Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	minE	445386	445395	10	6 [0]	[0] 36	kdpD	fused sensory histidine kinase in two‑component regulatory system with KdpE

CAACGTGGATTAAGGTCAGCGGTTCTGGCAGAGAAAGATTGATGGGCGACGATAAACCCGGTTCCAG  >  minE/445396‑445462 |                                                                   cAACGTTGATTAAGGTCAGCGGTTCTGGCAGAGAAAGATTGATGGGCGACGATAAACCCGGTTCCAg  <  1:883171/67‑1 (MQ=255) cAACGTGTATTAAGGTCAGCGGTTCTGGCAGAGAAAGATTGATGGGCGACGATAAACCCGGTTCCAg  <  1:1993549/67‑1 (MQ=255) cAACGTGGATTAAGGTCAGCGGTTCTGGCAGAGATAGATTGATGGGCGACGATAAACCCGGTTCCAg  <  1:1616488/67‑1 (MQ=255) cAACGTGGATTAAGGTCAGCGGTTCTGGCAGAGAAAGATTGATGGGCGACGATAAACCCGGTTCCAg  <  1:403367/67‑1 (MQ=255) cAACGTGGATTAAGGTCAGCGGTTCTGGCAGAGAAAGATTGATGGGCGACGATAAACCCGGTTCCAg  <  1:2045085/67‑1 (MQ=255) cAACGTGGATTAAGGTCAGCGGTTCTGGCAGAGAAAGATTGATGGGCGACGATAAACCCGGTTCCAg  <  1:2056330/67‑1 (MQ=255) cAACGTGGATTAAGGTCAGCGGTTCTGGCAGAGAAAGATTGATGGGCGACGATAAACCCGGTTCCAg  <  1:258675/67‑1 (MQ=255) cAACGTGGATTAAGGTCAGCGGTTCTGGCAGAGAAAGATTGATGGGCGACGATAAACCCGGTTCCAg  <  1:270294/67‑1 (MQ=255) cAACGTGGATTAAGGTCAGCGGTTCTGGCAGAGAAAGATTGATGGGCGACGATAAACCCGGTTCCAg  <  1:290022/67‑1 (MQ=255) cAACGTGGATTAAGGTCAGCGGTTCTGGCAGAGAAAGATTGATGGGCGACGATAAACCCGGTTCCAg  <  1:371916/67‑1 (MQ=255) cAACGTGGATTAAGGTCAGCGGTTCTGGCAGAGAAAGATTGATGGGCGACGATAAACCCGGTTCCAg  <  1:390412/67‑1 (MQ=255) cAACGTGGATTAAGGTCAGCGGTTCTGGCAGAGAAAGATTGATGGGCGACGATAAACCCGGTTCCAg  <  1:991771/67‑1 (MQ=255) cAACGTGGATTAAGGTCAGCGGTTCTGGCAGAGAAAGATTGATGGGCGACGATAAACCCGGTTCCAg  <  1:650233/67‑1 (MQ=255) cAACGTGGATTAAGGTCAGCGGTTCTGGCAGAGAAAGATTGATGGGCGACGATAAACCCGGTTCCAg  <  1:714310/67‑1 (MQ=255) cAACGTGGATTAAGGTCAGCGGTTCTGGCAGAGAAAGATTGATGGGCGACGATAAACCCGGTTCCAg  <  1:756021/67‑1 (MQ=255) cAACGTGGATTAAGGTCAGCGGTTCTGGCAGAGAAAGATTGATGGGCGACGATAAACCCGGTTCCAg  <  1:857321/67‑1 (MQ=255) cAACGTGGATTAAGGTCAGCGGTTCTGGCAGAGAAAGATTGATGGGCGACGATAAACCCGGTTCCAg  <  1:911787/67‑1 (MQ=255) cAACGTGGATTAAGGTCAGCGGTTCTGGCAGAGAAAGATTGATGGGCGACGATAAACCCGGTTCCAg  <  1:969988/67‑1 (MQ=255) cAACGTGGATTAAGGTCAGCGGTTCTGGCAGAGAAAGATTGATGGGCGACGATAAACCCGGTTCCAg  <  1:1000534/67‑1 (MQ=255) cAACGTGGATTAAGGTCAGCGGTTCTGGCAGAGAAAGATTGATGGGCGACGATAAACCCGGTTCCAg  <  1:1328739/67‑1 (MQ=255) cAACGTGGATTAAGGTCAGCGGTTCTGGCAGAGAAAGATTGATGGGCGACGATAAACCCGGTTCCAg  <  1:1030186/67‑1 (MQ=255) cAACGTGGATTAAGGTCAGCGGTTCTGGCAGAGAAAGATTGATGGGCGACGATAAACCCGGTTCCAg  <  1:1034324/67‑1 (MQ=255) cAACGTGGATTAAGGTCAGCGGTTCTGGCAGAGAAAGATTGATGGGCGACGATAAACCCGGTTCCAg  <  1:1087790/67‑1 (MQ=255) cAACGTGGATTAAGGTCAGCGGTTCTGGCAGAGAAAGATTGATGGGCGACGATAAACCCGGTTCCAg  <  1:1118905/67‑1 (MQ=255) cAACGTGGATTAAGGTCAGCGGTTCTGGCAGAGAAAGATTGATGGGCGACGATAAACCCGGTTCCAg  <  1:1194064/67‑1 (MQ=255) cAACGTGGATTAAGGTCAGCGGTTCTGGCAGAGAAAGATTGATGGGCGACGATAAACCCGGTTCCAg  <  1:1247843/67‑1 (MQ=255) cAACGTGGATTAAGGTCAGCGGTTCTGGCAGAGAAAGATTGATGGGCGACGATAAACCCGGTTCCAg  <  1:1284026/67‑1 (MQ=255) cAACGTGGATTAAGGTCAGCGGTTCTGGCAGAGAAAGATTGATGGGCGACGATAAACCCGGTTCCAg  <  1:1997819/67‑1 (MQ=255) cAACGTGGATTAAGGTCAGCGGTTCTGGCAGAGAAAGATTGATGGGCGACGATAAACCCGGTTCCAg  <  1:1346645/67‑1 (MQ=255) cAACGTGGATTAAGGTCAGCGGTTCTGGCAGAGAAAGATTGATGGGCGACGATAAACCCGGTTCCAg  <  1:1433338/67‑1 (MQ=255) cAACGTGGATTAAGGTCAGCGGTTCTGGCAGAGAAAGATTGATGGGCGACGATAAACCCGGTTCCAg  <  1:1442197/67‑1 (MQ=255) cAACGTGGATTAAGGTCAGCGGTTCTGGCAGAGAAAGATTGATGGGCGACGATAAACCCGGTTCCAg  <  1:1485265/67‑1 (MQ=255) cAACGTGGATTAAGGTCAGCGGTTCTGGCAGAGAAAGATTGATGGGCGACGATAAACCCGGTTCCAg  <  1:1538687/67‑1 (MQ=255) cAACGTGGATTAAGGTCAGCGGTTCTGGCAGAGAAAGATTGATGGGCGACGATAAACCCGGTTCCAg  <  1:1732677/67‑1 (MQ=255) cAACGTGGATTAAGGTCAGCGGTTCTGGCAGAGAAAGATTGATGGGCGACGATAAACCCGGTTCCAg  <  1:1833034/67‑1 (MQ=255) cAACGTGGATTAAGGTCAGCGGTGCTGGCAGAGAAAGATTGATGGGCGACGATAAACCCGGTTCCAg  <  1:132123/67‑1 (MQ=255) |                                                                   CAACGTGGATTAAGGTCAGCGGTTCTGGCAGAGAAAGATTGATGGGCGACGATAAACCCGGTTCCAG  >  minE/445396‑445462

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑