Missing coverage evidence...
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GTTGTATATCGCTACACCACGCCAGTGGGCGACGCATAACATGTCGCCGCGTCAGGCTGAACTTA  >  minE/452133‑452197 |                                                                 gTTGTATATCGCTACACCACGCCAGTGGGCGACGCATAACATGTCGCCGCTTCAGGCTGAACTTa  <  1:2101858/65‑1 (MQ=255) gTTGTATATCGCTACACCACGCCAGTGGGCGACGCATAACATGTCGCCGCGTCAGGCTGAACTTa  <  1:574755/65‑1 (MQ=255) gTTGTATATCGCTACACCACGCCAGTGGGCGACGCATAACATGTCGCCGCGTCAGGCTGAACTTa  <  1:2138336/65‑1 (MQ=255) gTTGTATATCGCTACACCACGCCAGTGGGCGACGCATAACATGTCGCCGCGTCAGGCTGAACTTa  <  1:247271/65‑1 (MQ=255) gTTGTATATCGCTACACCACGCCAGTGGGCGACGCATAACATGTCGCCGCGTCAGGCTGAACTTa  <  1:257517/65‑1 (MQ=255) gTTGTATATCGCTACACCACGCCAGTGGGCGACGCATAACATGTCGCCGCGTCAGGCTGAACTTa  <  1:26172/65‑1 (MQ=255) gTTGTATATCGCTACACCACGCCAGTGGGCGACGCATAACATGTCGCCGCGTCAGGCTGAACTTa  <  1:330480/65‑1 (MQ=255) gTTGTATATCGCTACACCACGCCAGTGGGCGACGCATAACATGTCGCCGCGTCAGGCTGAACTTa  <  1:333347/65‑1 (MQ=255) gTTGTATATCGCTACACCACGCCAGTGGGCGACGCATAACATGTCGCCGCGTCAGGCTGAACTTa  <  1:35856/65‑1 (MQ=255) gTTGTATATCGCTACACCACGCCAGTGGGCGACGCATAACATGTCGCCGCGTCAGGCTGAACTTa  <  1:380773/65‑1 (MQ=255) gTTGTATATCGCTACACCACGCCAGTGGGCGACGCATAACATGTCGCCGCGTCAGGCTGAACTTa  <  1:520738/65‑1 (MQ=255) gTTGTATATCGCTACACCACGCCAGTGGGCGACGCATAACATGTCGCCGCGTCAGGCTGAACTTa  <  1:561176/65‑1 (MQ=255) gTTGTATATCGCTACACCACGCCAGTGGGCGACGCATAACATGTCGCCGCGTCAGGCTGAACTTa  <  1:978809/65‑1 (MQ=255) gTTGTATATCGCTACACCACGCCAGTGGGCGACGCATAACATGTCGCCGCGTCAGGCTGAACTTa  <  1:657395/65‑1 (MQ=255) gTTGTATATCGCTACACCACGCCAGTGGGCGACGCATAACATGTCGCCGCGTCAGGCTGAACTTa  <  1:706392/65‑1 (MQ=255) gTTGTATATCGCTACACCACGCCAGTGGGCGACGCATAACATGTCGCCGCGTCAGGCTGAACTTa  <  1:726321/65‑1 (MQ=255) gTTGTATATCGCTACACCACGCCAGTGGGCGACGCATAACATGTCGCCGCGTCAGGCTGAACTTa  <  1:747288/65‑1 (MQ=255) gTTGTATATCGCTACACCACGCCAGTGGGCGACGCATAACATGTCGCCGCGTCAGGCTGAACTTa  <  1:785860/65‑1 (MQ=255) gTTGTATATCGCTACACCACGCCAGTGGGCGACGCATAACATGTCGCCGCGTCAGGCTGAACTTa  <  1:794892/65‑1 (MQ=255) gTTGTATATCGCTACACCACGCCAGTGGGCGACGCATAACATGTCGCCGCGTCAGGCTGAACTTa  <  1:831664/65‑1 (MQ=255) gTTGTATATCGCTACACCACGCCAGTGGGCGACGCATAACATGTCGCCGCGTCAGGCTGAACTTa  <  1:854460/65‑1 (MQ=255) gTTGTATATCGCTACACCACGCCAGTGGGCGACGCATAACATGTCGCCGCGTCAGGCTGAACTTa  <  1:878200/65‑1 (MQ=255) gTTGTATATCGCTACACCACGCCAGTGGGCGACGCATAACATGTCGCCGCGTCAGGCTGAACTTa  <  1:1039342/65‑1 (MQ=255) gTTGTATATCGCTACACCACGCCAGTGGGCGACGCATAACATGTCGCCGCGTCAGGCTGAACTTa  <  1:1787518/65‑1 (MQ=255) gTTGTATATCGCTACACCACGCCAGTGGGCGACGCATAACATGTCGCCGCGTCAGGCTGAACTTa  <  1:1042924/65‑1 (MQ=255) gTTGTATATCGCTACACCACGCCAGTGGGCGACGCATAACATGTCGCCGCGTCAGGCTGAACTTa  <  1:1095000/65‑1 (MQ=255) gTTGTATATCGCTACACCACGCCAGTGGGCGACGCATAACATGTCGCCGCGTCAGGCTGAACTTa  <  1:1122943/65‑1 (MQ=255) gTTGTATATCGCTACACCACGCCAGTGGGCGACGCATAACATGTCGCCGCGTCAGGCTGAACTTa  <  1:1162841/65‑1 (MQ=255) gTTGTATATCGCTACACCACGCCAGTGGGCGACGCATAACATGTCGCCGCGTCAGGCTGAACTTa  <  1:14252/65‑1 (MQ=255) gTTGTATATCGCTACACCACGCCAGTGGGCGACGCATAACATGTCGCCGCGTCAGGCTGAACTTa  <  1:145514/65‑1 (MQ=255) gTTGTATATCGCTACACCACGCCAGTGGGCGACGCATAACATGTCGCCGCGTCAGGCTGAACTTa  <  1:1461911/65‑1 (MQ=255) gTTGTATATCGCTACACCACGCCAGTGGGCGACGCATAACATGTCGCCGCGTCAGGCTGAACTTa  <  1:1677156/65‑1 (MQ=255) gTTGTATATCGCTACACCACGCCAGTGGGCGACGCATAACATGTCGCCGCGTCAGGCTGAACTTa  <  1:172798/65‑1 (MQ=255) gTTGTATATCGCTACACCACGCCAGTGGGCGACGCATAACATGTCGCCGCGTCAGGCTGAACTTa  <  1:1760431/65‑1 (MQ=255) gTTGTATATCGCTACACCACGCCAGTGGGCGACGCATAACATGTCGCCGCGTCAGGCTGAACTTa  <  1:2085941/65‑1 (MQ=255) gTTGTATATCGCTACACCACGCCAGTGGGCGACGCATAACATGTCGCCGCGTCAGGCTGAACTTa  <  1:180393/65‑1 (MQ=255) gTTGTATATCGCTACACCACGCCAGTGGGCGACGCATAACATGTCGCCGCGTCAGGCTGAACTTa  <  1:1818299/65‑1 (MQ=255) gTTGTATATCGCTACACCACGCCAGTGGGCGACGCATAACATGTCGCCGCGTCAGGCTGAACTTa  <  1:1828340/65‑1 (MQ=255) gTTGTATATCGCTACACCACGCCAGTGGGCGACGCATAACATGTCGCCGCGTCAGGCTGAACTTa  <  1:188373/65‑1 (MQ=255) gTTGTATATCGCTACACCACGCCAGTGGGCGACGCATAACATGTCGCCGCGTCAGGCTGAACTTa  <  1:1905467/65‑1 (MQ=255) gTTGTATATCGCTACACCACGCCAGTGGGCGACGCATAACATGTCGCCGCGTCAGGCTGAACTTa  <  1:2025862/65‑1 (MQ=255) gTTGTATATCGCTACACCACGCCAGTGGGCGACGCATAACATGTCGCCGCGTCAGGCTGAACTTa  <  1:2054927/65‑1 (MQ=255) gTTGTATATCGCTACACCACGCCAGTGGGCGACGCATAACATGTCGCCGCGTCAGGCTGAACTTa  <  1:2077599/65‑1 (MQ=255) gTTGTATATCGCTACACCACGCCAGTGGGCGACGCATAACATGTCGCCGCGTCAGGCTGAACTTa  <  1:2081752/65‑1 (MQ=255) |                                                                 GTTGTATATCGCTACACCACGCCAGTGGGCGACGCATAACATGTCGCCGCGTCAGGCTGAACTTA  >  minE/452133‑452197

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑