Missing coverage evidence...
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CCACTTCCAGCCAGGACGAATACAACCAACCGCAGGTTAACATCTCGCTCGATAGCGCTGGTGGTA  >  minE/257101‑257166 |                                                                  ccACTTCCATCCAGGACGAATACAACCAACCGCAGGTTAACATCTCGCTCGATAGCGCTGGTGGTa  <  1:1272723/66‑1 (MQ=255) ccACTTCCAGCCAGGACGAATACAACCAACCGCAGGTTAACATCTCTCTCGATAGCGCTGGTGGTa  <  1:1463950/66‑1 (MQ=255) ccACTTCCAGCCAGGACGAATACAACCAACCGCAGGTTAACATCTCGCTCGATAGCGCTGGTGGTa  <  1:648829/66‑1 (MQ=255) ccACTTCCAGCCAGGACGAATACAACCAACCGCAGGTTAACATCTCGCTCGATAGCGCTGGTGGTa  <  1:1931471/66‑1 (MQ=255) ccACTTCCAGCCAGGACGAATACAACCAACCGCAGGTTAACATCTCGCTCGATAGCGCTGGTGGTa  <  1:2064439/66‑1 (MQ=255) ccACTTCCAGCCAGGACGAATACAACCAACCGCAGGTTAACATCTCGCTCGATAGCGCTGGTGGTa  <  1:315936/66‑1 (MQ=255) ccACTTCCAGCCAGGACGAATACAACCAACCGCAGGTTAACATCTCGCTCGATAGCGCTGGTGGTa  <  1:406563/66‑1 (MQ=255) ccACTTCCAGCCAGGACGAATACAACCAACCGCAGGTTAACATCTCGCTCGATAGCGCTGGTGGTa  <  1:497244/66‑1 (MQ=255) ccACTTCCAGCCAGGACGAATACAACCAACCGCAGGTTAACATCTCGCTCGATAGCGCTGGTGGTa  <  1:51099/66‑1 (MQ=255) ccACTTCCAGCCAGGACGAATACAACCAACCGCAGGTTAACATCTCGCTCGATAGCGCTGGTGGTa  <  1:568963/66‑1 (MQ=255) ccACTTCCAGCCAGGACGAATACAACCAACCGCAGGTTAACATCTCGCTCGATAGCGCTGGTGGTa  <  1:637311/66‑1 (MQ=255) ccACTTCCAGCCAGGACGAATACAACCAACCGCAGGTTAACATCTCGCTCGATAGCGCTGGTGGTa  <  1:1890309/66‑1 (MQ=255) ccACTTCCAGCCAGGACGAATACAACCAACCGCAGGTTAACATCTCGCTCGATAGCGCTGGTGGTa  <  1:75131/66‑1 (MQ=255) ccACTTCCAGCCAGGACGAATACAACCAACCGCAGGTTAACATCTCGCTCGATAGCGCTGGTGGTa  <  1:789245/66‑1 (MQ=255) ccACTTCCAGCCAGGACGAATACAACCAACCGCAGGTTAACATCTCGCTCGATAGCGCTGGTGGTa  <  1:866459/66‑1 (MQ=255) ccACTTCCAGCCAGGACGAATACAACCAACCGCAGGTTAACATCTCGCTCGATAGCGCTGGTGGTa  <  1:942137/66‑1 (MQ=255) ccACTTCCAGCCAGGACGAATACAACCAACCGCAGGTTAACATCTCGCTCGATAGCGCTGGTGGTa  <  1:942487/66‑1 (MQ=255) ccACTTCCAGCCAGGACGAATACAACCAACCGCAGGTTAACATCTCGCTCGATAGCGCTGGTGGTa  <  1:969614/66‑1 (MQ=255) ccACTTCCAGCCAGGACGAATACAACCAACCGCAGGTTAACATCTCGCTCGATAGCGCTGGTGGTa  <  1:990203/66‑1 (MQ=255) ccACTTCCAGCCAGGACGAATACAACCAACCGCAGGTTAACATCTCGCTCGATAGCGCTGGTGGTa  <  1:1923002/66‑1 (MQ=255) ccACTTCCAGCCAGGACGAATACAACCAACCGCAGGTTAACATCTCGCTCGATAGCGCTGGTGGTa  <  1:1056045/66‑1 (MQ=255) ccACTTCCAGCCAGGACGAATACAACCAACCGCAGGTTAACATCTCGCTCGATAGCGCTGGTGGTa  <  1:183871/66‑1 (MQ=255) ccACTTCCAGCCAGGACGAATACAACCAACCGCAGGTTAACATCTCGCTCGATAGCGCTGGTGGTa  <  1:1818818/66‑1 (MQ=255) ccACTTCCAGCCAGGACGAATACAACCAACCGCAGGTTAACATCTCGCTCGATAGCGCTGGTGGTa  <  1:1775461/66‑1 (MQ=255) ccACTTCCAGCCAGGACGAATACAACCAACCGCAGGTTAACATCTCGCTCGATAGCGCTGGTGGTa  <  1:1754768/66‑1 (MQ=255) ccACTTCCAGCCAGGACGAATACAACCAACCGCAGGTTAACATCTCGCTCGATAGCGCTGGTGGTa  <  1:1577920/66‑1 (MQ=255) ccACTTCCAGCCAGGACGAATACAACCAACCGCAGGTTAACATCTCGCTCGATAGCGCTGGTGGTa  <  1:1559019/66‑1 (MQ=255) ccACTTCCAGCCAGGACGAATACAACCAACCGCAGGTTAACATCTCGCTCGATAGCGCTGGTGGTa  <  1:1424783/66‑1 (MQ=255) ccACTTCCAGCCAGGACGAATACAACCAACCGCAGGTTAACATCTCGCTCGATAGCGCTGGTGGTa  <  1:1420797/66‑1 (MQ=255) ccACTTCCAGCCAGGACGAATACAACCAACCGCAGGTTAACATCTCGCTCGATAGCGCTGGTGGTa  <  1:1350346/66‑1 (MQ=255) ccACTTCCAGCCAGGACGAATACAACCAACCGCAGGTTAACATCTCGCTCGATAGCGCTGGTGGTa  <  1:1285777/66‑1 (MQ=255) ccACTTCCAGCCAGGACGAATACAACCAACCGCAGGTTAACATCTCGCTCGATAGCGCTGGTGGTa  <  1:1282019/66‑1 (MQ=255) ccACTTCCAGCCAGGACGAATACAACCAACCGCAGGTTAACATCTCGCTCGATAGCGCTGGTGGTa  <  1:1273505/66‑1 (MQ=255) ccACTTCCAGCCAGGACGAATACAACCAACCGCAGGTTAACATCTCGCTCGATAGCGCTGGTGGTa  <  1:1244108/66‑1 (MQ=255) ccACTTCCAGCCAGGACGAATACAACCAACCGCAGGTTAACATCTCGCTCGATAGCGCTGGTGGTa  <  1:1122209/66‑1 (MQ=255) |                                                                  CCACTTCCAGCCAGGACGAATACAACCAACCGCAGGTTAACATCTCGCTCGATAGCGCTGGTGGTA  >  minE/257101‑257166

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑