Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	minE	489446	489485	40	25 [0]	[0] 53	nadA	quinolinate synthase, subunit A

GAAGCAATCACGAGGTTCATGTTGATGAAAGGCTGCGAGAGAGGGCGCTGGTGCCGCTCAATCGTAT  >  minE/489486‑489552 |                                                                   gaagCTATCACGAGGTTCATGTTGATGAAAGGCTGCGAGAGAGGGCGCTGGTGCCGCTCAATCGTAt  >  1:358898/1‑67 (MQ=255) gaagCAATCACGAGGTTCATGTTGATGAAAGGCTGCGAGAGAGGGCGCt                    >  1:1022100/1‑49 (MQ=255) gaagCAATCACGAGGTTCATGTTGATGAAAGGCTGCGAGAGAGGGCGCTGGTGcc              >  1:1292668/1‑55 (MQ=255) gaagCAATCACGAGGTTCATGTTGATGAAAGGCTGCGAGAGAGGGCGCTGGTGCCGCTCAATCGt    >  1:1389519/1‑65 (MQ=255) gaagCAATCACGAGGTTCATGTTGATGAAAGGCTGCGAGAGAGGGCGCTGGTGCCGCTCAATCGTa   >  1:35341/1‑66 (MQ=255) gaagCAATCACGAGGTTCATGTTGATGAAAGGCTGCGAGAGAGGGCGCTGGTGCCGCTCAATCGTa   >  1:45688/1‑66 (MQ=255) gaagCAATCACGAGGTTCATGTTGATGAAAGGCTGCGAGAGAGGGCGCTGGTGCCGCTCAATCGTa   >  1:240906/1‑66 (MQ=255) gaagCAATCACGAGGTTCATGTTGATGAAAGGCTGCGAGAGAGGGCGCTGGTGCCGCTCAATCGTa   >  1:1380448/1‑66 (MQ=255) gaagCAATCACGAGGTTCATGTTGATGAAAGGCTGCGAGAGAGGGCGCTGGTGCCGCTCAATCGTa   >  1:893267/1‑66 (MQ=255) gaagCAATCACGAGGTTCATGTTGATGAAAGGCTGCGAGAGAGGGCGCTGGTGCCGCTCAATCGTa   >  1:900996/1‑66 (MQ=255) gaagCAATCACGAGGTTCATGTTGATGAAAGGCTGCGAGAGAGGGCGCTGGTGCCGCTCAATCGTAt  >  1:355760/1‑67 (MQ=255) gaagCAATCACGAGGTTCATGTTGATGAAAGGCTGCGAGAGAGGGCGCTGGTGCCGCTCAATCGTAt  >  1:432550/1‑67 (MQ=255) gaagCAATCACGAGGTTCATGTTGATGAAAGGCTGCGAGAGAGGGCGCTGGTGCCGCTCAATCGTAt  >  1:661050/1‑67 (MQ=255) gaagCAATCACGAGGTTCATGTTGATGAAAGGCTGCGAGAGAGGGCGCTGGTGCCGCTCAATCGTAt  >  1:468560/1‑67 (MQ=255) gaagCAATCACGAGGTTCATGTTGATGAAAGGCTGCGAGAGAGGGCGCTGGTGCCGCTCAATCGTAt  >  1:471272/1‑67 (MQ=255) gaagCAATCACGAGGTTCATGTTGATGAAAGGCTGCGAGAGAGGGCGCTGGTGCCGCTCAATCGTAt  >  1:482864/1‑67 (MQ=255) gaagCAATCACGAGGTTCATGTTGATGAAAGGCTGCGAGAGAGGGCGCTGGTGCCGCTCAATCGTAt  >  1:545692/1‑67 (MQ=255) gaagCAATCACGAGGTTCATGTTGATGAAAGGCTGCGAGAGAGGGCGCTGGTGCCGCTCAATCGTAt  >  1:574419/1‑67 (MQ=255) gaagCAATCACGAGGTTCATGTTGATGAAAGGCTGCGAGAGAGGGCGCTGGTGCCGCTCAATCGTAt  >  1:601419/1‑67 (MQ=255) gaagCAATCACGAGGTTCATGTTGATGAAAGGCTGCGAGAGAGGGCGCTGGTGCCGCTCAATCGTAt  >  1:650434/1‑67 (MQ=255) gaagCAATCACGAGGTTCATGTTGATGAAAGGCTGCGAGAGAGGGCGCTGGTGCCGCTCAATCGTAt  >  1:254470/1‑67 (MQ=255) gaagCAATCACGAGGTTCATGTTGATGAAAGGCTGCGAGAGAGGGCGCTGGTGCCGCTCAATCGTAt  >  1:667961/1‑67 (MQ=255) gaagCAATCACGAGGTTCATGTTGATGAAAGGCTGCGAGAGAGGGCGCTGGTGCCGCTCAATCGTAt  >  1:680240/1‑67 (MQ=255) gaagCAATCACGAGGTTCATGTTGATGAAAGGCTGCGAGAGAGGGCGCTGGTGCCGCTCAATCGTAt  >  1:775476/1‑67 (MQ=255) gaagCAATCACGAGGTTCATGTTGATGAAAGGCTGCGAGAGAGGGCGCTGGTGCCGCTCAATCGTAt  >  1:782606/1‑67 (MQ=255) gaagCAATCACGAGGTTCATGTTGATGAAAGGCTGCGAGAGAGGGCGCTGGTGCCGCTCAATCGTAt  >  1:832784/1‑67 (MQ=255) gaagCAATCACGAGGTTCATGTTGATGAAAGGCTGCGAGAGAGGGCGCTGGTGCCGCTCAATCGTAt  >  1:886443/1‑67 (MQ=255) gaagCAATCACGAGGTTCATGTTGATGAAAGGCTGCGAGAGAGGGCGCTGGTGCCGCTCAATCGTAt  >  1:919781/1‑67 (MQ=255) gaagCAATCACGAGGTTCATGTTGATGAAAGGCTGCGAGAGAGGGCGCTGGTGCCGCTCAATCGTAt  >  1:947738/1‑67 (MQ=255) gaagCAATCACGAGGTTCATGTTGATGAAAGGCTGCGAGAGAGGGCGCTGGTGCCGCTCAATCGTAt  >  1:180373/1‑67 (MQ=255) gaagCAATCACGAGGTTCATGTTGATGAAAGGCTGCGAGAGAGGGCGCTGGTGCCGCTCAATCGTAt  >  1:1032879/1‑67 (MQ=255) gaagCAATCACGAGGTTCATGTTGATGAAAGGCTGCGAGAGAGGGCGCTGGTGCCGCTCAATCGTAt  >  1:1123275/1‑67 (MQ=255) gaagCAATCACGAGGTTCATGTTGATGAAAGGCTGCGAGAGAGGGCGCTGGTGCCGCTCAATCGTAt  >  1:1278628/1‑67 (MQ=255) gaagCAATCACGAGGTTCATGTTGATGAAAGGCTGCGAGAGAGGGCGCTGGTGCCGCTCAATCGTAt  >  1:1303131/1‑67 (MQ=255) gaagCAATCACGAGGTTCATGTTGATGAAAGGCTGCGAGAGAGGGCGCTGGTGCCGCTCAATCGTAt  >  1:1351033/1‑67 (MQ=255) gaagCAATCACGAGGTTCATGTTGATGAAAGGCTGCGAGAGAGGGCGCTGGTGCCGCTCAATCGTAt  >  1:1474187/1‑67 (MQ=255) gaagCAATCACGAGGTTCATGTTGATGAAAGGCTGCGAGAGAGGGCGCTGGTGCCGCTCAATCGTAt  >  1:1537848/1‑67 (MQ=255) gaagCAATCACGAGGTTCATGTTGATGAAAGGCTGCGAGAGAGGGCGCTGGTGCCGCTCAATCGTAt  >  1:1588814/1‑67 (MQ=255) gaagCAATCACGAGGTTCATGTTGATGAAAGGCTGCGAGAGAGGGCGCTGGTGCCGCTCAATCGTAt  >  1:1696197/1‑67 (MQ=255) gaagCAATCACGAGGTTCATGTTGATGAAAGGCTGCGAGAGAGGGCGCTGGTGCCGCTCAATCGTAt  >  1:1729380/1‑67 (MQ=255) gaagCAATCACGAGGTTCATGTTGATGAAAGGCTGCGAGAGAGGGCGCTGGTGCCGCTCAATCGTAt  >  1:1770322/1‑67 (MQ=255) gaagCAATCACGAGGTTCATGTTGATGAAAGGCTGCGAGAGAGGGCGCTGGTGCCGCTCAATCGTAt  >  1:341325/1‑67 (MQ=255) gaagCAATCACGAGGTTCATGTTGATGAAAGGCTGCGAGAGAGGGCGCTGGTGCCGCTCAATCGTAt  >  1:1859289/1‑67 (MQ=255) gaagCAATCACGAGGTTCATGTTGATGAAAGGCTGCGAGAGAGGGCGCTGGTGCCGCTCAATCGTAt  >  1:186498/1‑67 (MQ=255) gaagCAATCACGAGGTTCATGTTGATGAAAGGCTGCGAGAGAGGGCGCTGGTGCCGCTCAATCGTAt  >  1:188052/1‑67 (MQ=255) gaagCAATCACGAGGTTCATGTTGATGAAAGGCTGCGAGAGAGGGCGCTGGTGCCGCTCAATCGTAt  >  1:191763/1‑67 (MQ=255) gaagCAATCACGAGGTTCATGTTGATGAAAGGCTGCGAGAGAGGGCGCTGGTGCCGCTCAATCGTAt  >  1:195077/1‑67 (MQ=255) gaagCAATCACGAGGTTCATGTTGATGAAAGGCTGCGAGAGAGGGCGCTGGTGCCGCTCAATCGTAt  >  1:1984385/1‑67 (MQ=255) gaagCAATCACGAGGTTCATGTTGATGAAAGGCTGCGAGAGAGGGCGCTGGTGCCGCTCAATCGTAt  >  1:2009068/1‑67 (MQ=255) gaagCAATCACGAGGTTCATGTTGATGAAAGGCTGCGAGAGAGGGCGCTGGTGCCGCTCAATCGTAt  >  1:2041804/1‑67 (MQ=255) gaagCAATCACGAGGTTCATGTTGATGAAAGGCTGCGAGAGAGGGCGCTGGTGCCGCTCAATCGTAt  >  1:2106612/1‑67 (MQ=255) gaagCAATCACGAGGTTCATGTTGATGAAAGGCTGCGAGAGAGGGCGCTGGTGCCGCTCAATCGTAt  >  1:280857/1‑67 (MQ=255) gaagCAATCACGAGGTTCATGTTGATGAAAGGCTGCGAGAGAGGGCGCTGGTGCCGCTCAATCGTAt  >  1:289882/1‑67 (MQ=255) |                                                                   GAAGCAATCACGAGGTTCATGTTGATGAAAGGCTGCGAGAGAGGGCGCTGGTGCCGCTCAATCGTAT  >  minE/489486‑489552

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑