATAGTTGAAATTCCCCTGCCACCTGGc  <  1:193020/65‑1 (MQ=255) tCGTGCCGTTTGTTTTTTCTGCGATAGTCACAAAGGTAATAGTTGAAATTCCCCTGCCACCTGGc  <  1:1850765/65‑1 (MQ=255) tCGTGCCGTTTGTTTTTTCTGCGATAGTCACAAAGGTAATAGTTGAAATTCCCCTGCCACCTGGc  <  1:1060564/65‑1 (MQ=255) tCGTGCCGTTTGTTTTTTCTGCGATAGTCACAAAGGTAATAGTTGAAATTCCCCTGCCACCTGGc  <  1:1832957/65‑1 (MQ=255) tCGTGCCGTTTGTTTTTTCTGCGATAGTCACAAAGGTAATAGTTGAAATTCCCCTGCCACCTGGc  <  1:1797329/65‑1 (MQ=255) tCGTGCCGTTTGTTTTTTCTGCGATAGTCACAAAGGTAATAGTTGAAATTCCCCTGCCACCTGGc  <  1:1768354/65‑1 (MQ=255) tCGTGCCGTTTGTTTTTTCTGCGATAGTCACAAAGGTAATAGTTGAAATTCCCCTGCCACCTGGc  <  1:1728102/65‑1 (MQ=255) tCGTGCCGTTTGTTTTTTCTGCGATAGTCACAAAGGTAATAGTTGAAATTCCCCTGCCACCTGGc  <  1:1463101/65‑1 (MQ=255) tCGTGCCGTTTGTTTTTTCTGCGATAGTCACAAAGGTAATAGTTGAAATTCCCCTGCCACCTGGc  <  1:1415887/65‑1 (MQ=255) tCGTGCCGTTTGTTTTTTCTGCGATAGTCACAAAGGTAATAGTTGAAATTCCCCTGCCACCTGGc  <  1:1398163/65‑1 (MQ=255) tCGTGCCGTTTGTTTTTTCTGCGATAGTCACAAAGGTAATAGTTGAAATTCCCCTGCCACCTGGc  <  1:135294/65‑1 (MQ=255) tCGTGCCGTTTGTTTTTTCTGCGATAGTCACAAAGGTAATAGTTGAAATTCCCCTGCCACCTGGc  <  1:1311143/65‑1 (MQ=255) tCGTGCCGTTTGTTTTTTCTGCGATAGTCACAAAGGTAATAGTTGAAATTCCCCTGCCACCTGGc  <  1:1284032/65‑1 (MQ=255) tCGTGCCGTTTGTTTTTTCTGCGATAGTCACAAAGGTAATAGTTGAAATTCCCCTGCCACCTGGc  <  1:1212007/65‑1 (MQ=255) tCGTGCCGTTTGTTTTTTCTGCGATAGTCACAAAGGTAATAGTTGAAATTCCCCTGCCACCTGGc  <  1:1193873/65‑1 (MQ=255) tCGTGCCGTTTGTTTTTTCTGCGATAGTCACAAAGGTAATAGTTGAAATTCCCCTGCCACCTGGc  <  1:1114937/65‑1 (MQ=255)          ttgtttTTTCTGCGATAGTCACAAAGGTAATAGTTGAAATTCCCCTGCCACCTGGc  <  1:225724/56‑1 (MQ=255)              tttttCTGCGATAGTCACAAAGGTAATAGTTGAAATTCCCCTGCCACCTGGc  <  1:2139289/52‑1 (MQ=255)               ttttCTGCGATAGTCACAAAGGTAATAGTTGAAATTCCCCTGCCACCTGGc  <  1:1344828/51‑1 (MQ=255)                                                                 | TCGTGCCGTTTGTTTTTTCTGCGATAGTCACAAAGGTAATAGTTGAAATTCCCCTGCCACCTGGC  >  minE/2838385‑2838449

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑