Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	minE	245795	245796	2	23 [0]	[0] 19	phoB	DNA‑binding response regulator in two‑component regulatory system with PhoR (or CreC)

CAGTTCATCAAACACCTCAAGCGCGAGTCGATGACCCGGGATATTCCAGTGGTGATGT  >  minE/245797‑245854 |                                                          cAGTTCATCAAACACCTCAAGCGCGAGTCGATGATCCGGGATATTCCAGTGGTGATGt  <  1:1023429/58‑1 (MQ=255) cAGTTCATCAAACACCTCAAGCGCGAGTCGATGACCCGGGATATTCCAGTGGTGATGt  <  1:861473/58‑1 (MQ=255) cAGTTCATCAAACACCTCAAGCGCGAGTCGATGACCCGGGATATTCCAGTGGTGATGt  <  1:1020492/58‑1 (MQ=255) cAGTTCATCAAACACCTCAAGCGCGAGTCGATGACCCGGGATATTCCAGTGGTGATGt  <  1:697628/58‑1 (MQ=255) cAGTTCATCAAACACCTCAAGCGCGAGTCGATGACCCGGGATATTCCAGTGGTGATGt  <  1:687204/58‑1 (MQ=255) cAGTTCATCAAACACCTCAAGCGCGAGTCGATGACCCGGGATATTCCAGTGGTGATGt  <  1:395488/58‑1 (MQ=255) cAGTTCATCAAACACCTCAAGCGCGAGTCGATGACCCGGGATATTCCAGTGGTGATGt  <  1:24911/58‑1 (MQ=255) cAGTTCATCAAACACCTCAAGCGCGAGTCGATGACCCGGGATATTCCAGTGGTGATGt  <  1:2135542/58‑1 (MQ=255) cAGTTCATCAAACACCTCAAGCGCGAGTCGATGACCCGGGATATTCCAGTGGTGATGt  <  1:2075554/58‑1 (MQ=255) cAGTTCATCAAACACCTCAAGCGCGAGTCGATGACCCGGGATATTCCAGTGGTGATGt  <  1:2060328/58‑1 (MQ=255) cAGTTCATCAAACACCTCAAGCGCGAGTCGATGACCCGGGATATTCCAGTGGTGATGt  <  1:2042335/58‑1 (MQ=255) cAGTTCATCAAACACCTCAAGCGCGAGTCGATGACCCGGGATATTCCAGTGGTGATGt  <  1:186671/58‑1 (MQ=255) cAGTTCATCAAACACCTCAAGCGCGAGTCGATGACCCGGGATATTCCAGTGGTGATGt  <  1:1839739/58‑1 (MQ=255) cAGTTCATCAAACACCTCAAGCGCGAGTCGATGACCCGGGATATTCCAGTGGTGATGt  <  1:1793261/58‑1 (MQ=255) cAGTTCATCAAACACCTCAAGCGCGAGTCGATGACCCGGGATATTCCAGTGGTGATGt  <  1:1730329/58‑1 (MQ=255) cAGTTCATCAAACACCTCAAGCGCGAGTCGATGACCCGGGATATTCCAGTGGTGATGt  <  1:1627582/58‑1 (MQ=255) cAGTTCATCAAACACCTCAAGCGCGAGTCGATGACCCGGGATATTCCAGTGGTGATGt  <  1:1443411/58‑1 (MQ=255) cAGTTCATCAAACACCTCAAGCGCGAGTCGATGACCCGGGATATTCCAGTGGTGATGt  <  1:1325803/58‑1 (MQ=255) cAGTTCATCAAACACCTCAAGCGCGAGTCGATGACCCGGGATATTCCAGTGGTGATGt  <  1:1156798/58‑1 (MQ=255) |                                                          CAGTTCATCAAACACCTCAAGCGCGAGTCGATGACCCGGGATATTCCAGTGGTGATGT  >  minE/245797‑245854

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑