Missing coverage evidence...
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GGTGTTTTATCGCGGTCATTTCACAACGGTAAGCGGCTGATGGTGGAAGATTTTTACCGTGTCAGCG  >  minE/2941442‑2941508 |                                                                   ggTGTTTTATCGCGGTCATTTCACAACGGTAAGCGGCTGATGGTGGAAGATTTTTACCGTGTCAGCg  <  1:605238/67‑1 (MQ=255) ggTGTTTTATCGCGGTCATTTCACAACGGTAAGCGGCTGATGGTGGAAGATTTTTACCGTGTCAGCg  <  1:20350/67‑1 (MQ=255) ggTGTTTTATCGCGGTCATTTCACAACGGTAAGCGGCTGATGGTGGAAGATTTTTACCGTGTCAGCg  <  1:2057059/67‑1 (MQ=255) ggTGTTTTATCGCGGTCATTTCACAACGGTAAGCGGCTGATGGTGGAAGATTTTTACCGTGTCAGCg  <  1:2064429/67‑1 (MQ=255) ggTGTTTTATCGCGGTCATTTCACAACGGTAAGCGGCTGATGGTGGAAGATTTTTACCGTGTCAGCg  <  1:2107714/67‑1 (MQ=255) ggTGTTTTATCGCGGTCATTTCACAACGGTAAGCGGCTGATGGTGGAAGATTTTTACCGTGTCAGCg  <  1:272865/67‑1 (MQ=255) ggTGTTTTATCGCGGTCATTTCACAACGGTAAGCGGCTGATGGTGGAAGATTTTTACCGTGTCAGCg  <  1:323803/67‑1 (MQ=255) ggTGTTTTATCGCGGTCATTTCACAACGGTAAGCGGCTGATGGTGGAAGATTTTTACCGTGTCAGCg  <  1:355656/67‑1 (MQ=255) ggTGTTTTATCGCGGTCATTTCACAACGGTAAGCGGCTGATGGTGGAAGATTTTTACCGTGTCAGCg  <  1:377744/67‑1 (MQ=255) ggTGTTTTATCGCGGTCATTTCACAACGGTAAGCGGCTGATGGTGGAAGATTTTTACCGTGTCAGCg  <  1:419308/67‑1 (MQ=255) ggTGTTTTATCGCGGTCATTTCACAACGGTAAGCGGCTGATGGTGGAAGATTTTTACCGTGTCAGCg  <  1:441000/67‑1 (MQ=255) ggTGTTTTATCGCGGTCATTTCACAACGGTAAGCGGCTGATGGTGGAAGATTTTTACCGTGTCAGCg  <  1:1998998/67‑1 (MQ=255) ggTGTTTTATCGCGGTCATTTCACAACGGTAAGCGGCTGATGGTGGAAGATTTTTACCGTGTCAGCg  <  1:668790/67‑1 (MQ=255) ggTGTTTTATCGCGGTCATTTCACAACGGTAAGCGGCTGATGGTGGAAGATTTTTACCGTGTCAGCg  <  1:791383/67‑1 (MQ=255) ggTGTTTTATCGCGGTCATTTCACAACGGTAAGCGGCTGATGGTGGAAGATTTTTACCGTGTCAGCg  <  1:812663/67‑1 (MQ=255) ggTGTTTTATCGCGGTCATTTCACAACGGTAAGCGGCTGATGGTGGAAGATTTTTACCGTGTCAGCg  <  1:848847/67‑1 (MQ=255) ggTGTTTTATCGCGGTCATTTCACAACGGTAAGCGGCTGATGGTGGAAGATTTTTACCGTGTCAGCg  <  1:857399/67‑1 (MQ=255) ggTGTTTTATCGCGGTCATTTCACAACGGTAAGCGGCTGATGGTGGAAGATTTTTACCGTGTCAGCg  <  1:870146/67‑1 (MQ=255) ggTGTTTTATCGCGGTCATTTCACAACGGTAAGCGGCTGATGGTGGAAGATTTTTACCGTGTCAGCg  <  1:915910/67‑1 (MQ=255) ggTGTTTTATCGCGGTCATTTCACAACGGTAAGCGGCTGATGGTGGAAGATTTTTACCGTGTCAGCg  <  1:936703/67‑1 (MQ=255) ggTGTTTTATCGCGGTCATTTCACAACGGTAAGCGGCTGATGGTGGAAGATTTTTACCGTGTCAGCg  <  1:953613/67‑1 (MQ=255) ggTGTTTTATCGCGGTCATTTCACAACGGTAAGCGGCTGATGGTGGAAGATTTTTACCGTGTCAGCg  <  1:1463256/67‑1 (MQ=255) ggTGTTTTATCGCGGTCATTTCACAACGGTAAGCGGCTGATGGTGGAAGATTTTTACCGTGTCAGCg  <  1:1110406/67‑1 (MQ=255) ggTGTTTTATCGCGGTCATTTCACAACGGTAAGCGGCTGATGGTGGAAGATTTTTACCGTGTCAGCg  <  1:1218484/67‑1 (MQ=255) ggTGTTTTATCGCGGTCATTTCACAACGGTAAGCGGCTGATGGTGGAAGATTTTTACCGTGTCAGCg  <  1:1248315/67‑1 (MQ=255) ggTGTTTTATCGCGGTCATTTCACAACGGTAAGCGGCTGATGGTGGAAGATTTTTACCGTGTCAGCg  <  1:125163/67‑1 (MQ=255) ggTGTTTTATCGCGGTCATTTCACAACGGTAAGCGGCTGATGGTGGAAGATTTTTACCGTGTCAGCg  <  1:1273457/67‑1 (MQ=255) ggTGTTTTATCGCGGTCATTTCACAACGGTAAGCGGCTGATGGTGGAAGATTTTTACCGTGTCAGCg  <  1:1304254/67‑1 (MQ=255) ggTGTTTTATCGCGGTCATTTCACAACGGTAAGCGGCTGATGGTGGAAGATTTTTACCGTGTCAGCg  <  1:1306205/67‑1 (MQ=255) ggTGTTTTATCGCGGTCATTTCACAACGGTAAGCGGCTGATGGTGGAAGATTTTTACCGTGTCAGCg  <  1:1324506/67‑1 (MQ=255) ggTGTTTTATCGCGGTCATTTCACAACGGTAAGCGGCTGATGGTGGAAGATTTTTACCGTGTCAGCg  <  1:1461085/67‑1 (MQ=255) ggTGTTTTATCGCGGTCATTTCACAACGGTAAGCGGCTGATGGTGGAAGATTTTTACCGTGTCAGCg  <  1:1088474/67‑1 (MQ=255) ggTGTTTTATCGCGGTCATTTCACAACGGTAAGCGGCTGATGGTGGAAGATTTTTACCGTGTCAGCg  <  1:1530198/67‑1 (MQ=255) ggTGTTTTATCGCGGTCATTTCACAACGGTAAGCGGCTGATGGTGGAAGATTTTTACCGTGTCAGCg  <  1:1530385/67‑1 (MQ=255) ggTGTTTTATCGCGGTCATTTCACAACGGTAAGCGGCTGATGGTGGAAGATTTTTACCGTGTCAGCg  <  1:1576223/67‑1 (MQ=255) ggTGTTTTATCGCGGTCATTTCACAACGGTAAGCGGCTGATGGTGGAAGATTTTTACCGTGTCAGCg  <  1:1604199/67‑1 (MQ=255) ggTGTTTTATCGCGGTCATTTCACAACGGTAAGCGGCTGATGGTGGAAGATTTTTACCGTGTCAGCg  <  1:1734619/67‑1 (MQ=255) ggTGTTTTATCGCGGTCATTTCACAACGGTAAGCGGCTGATGGTGGAAGATTTTTACCGTGTCAGCg  <  1:1764613/67‑1 (MQ=255) ggTGTTTTATCGCGGTCATTTCACAACGGTAAGCGGCTGATGGTGGAAGATTTTTACCGTGTCAGCg  <  1:1768626/67‑1 (MQ=255) ggTGTTTTATCGCGGTCATTTCACAACGGTAAGCGGCTGATGGTGGAAGATTTTTACCGTGTCAGCg  <  1:178206/67‑1 (MQ=255) ggTGTTTTATCGCGGTCATTTCACAACGGTAAGCGGCTGATGGTGGAAGATTTTTACCGTGTCAGCg  <  1:1853732/67‑1 (MQ=255) |                                                                   GGTGTTTTATCGCGGTCATTTCACAACGGTAAGCGGCTGATGGTGGAAGATTTTTACCGTGTCAGCG  >  minE/2941442‑2941508

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑