Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	minE	478240	478293	54	7 [0]	[0] 37	cydA	cytochrome d terminal oxidase, subunit I

TGTGTCACCTGGCTGGTGGCGCTCGGTTCAAACCTGTCCGCACTGTGGATTCTGGTTGCGAACGGC  >  minE/478294‑478359 |                                                                  tgtgtCACCTGGCTGGTGGCGCTCGGTTCAAACCTGTCCGCACTGTGGATTCTGGTTGCGAACGGc  <  1:443664/66‑1 (MQ=255) tgtgtCACCTGGCTGGTGGCGCTCGGTTCAAACCTGTCCGCACTGTGGATTCTGGTTGCGAACGGc  <  1:1966061/66‑1 (MQ=255) tgtgtCACCTGGCTGGTGGCGCTCGGTTCAAACCTGTCCGCACTGTGGATTCTGGTTGCGAACGGc  <  1:1993537/66‑1 (MQ=255) tgtgtCACCTGGCTGGTGGCGCTCGGTTCAAACCTGTCCGCACTGTGGATTCTGGTTGCGAACGGc  <  1:2009880/66‑1 (MQ=255) tgtgtCACCTGGCTGGTGGCGCTCGGTTCAAACCTGTCCGCACTGTGGATTCTGGTTGCGAACGGc  <  1:2052711/66‑1 (MQ=255) tgtgtCACCTGGCTGGTGGCGCTCGGTTCAAACCTGTCCGCACTGTGGATTCTGGTTGCGAACGGc  <  1:2117569/66‑1 (MQ=255) tgtgtCACCTGGCTGGTGGCGCTCGGTTCAAACCTGTCCGCACTGTGGATTCTGGTTGCGAACGGc  <  1:2128293/66‑1 (MQ=255) tgtgtCACCTGGCTGGTGGCGCTCGGTTCAAACCTGTCCGCACTGTGGATTCTGGTTGCGAACGGc  <  1:218543/66‑1 (MQ=255) tgtgtCACCTGGCTGGTGGCGCTCGGTTCAAACCTGTCCGCACTGTGGATTCTGGTTGCGAACGGc  <  1:222571/66‑1 (MQ=255) tgtgtCACCTGGCTGGTGGCGCTCGGTTCAAACCTGTCCGCACTGTGGATTCTGGTTGCGAACGGc  <  1:330610/66‑1 (MQ=255) tgtgtCACCTGGCTGGTGGCGCTCGGTTCAAACCTGTCCGCACTGTGGATTCTGGTTGCGAACGGc  <  1:1944455/66‑1 (MQ=255) tgtgtCACCTGGCTGGTGGCGCTCGGTTCAAACCTGTCCGCACTGTGGATTCTGGTTGCGAACGGc  <  1:532866/66‑1 (MQ=255) tgtgtCACCTGGCTGGTGGCGCTCGGTTCAAACCTGTCCGCACTGTGGATTCTGGTTGCGAACGGc  <  1:550426/66‑1 (MQ=255) tgtgtCACCTGGCTGGTGGCGCTCGGTTCAAACCTGTCCGCACTGTGGATTCTGGTTGCGAACGGc  <  1:555276/66‑1 (MQ=255) tgtgtCACCTGGCTGGTGGCGCTCGGTTCAAACCTGTCCGCACTGTGGATTCTGGTTGCGAACGGc  <  1:762910/66‑1 (MQ=255) tgtgtCACCTGGCTGGTGGCGCTCGGTTCAAACCTGTCCGCACTGTGGATTCTGGTTGCGAACGGc  <  1:774283/66‑1 (MQ=255) tgtgtCACCTGGCTGGTGGCGCTCGGTTCAAACCTGTCCGCACTGTGGATTCTGGTTGCGAACGGc  <  1:983768/66‑1 (MQ=255) tgtgtCACCTGGCTGGTGGCGCTCGGTTCAAACCTGTCCGCACTGTGGATTCTGGTTGCGAACGGc  <  1:989301/66‑1 (MQ=255) tgtgtCACCTGGCTGGTGGCGCTCGGTTCAAACCTGTCCGCACTGTGGATTCTGGTTGCGAACGGc  <  1:993279/66‑1 (MQ=255) tgtgtCACCTGGCTGGTGGCGCTCGGTTCAAACCTGTCCGCACTGTGGATTCTGGTTGCGAACGGc  <  1:1532300/66‑1 (MQ=255) tgtgtCACCTGGCTGGTGGCGCTCGGTTCAAACCTGTCCGCACTGTGGATTCTGGTTGCGAACGGc  <  1:1322231/66‑1 (MQ=255) tgtgtCACCTGGCTGGTGGCGCTCGGTTCAAACCTGTCCGCACTGTGGATTCTGGTTGCGAACGGc  <  1:138384/66‑1 (MQ=255) tgtgtCACCTGGCTGGTGGCGCTCGGTTCAAACCTGTCCGCACTGTGGATTCTGGTTGCGAACGGc  <  1:1395585/66‑1 (MQ=255) tgtgtCACCTGGCTGGTGGCGCTCGGTTCAAACCTGTCCGCACTGTGGATTCTGGTTGCGAACGGc  <  1:140626/66‑1 (MQ=255) tgtgtCACCTGGCTGGTGGCGCTCGGTTCAAACCTGTCCGCACTGTGGATTCTGGTTGCGAACGGc  <  1:1423061/66‑1 (MQ=255) tgtgtCACCTGGCTGGTGGCGCTCGGTTCAAACCTGTCCGCACTGTGGATTCTGGTTGCGAACGGc  <  1:1448444/66‑1 (MQ=255) tgtgtCACCTGGCTGGTGGCGCTCGGTTCAAACCTGTCCGCACTGTGGATTCTGGTTGCGAACGGc  <  1:1496512/66‑1 (MQ=255) tgtgtCACCTGGCTGGTGGCGCTCGGTTCAAACCTGTCCGCACTGTGGATTCTGGTTGCGAACGGc  <  1:1500689/66‑1 (MQ=255) tgtgtCACCTGGCTGGTGGCGCTCGGTTCAAACCTGTCCGCACTGTGGATTCTGGTTGCGAACGGc  <  1:123007/66‑1 (MQ=255) tgtgtCACCTGGCTGGTGGCGCTCGGTTCAAACCTGTCCGCACTGTGGATTCTGGTTGCGAACGGc  <  1:1574738/66‑1 (MQ=255) tgtgtCACCTGGCTGGTGGCGCTCGGTTCAAACCTGTCCGCACTGTGGATTCTGGTTGCGAACGGc  <  1:1579339/66‑1 (MQ=255) tgtgtCACCTGGCTGGTGGCGCTCGGTTCAAACCTGTCCGCACTGTGGATTCTGGTTGCGAACGGc  <  1:162809/66‑1 (MQ=255) tgtgtCACCTGGCTGGTGGCGCTCGGTTCAAACCTGTCCGCACTGTGGATTCTGGTTGCGAACGGc  <  1:172425/66‑1 (MQ=255) tgtgtCACCTGGCTGGTGGCGCTCGGTTCAAACCTGTCCGCACTGTGGATTCTGGTTGCGAACGGc  <  1:1774734/66‑1 (MQ=255) tgtgtCACCTGGCTGGTGGCGCTCGGTTCAAACCTGTCCGCACTGTGGATTCTGGTTGCGAACGGc  <  1:178725/66‑1 (MQ=255) tgtgtCACCTGGCTGGTGGCGCTCGGTTCAAACCTGTCCGCACTGTGGATTCTGGTTGCGAACGGc  <  1:1801827/66‑1 (MQ=255) tgtgtCACCTGGCTGGTGGCGCTCGGTTCAAACCTGTCCGCACTGTGGATTCTGGTTGCGAACGGc  <  1:1836058/66‑1 (MQ=255) |                                                                  TGTGTCACCTGGCTGGTGGCGCTCGGTTCAAACCTGTCCGCACTGTGGATTCTGGTTGCGAACGGC  >  minE/478294‑478359

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑