Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	minE	2860313	2860349	37	2 [0]	[0] 29	mutL	methyl‑directed mismatch repair protein

CTGCACTTGCGGCGAACAGTCAGAGTTTTGGTCGGGTACTGACTATCGTCCATTCCGACTGTGCGTT  >  minE/2860350‑2860416 |                                                                   cTGCACTTGCGGTGAACAGTCAGAGTTTTGGTCGGGTACTGACTATCGTCCATTCCGACTGTGCGtt  >  1:1032736/1‑67 (MQ=255) cTGCACTTGCGGCGAACAGTCAGAGTTTTGGTCGGGTACTGACTATCGTCCa                 >  1:2072763/1‑52 (MQ=255) cTGCACTTGCGGCGAACAGTCAGAGTTTTGGTCGGGTACTGACTATCGTCCATTCCGACTGTGCg    >  1:421573/1‑65 (MQ=255) cTGCACTTGCGGCGAACAGTCAGAGTTTTGGTCGGGTACTGACTATCGTCCATTCCGACTGTGCGtt  >  1:90909/1‑67 (MQ=255) cTGCACTTGCGGCGAACAGTCAGAGTTTTGGTCGGGTACTGACTATCGTCCATTCCGACTGTGCGtt  >  1:848821/1‑67 (MQ=255) cTGCACTTGCGGCGAACAGTCAGAGTTTTGGTCGGGTACTGACTATCGTCCATTCCGACTGTGCGtt  >  1:64156/1‑67 (MQ=255) cTGCACTTGCGGCGAACAGTCAGAGTTTTGGTCGGGTACTGACTATCGTCCATTCCGACTGTGCGtt  >  1:557176/1‑67 (MQ=255) cTGCACTTGCGGCGAACAGTCAGAGTTTTGGTCGGGTACTGACTATCGTCCATTCCGACTGTGCGtt  >  1:518024/1‑67 (MQ=255) cTGCACTTGCGGCGAACAGTCAGAGTTTTGGTCGGGTACTGACTATCGTCCATTCCGACTGTGCGtt  >  1:512515/1‑67 (MQ=255) cTGCACTTGCGGCGAACAGTCAGAGTTTTGGTCGGGTACTGACTATCGTCCATTCCGACTGTGCGtt  >  1:428599/1‑67 (MQ=255) cTGCACTTGCGGCGAACAGTCAGAGTTTTGGTCGGGTACTGACTATCGTCCATTCCGACTGTGCGtt  >  1:400905/1‑67 (MQ=255) cTGCACTTGCGGCGAACAGTCAGAGTTTTGGTCGGGTACTGACTATCGTCCATTCCGACTGTGCGtt  >  1:395780/1‑67 (MQ=255) cTGCACTTGCGGCGAACAGTCAGAGTTTTGGTCGGGTACTGACTATCGTCCATTCCGACTGTGCGtt  >  1:39136/1‑67 (MQ=255) cTGCACTTGCGGCGAACAGTCAGAGTTTTGGTCGGGTACTGACTATCGTCCATTCCGACTGTGCGtt  >  1:344227/1‑67 (MQ=255) cTGCACTTGCGGCGAACAGTCAGAGTTTTGGTCGGGTACTGACTATCGTCCATTCCGACTGTGCGtt  >  1:1997363/1‑67 (MQ=255) cTGCACTTGCGGCGAACAGTCAGAGTTTTGGTCGGGTACTGACTATCGTCCATTCCGACTGTGCGtt  >  1:1788234/1‑67 (MQ=255) cTGCACTTGCGGCGAACAGTCAGAGTTTTGGTCGGGTACTGACTATCGTCCATTCCGACTGTGCGtt  >  1:1593470/1‑67 (MQ=255) cTGCACTTGCGGCGAACAGTCAGAGTTTTGGTCGGGTACTGACTATCGTCCATTCCGACTGTGCGtt  >  1:1590654/1‑67 (MQ=255) cTGCACTTGCGGCGAACAGTCAGAGTTTTGGTCGGGTACTGACTATCGTCCATTCCGACTGTGCGtt  >  1:1561477/1‑67 (MQ=255) cTGCACTTGCGGCGAACAGTCAGAGTTTTGGTCGGGTACTGACTATCGTCCATTCCGACTGTGCGtt  >  1:1384139/1‑67 (MQ=255) cTGCACTTGCGGCGAACAGTCAGAGTTTTGGTCGGGTACTGACTATCGTCCATTCCGACTGTGCGtt  >  1:1380378/1‑67 (MQ=255) cTGCACTTGCGGCGAACAGTCAGAGTTTTGGTCGGGTACTGACTATCGTCCATTCCGACTGTGCGtt  >  1:1296680/1‑67 (MQ=255) cTGCACTTGCGGCGAACAGTCAGAGTTTTGGTCGGGTACTGACTATCGTCCATTCCGACTGTGCGtt  >  1:1218360/1‑67 (MQ=255) cTGCACTTGCGGCGAACAGTCAGAGTTTTGGTCGGGTACTGACTATCGTCCATTCCGACTGTGCGtt  >  1:1202958/1‑67 (MQ=255) cTGCACTTGCGGCGAACAGTCAGAGTTTTGGTCGGGTACTGACTATCGTCCATTCCGACTGTGCGtt  >  1:1082076/1‑67 (MQ=255) cTGCACTTGCGGCGAACAGTCAGAGTTTTGGTCGGGTACTGACTATCGTCCATTCCGACTGTGCGtt  >  1:1064584/1‑67 (MQ=255) cTGCACTTGCGGCGAACAGTCAGAGTTTTGGTCGGGTACTGACTATCGTCCATTCCGACTGTGCGt   >  1:1230505/1‑66 (MQ=255) cTGCACTTGCGGCGAACAGTCAGAGTTTTGGTCGGGTACTGACTATCGTCCATTCAGACTGTGCGtt  >  1:5844/1‑67 (MQ=255) cTGCACTTGCGGCGAACAGTCAGAGTTTTCGTCGGGTACTGACTATCGTCCATTCCGACTGTGCGtt  >  1:814955/1‑67 (MQ=255) |                                                                   CTGCACTTGCGGCGAACAGTCAGAGTTTTGGTCGGGTACTGACTATCGTCCATTCCGACTGTGCGTT  >  minE/2860350‑2860416

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑