Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	minE	332908	332920	13	26 [0]	[0] 44	fsr	predicted fosmidomycin efflux system

TAGCCGACCACTGGTTGCAGTAGCGAAGAGGCGAGCTGGAAGGTGAGGGTTATCATGCCAATCTGCA  >  minE/332921‑332987 |                                                                   tAGCCGACCACTGGTTGCAGTCGCGAAGAGGCGAGCTGGAAGGTGAGGGTTATCATGCCAATCTGCa  <  1:1299779/67‑1 (MQ=255) tAGCCGACCACTGGTTGCAGTAGCGAAGAGGCGAGCTTGAAGGTGAGGGTTATCATGCCAATCTGCa  <  1:2129259/67‑1 (MQ=255) tAGCCGACCACTGGTTGCAGTAGCGAAGAGGCGAGCTGGAAGGTGAGGGTTATCATGCCAATCTGCa  <  1:654377/67‑1 (MQ=255) tAGCCGACCACTGGTTGCAGTAGCGAAGAGGCGAGCTGGAAGGTGAGGGTTATCATGCCAATCTGCa  <  1:1909103/67‑1 (MQ=255) tAGCCGACCACTGGTTGCAGTAGCGAAGAGGCGAGCTGGAAGGTGAGGGTTATCATGCCAATCTGCa  <  1:1936780/67‑1 (MQ=255) tAGCCGACCACTGGTTGCAGTAGCGAAGAGGCGAGCTGGAAGGTGAGGGTTATCATGCCAATCTGCa  <  1:1981625/67‑1 (MQ=255) tAGCCGACCACTGGTTGCAGTAGCGAAGAGGCGAGCTGGAAGGTGAGGGTTATCATGCCAATCTGCa  <  1:2043311/67‑1 (MQ=255) tAGCCGACCACTGGTTGCAGTAGCGAAGAGGCGAGCTGGAAGGTGAGGGTTATCATGCCAATCTGCa  <  1:2047404/67‑1 (MQ=255) tAGCCGACCACTGGTTGCAGTAGCGAAGAGGCGAGCTGGAAGGTGAGGGTTATCATGCCAATCTGCa  <  1:2084871/67‑1 (MQ=255) tAGCCGACCACTGGTTGCAGTAGCGAAGAGGCGAGCTGGAAGGTGAGGGTTATCATGCCAATCTGCa  <  1:2122874/67‑1 (MQ=255) tAGCCGACCACTGGTTGCAGTAGCGAAGAGGCGAGCTGGAAGGTGAGGGTTATCATGCCAATCTGCa  <  1:2153892/67‑1 (MQ=255) tAGCCGACCACTGGTTGCAGTAGCGAAGAGGCGAGCTGGAAGGTGAGGGTTATCATGCCAATCTGCa  <  1:412905/67‑1 (MQ=255) tAGCCGACCACTGGTTGCAGTAGCGAAGAGGCGAGCTGGAAGGTGAGGGTTATCATGCCAATCTGCa  <  1:513975/67‑1 (MQ=255) tAGCCGACCACTGGTTGCAGTAGCGAAGAGGCGAGCTGGAAGGTGAGGGTTATCATGCCAATCTGCa  <  1:1897674/67‑1 (MQ=255) tAGCCGACCACTGGTTGCAGTAGCGAAGAGGCGAGCTGGAAGGTGAGGGTTATCATGCCAATCTGCa  <  1:702785/67‑1 (MQ=255) tAGCCGACCACTGGTTGCAGTAGCGAAGAGGCGAGCTGGAAGGTGAGGGTTATCATGCCAATCTGCa  <  1:786773/67‑1 (MQ=255) tAGCCGACCACTGGTTGCAGTAGCGAAGAGGCGAGCTGGAAGGTGAGGGTTATCATGCCAATCTGCa  <  1:81772/67‑1 (MQ=255) tAGCCGACCACTGGTTGCAGTAGCGAAGAGGCGAGCTGGAAGGTGAGGGTTATCATGCCAATCTGCa  <  1:914693/67‑1 (MQ=255) tAGCCGACCACTGGTTGCAGTAGCGAAGAGGCGAGCTGGAAGGTGAGGGTTATCATGCCAATCTGCa  <  1:916420/67‑1 (MQ=255) tAGCCGACCACTGGTTGCAGTAGCGAAGAGGCGAGCTGGAAGGTGAGGGTTATCATGCCAATCTGCa  <  1:92427/67‑1 (MQ=255) tAGCCGACCACTGGTTGCAGTAGCGAAGAGGCGAGCTGGAAGGTGAGGGTTATCATGCCAATCTGCa  <  1:93566/67‑1 (MQ=255) tAGCCGACCACTGGTTGCAGTAGCGAAGAGGCGAGCTGGAAGGTGAGGGTTATCATGCCAATCTGCa  <  1:970085/67‑1 (MQ=255) tAGCCGACCACTGGTTGCAGTAGCGAAGAGGCGAGCTGGAAGGTGAGGGTTATCATGCCAATCTGCa  <  1:979132/67‑1 (MQ=255) tAGCCGACCACTGGTTGCAGTAGCGAAGAGGCGAGCTGGAAGGTGAGGGTTATCATGCCAATCTGCa  <  1:1543264/67‑1 (MQ=255) tAGCCGACCACTGGTTGCAGTAGCGAAGAGGCGAGCTGGAAGGTGAGGGTTATCATGCCAATCTGCa  <  1:1062562/67‑1 (MQ=255) tAGCCGACCACTGGTTGCAGTAGCGAAGAGGCGAGCTGGAAGGTGAGGGTTATCATGCCAATCTGCa  <  1:1253360/67‑1 (MQ=255) tAGCCGACCACTGGTTGCAGTAGCGAAGAGGCGAGCTGGAAGGTGAGGGTTATCATGCCAATCTGCa  <  1:1335628/67‑1 (MQ=255) tAGCCGACCACTGGTTGCAGTAGCGAAGAGGCGAGCTGGAAGGTGAGGGTTATCATGCCAATCTGCa  <  1:1343313/67‑1 (MQ=255) tAGCCGACCACTGGTTGCAGTAGCGAAGAGGCGAGCTGGAAGGTGAGGGTTATCATGCCAATCTGCa  <  1:1384089/67‑1 (MQ=255) tAGCCGACCACTGGTTGCAGTAGCGAAGAGGCGAGCTGGAAGGTGAGGGTTATCATGCCAATCTGCa  <  1:1393258/67‑1 (MQ=255) tAGCCGACCACTGGTTGCAGTAGCGAAGAGGCGAGCTGGAAGGTGAGGGTTATCATGCCAATCTGCa  <  1:140446/67‑1 (MQ=255) tAGCCGACCACTGGTTGCAGTAGCGAAGAGGCGAGCTGGAAGGTGAGGGTTATCATGCCAATCTGCa  <  1:1407643/67‑1 (MQ=255) tAGCCGACCACTGGTTGCAGTAGCGAAGAGGCGAGCTGGAAGGTGAGGGTTATCATGCCAATCTGCa  <  1:1413124/67‑1 (MQ=255) tAGCCGACCACTGGTTGCAGTAGCGAAGAGGCGAGCTGGAAGGTGAGGGTTATCATGCCAATCTGCa  <  1:1482046/67‑1 (MQ=255) tAGCCGACCACTGGTTGCAGTAGCGAAGAGGCGAGCTGGAAGGTGAGGGTTATCATGCCAATCTGCa  <  1:1019533/67‑1 (MQ=255) tAGCCGACCACTGGTTGCAGTAGCGAAGAGGCGAGCTGGAAGGTGAGGGTTATCATGCCAATCTGCa  <  1:1601946/67‑1 (MQ=255) tAGCCGACCACTGGTTGCAGTAGCGAAGAGGCGAGCTGGAAGGTGAGGGTTATCATGCCAATCTGCa  <  1:1669754/67‑1 (MQ=255) tAGCCGACCACTGGTTGCAGTAGCGAAGAGGCGAGCTGGAAGGTGAGGGTTATCATGCCAATCTGCa  <  1:1685880/67‑1 (MQ=255) tAGCCGACCACTGGTTGCAGTAGCGAAGAGGCGAGCTGGAAGGTGAGGGTTATCATGCCAATCTGCa  <  1:174720/67‑1 (MQ=255) tAGCCGACCACTGGTTGCAGTAGCGAAGAGGCGAGCTGGAAGGTGAGGGTTATCATGCCAATCTGCa  <  1:1802672/67‑1 (MQ=255) tAGCCGACCACTGGTTGCAGTAGCGAAGAGGCGAGCTGGAAGGTGAGGGTTATCATGCCAATCTGCa  <  1:1805306/67‑1 (MQ=255) tAGCCGACCACTGGTTGCAGTAGCGAAGAGGCGAGCTGGAAGGTGAGGGTTATCATGCCAATCTGCa  <  1:1847297/67‑1 (MQ=255) tAGCCGACCACTGGTTGCAGTAGCGAAGAGGCGAGCTGGAAGGTGAGGGTTATCATGCCAATCTGCa  <  1:1856606/67‑1 (MQ=255) tAGCCGACCACTGGTTGCAGTAGCGAAGAGGCGAGCTGGAAGGTGAGGGTTATCATGCCAATCTGCa  <  1:188645/67‑1 (MQ=255) |                                                                   TAGCCGACCACTGGTTGCAGTAGCGAAGAGGCGAGCTGGAAGGTGAGGGTTATCATGCCAATCTGCA  >  minE/332921‑332987

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑