Missing coverage evidence...
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CGTATCGTGTTGGTTTACCGGGCAAAAGCGGTGTAGGTGGCGGTATTCTGGCGGTCGTCCCTGGAGT  >  minE/340861‑340927 |                                                                   cGTATCGTGTTGGTTTACCGGGCAAAAGCGGTGTAGGTGGCTGTATTCTGGCGGTCGTCCCTGGAGt  <  1:1745957/67‑1 (MQ=255) cGTATCGTGTTGGTTTACCGGGCAAAAGCGGTGTAGGTGGCGGTATTCTGGCGGTCGTCCCTTGAGt  <  1:5093/67‑1 (MQ=255) cGTATCGTGTTGGTTTACCGGGCAAAAGCGGTGTAGGTGGCGGTATTCTGGCGGTCGTCCCTGGAGt  <  1:30046/67‑1 (MQ=255) cGTATCGTGTTGGTTTACCGGGCAAAAGCGGTGTAGGTGGCGGTATTCTGGCGGTCGTCCCTGGAGt  <  1:927791/67‑1 (MQ=255) cGTATCGTGTTGGTTTACCGGGCAAAAGCGGTGTAGGTGGCGGTATTCTGGCGGTCGTCCCTGGAGt  <  1:870266/67‑1 (MQ=255) cGTATCGTGTTGGTTTACCGGGCAAAAGCGGTGTAGGTGGCGGTATTCTGGCGGTCGTCCCTGGAGt  <  1:744065/67‑1 (MQ=255) cGTATCGTGTTGGTTTACCGGGCAAAAGCGGTGTAGGTGGCGGTATTCTGGCGGTCGTCCCTGGAGt  <  1:695316/67‑1 (MQ=255) cGTATCGTGTTGGTTTACCGGGCAAAAGCGGTGTAGGTGGCGGTATTCTGGCGGTCGTCCCTGGAGt  <  1:594467/67‑1 (MQ=255) cGTATCGTGTTGGTTTACCGGGCAAAAGCGGTGTAGGTGGCGGTATTCTGGCGGTCGTCCCTGGAGt  <  1:557298/67‑1 (MQ=255) cGTATCGTGTTGGTTTACCGGGCAAAAGCGGTGTAGGTGGCGGTATTCTGGCGGTCGTCCCTGGAGt  <  1:551420/67‑1 (MQ=255) cGTATCGTGTTGGTTTACCGGGCAAAAGCGGTGTAGGTGGCGGTATTCTGGCGGTCGTCCCTGGAGt  <  1:545119/67‑1 (MQ=255) cGTATCGTGTTGGTTTACCGGGCAAAAGCGGTGTAGGTGGCGGTATTCTGGCGGTCGTCCCTGGAGt  <  1:41779/67‑1 (MQ=255) cGTATCGTGTTGGTTTACCGGGCAAAAGCGGTGTAGGTGGCGGTATTCTGGCGGTCGTCCCTGGAGt  <  1:36272/67‑1 (MQ=255) cGTATCGTGTTGGTTTACCGGGCAAAAGCGGTGTAGGTGGCGGTATTCTGGCGGTCGTCCCTGGAGt  <  1:1789451/67‑1 (MQ=255) cGTATCGTGTTGGTTTACCGGGCAAAAGCGGTGTAGGTGGCGGTATTCTGGCGGTCGTCCCTGGAGt  <  1:1775510/67‑1 (MQ=255) cGTATCGTGTTGGTTTACCGGGCAAAAGCGGTGTAGGTGGCGGTATTCTGGCGGTCGTCCCTGGAGt  <  1:1721841/67‑1 (MQ=255) cGTATCGTGTTGGTTTACCGGGCAAAAGCGGTGTAGGTGGCGGTATTCTGGCGGTCGTCCCTGGAGt  <  1:1631102/67‑1 (MQ=255) cGTATCGTGTTGGTTTACCGGGCAAAAGCGGTGTAGGTGGCGGTATTCTGGCGGTCGTCCCTGGAGt  <  1:1498205/67‑1 (MQ=255) cGTATCGTGTTGGTTTACCGGGCAAAAGCGGTGTAGGTGGCGGTATTCTGGCGGTCGTCCCTGGAGt  <  1:1464303/67‑1 (MQ=255) cGTATCGTGTTGGTTTACCGGGCAAAAGCGGTGTAGGTGGCGGTATTCTGGCGGTCGTCCCTGGAGt  <  1:1414189/67‑1 (MQ=255) cGTATCGTGTTGGTTTACCGGGCAAAAGCGGTGTAGGTGGCGGTATTCTGGCGGTCGTCCCTGGAGt  <  1:1361913/67‑1 (MQ=255) cGTATCGTGTTGGTTTACCGGGCAAAAGCGGTGTAGGTGGCGGTATTCTGGCGGTCGTCCCTGGAGt  <  1:11895/67‑1 (MQ=255) cGTATCGTGTTGGTTTACCGGGCAAAAGCGGTGTAGGTGGCGGTATTCTGGCGGTCGTCCCTGGAGt  <  1:1091160/67‑1 (MQ=255) cGTATCGTGTTGGTTTACCGGGCAAAAGCGGTGTAGGTGGCGGTATTCTGGCGGTCGTCCCCGGAGt  <  1:1048361/67‑1 (MQ=255) cGTATCGTGTTGGTTTACCGGGCAAAAGCGGTGTAGGTGGCGGGATTCTGGCGGTCGTCCCTGGAGt  <  1:330177/67‑1 (MQ=255) |                                                                   CGTATCGTGTTGGTTTACCGGGCAAAAGCGGTGTAGGTGGCGGTATTCTGGCGGTCGTCCCTGGAGT  >  minE/340861‑340927

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑