Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	minE	403700	403810	111	5 [0]	[0] 45	mrdB	cell wall shape‑determining protein

CAGTAAGATCAGCAGCATTGTGGGATCGAGATGGACTTTATCCCAGAATGTTTTTTTATTCGGATTA  >  minE/403811‑403877 |                                                                   cAGTAAGATCAGCAGCATTGTGGGATCGAGATGGACTTTATCCCAGAATGTTTTTTTATTCGGAtt   >  1:1200006/1‑66 (MQ=255) cAGTAAGATCAGCAGCATTGTGGGATCGAGATGGACTTTATCCCAGAATGTTTTTTTATTCGGAtt   >  1:936810/1‑66 (MQ=255) cAGTAAGATCAGCAGCATTGTGGGATCGAGATGGACTTTATCCCAGAATGTTTTTTTATTCGGAtt   >  1:294190/1‑66 (MQ=255) cAGTAAGATCAGCAGCATTGTGGGATCGAGATGGACTTTATCCCAGAATGTTTTTTTATTCGGATTa  >  1:530796/1‑67 (MQ=255) cAGTAAGATCAGCAGCATTGTGGGATCGAGATGGACTTTATCCCAGAATGTTTTTTTATTCGGATTa  >  1:1978271/1‑67 (MQ=255) cAGTAAGATCAGCAGCATTGTGGGATCGAGATGGACTTTATCCCAGAATGTTTTTTTATTCGGATTa  >  1:2137939/1‑67 (MQ=255) cAGTAAGATCAGCAGCATTGTGGGATCGAGATGGACTTTATCCCAGAATGTTTTTTTATTCGGATTa  >  1:2147560/1‑67 (MQ=255) cAGTAAGATCAGCAGCATTGTGGGATCGAGATGGACTTTATCCCAGAATGTTTTTTTATTCGGATTa  >  1:258573/1‑67 (MQ=255) cAGTAAGATCAGCAGCATTGTGGGATCGAGATGGACTTTATCCCAGAATGTTTTTTTATTCGGATTa  >  1:334525/1‑67 (MQ=255) cAGTAAGATCAGCAGCATTGTGGGATCGAGATGGACTTTATCCCAGAATGTTTTTTTATTCGGATTa  >  1:415036/1‑67 (MQ=255) cAGTAAGATCAGCAGCATTGTGGGATCGAGATGGACTTTATCCCAGAATGTTTTTTTATTCGGATTa  >  1:415790/1‑67 (MQ=255) cAGTAAGATCAGCAGCATTGTGGGATCGAGATGGACTTTATCCCAGAATGTTTTTTTATTCGGATTa  >  1:429163/1‑67 (MQ=255) cAGTAAGATCAGCAGCATTGTGGGATCGAGATGGACTTTATCCCAGAATGTTTTTTTATTCGGATTa  >  1:481033/1‑67 (MQ=255) cAGTAAGATCAGCAGCATTGTGGGATCGAGATGGACTTTATCCCAGAATGTTTTTTTATTCGGATTa  >  1:500163/1‑67 (MQ=255) cAGTAAGATCAGCAGCATTGTGGGATCGAGATGGACTTTATCCCAGAATGTTTTTTTATTCGGATTa  >  1:1907833/1‑67 (MQ=255) cAGTAAGATCAGCAGCATTGTGGGATCGAGATGGACTTTATCCCAGAATGTTTTTTTATTCGGATTa  >  1:634598/1‑67 (MQ=255) cAGTAAGATCAGCAGCATTGTGGGATCGAGATGGACTTTATCCCAGAATGTTTTTTTATTCGGATTa  >  1:81368/1‑67 (MQ=255) cAGTAAGATCAGCAGCATTGTGGGATCGAGATGGACTTTATCCCAGAATGTTTTTTTATTCGGATTa  >  1:826167/1‑67 (MQ=255) cAGTAAGATCAGCAGCATTGTGGGATCGAGATGGACTTTATCCCAGAATGTTTTTTTATTCGGATTa  >  1:834781/1‑67 (MQ=255) cAGTAAGATCAGCAGCATTGTGGGATCGAGATGGACTTTATCCCAGAATGTTTTTTTATTCGGATTa  >  1:887917/1‑67 (MQ=255) cAGTAAGATCAGCAGCATTGTGGGATCGAGATGGACTTTATCCCAGAATGTTTTTTTATTCGGATTa  >  1:948922/1‑67 (MQ=255) cAGTAAGATCAGCAGCATTGTGGGATCGAGATGGACTTTATCCCAGAATGTTTTTTTATTCGGATTa  >  1:953423/1‑67 (MQ=255) cAGTAAGATCAGCAGCATTGTGGGATCGAGATGGACTTTATCCCAGAATGTTTTTTTATTCGGATTa  >  1:969111/1‑67 (MQ=255) cAGTAAGATCAGCAGCATTGTGGGATCGAGATGGACTTTATCCCAGAATGTTTTTTTATTCGGATTa  >  1:1588246/1‑67 (MQ=255) cAGTAAGATCAGCAGCATTGTGGGATCGAGATGGACTTTATCCCAGAATGTTTTTTTATTCGGATTa  >  1:1076640/1‑67 (MQ=255) cAGTAAGATCAGCAGCATTGTGGGATCGAGATGGACTTTATCCCAGAATGTTTTTTTATTCGGATTa  >  1:1095399/1‑67 (MQ=255) cAGTAAGATCAGCAGCATTGTGGGATCGAGATGGACTTTATCCCAGAATGTTTTTTTATTCGGATTa  >  1:1115071/1‑67 (MQ=255) cAGTAAGATCAGCAGCATTGTGGGATCGAGATGGACTTTATCCCAGAATGTTTTTTTATTCGGATTa  >  1:1211181/1‑67 (MQ=255) cAGTAAGATCAGCAGCATTGTGGGATCGAGATGGACTTTATCCCAGAATGTTTTTTTATTCGGATTa  >  1:1217939/1‑67 (MQ=255) cAGTAAGATCAGCAGCATTGTGGGATCGAGATGGACTTTATCCCAGAATGTTTTTTTATTCGGATTa  >  1:1237473/1‑67 (MQ=255) cAGTAAGATCAGCAGCATTGTGGGATCGAGATGGACTTTATCCCAGAATGTTTTTTTATTCGGATTa  >  1:1384324/1‑67 (MQ=255) cAGTAAGATCAGCAGCATTGTGGGATCGAGATGGACTTTATCCCAGAATGTTTTTTTATTCGGATTa  >  1:1501741/1‑67 (MQ=255) cAGTAAGATCAGCAGCATTGTGGGATCGAGATGGACTTTATCCCAGAATGTTTTTTTATTCGGATTa  >  1:1515483/1‑67 (MQ=255) cAGTAAGATCAGCAGCATTGTGGGATCGAGATGGACTTTATCCCAGAATGTTTTTTTATTCGGATTa  >  1:1563363/1‑67 (MQ=255) cAGTAAGATCAGCAGCATTGTGGGATCGAGATGGACTTTATCCCAGAATGTTTTTTTATTCGGATTa  >  1:1967219/1‑67 (MQ=255) cAGTAAGATCAGCAGCATTGTGGGATCGAGATGGACTTTATCCCAGAATGTTTTTTTATTCGGATTa  >  1:1594979/1‑67 (MQ=255) cAGTAAGATCAGCAGCATTGTGGGATCGAGATGGACTTTATCCCAGAATGTTTTTTTATTCGGATTa  >  1:1636880/1‑67 (MQ=255) cAGTAAGATCAGCAGCATTGTGGGATCGAGATGGACTTTATCCCAGAATGTTTTTTTATTCGGATTa  >  1:1642552/1‑67 (MQ=255) cAGTAAGATCAGCAGCATTGTGGGATCGAGATGGACTTTATCCCAGAATGTTTTTTTATTCGGATTa  >  1:1706028/1‑67 (MQ=255) cAGTAAGATCAGCAGCATTGTGGGATCGAGATGGACTTTATCCCAGAATGTTTTTTTATTCGGATTa  >  1:1708984/1‑67 (MQ=255) cAGTAAGATCAGCAGCATTGTGGGATCGAGATGGACTTTATCCCAGAATGTTTTTTTATTCGGATTa  >  1:1718731/1‑67 (MQ=255) cAGTAAGATCAGCAGCATTGTGGGATCGAGATGGACTTTATCCCAGAATGTTTTTTTATTCGGATTa  >  1:1728766/1‑67 (MQ=255) cAGTAAGATCAGCAGCATTGTGGGATCGAGATGGACTTTATCCCAGAATGTTTTTTTATTCGGATTa  >  1:173981/1‑67 (MQ=255) cAGTAAGATCAGCAGCATTGTGGGATCGAGATGGACTTTATCCCAGAATGTTTTTTTATTCGGATTa  >  1:1753298/1‑67 (MQ=255) cAGTAAGATCAGCAGCATTGTGGGATCGAGATGGACTTTATCCCAGAATGTTTTTTTATTCGGATTa  >  1:1020884/1‑67 (MQ=255) |                                                                   CAGTAAGATCAGCAGCATTGTGGGATCGAGATGGACTTTATCCCAGAATGTTTTTTTATTCGGATTA  >  minE/403811‑403877

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑