Missing coverage evidence...
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TTTCGCCATGCCGGGTTCGACCAAAGCGTGCCGTACCGCATGGGAAAATATCATCGCGCCGCAGC  >  minE/524908‑524972 |                                                                 tttCGCCATGCCGGGTTCGACCAAAGCGTGCCGTACCGCATGGGAAAGTATCATCGCGCCGCAGc  <  1:1715643/65‑1 (MQ=255) tttCGCCATGCCGGGTTCGACCAAAGCGTGCCGTACCGCATGGGAAAATATCATCGCGCCGCAGc  <  1:584514/65‑1 (MQ=255) tttCGCCATGCCGGGTTCGACCAAAGCGTGCCGTACCGCATGGGAAAATATCATCGCGCCGCAGc  <  1:2156846/65‑1 (MQ=255) tttCGCCATGCCGGGTTCGACCAAAGCGTGCCGTACCGCATGGGAAAATATCATCGCGCCGCAGc  <  1:225291/65‑1 (MQ=255) tttCGCCATGCCGGGTTCGACCAAAGCGTGCCGTACCGCATGGGAAAATATCATCGCGCCGCAGc  <  1:303969/65‑1 (MQ=255) tttCGCCATGCCGGGTTCGACCAAAGCGTGCCGTACCGCATGGGAAAATATCATCGCGCCGCAGc  <  1:340995/65‑1 (MQ=255) tttCGCCATGCCGGGTTCGACCAAAGCGTGCCGTACCGCATGGGAAAATATCATCGCGCCGCAGc  <  1:365516/65‑1 (MQ=255) tttCGCCATGCCGGGTTCGACCAAAGCGTGCCGTACCGCATGGGAAAATATCATCGCGCCGCAGc  <  1:409600/65‑1 (MQ=255) tttCGCCATGCCGGGTTCGACCAAAGCGTGCCGTACCGCATGGGAAAATATCATCGCGCCGCAGc  <  1:410871/65‑1 (MQ=255) tttCGCCATGCCGGGTTCGACCAAAGCGTGCCGTACCGCATGGGAAAATATCATCGCGCCGCAGc  <  1:484761/65‑1 (MQ=255) tttCGCCATGCCGGGTTCGACCAAAGCGTGCCGTACCGCATGGGAAAATATCATCGCGCCGCAGc  <  1:505035/65‑1 (MQ=255) tttCGCCATGCCGGGTTCGACCAAAGCGTGCCGTACCGCATGGGAAAATATCATCGCGCCGCAGc  <  1:516341/65‑1 (MQ=255) tttCGCCATGCCGGGTTCGACCAAAGCGTGCCGTACCGCATGGGAAAATATCATCGCGCCGCAGc  <  1:2004316/65‑1 (MQ=255) tttCGCCATGCCGGGTTCGACCAAAGCGTGCCGTACCGCATGGGAAAATATCATCGCGCCGCAGc  <  1:629472/65‑1 (MQ=255) tttCGCCATGCCGGGTTCGACCAAAGCGTGCCGTACCGCATGGGAAAATATCATCGCGCCGCAGc  <  1:663947/65‑1 (MQ=255) tttCGCCATGCCGGGTTCGACCAAAGCGTGCCGTACCGCATGGGAAAATATCATCGCGCCGCAGc  <  1:680986/65‑1 (MQ=255) tttCGCCATGCCGGGTTCGACCAAAGCGTGCCGTACCGCATGGGAAAATATCATCGCGCCGCAGc  <  1:686062/65‑1 (MQ=255) tttCGCCATGCCGGGTTCGACCAAAGCGTGCCGTACCGCATGGGAAAATATCATCGCGCCGCAGc  <  1:728192/65‑1 (MQ=255) tttCGCCATGCCGGGTTCGACCAAAGCGTGCCGTACCGCATGGGAAAATATCATCGCGCCGCAGc  <  1:771042/65‑1 (MQ=255) tttCGCCATGCCGGGTTCGACCAAAGCGTGCCGTACCGCATGGGAAAATATCATCGCGCCGCAGc  <  1:778281/65‑1 (MQ=255) tttCGCCATGCCGGGTTCGACCAAAGCGTGCCGTACCGCATGGGAAAATATCATCGCGCCGCAGc  <  1:82746/65‑1 (MQ=255) tttCGCCATGCCGGGTTCGACCAAAGCGTGCCGTACCGCATGGGAAAATATCATCGCGCCGCAGc  <  1:908111/65‑1 (MQ=255) tttCGCCATGCCGGGTTCGACCAAAGCGTGCCGTACCGCATGGGAAAATATCATCGCGCCGCAGc  <  1:943808/65‑1 (MQ=255) tttCGCCATGCCGGGTTCGACCAAAGCGTGCCGTACCGCATGGGAAAATATCATCGCGCCGCAGc  <  1:1379119/65‑1 (MQ=255) tttCGCCATGCCGGGTTCGACCAAAGCGTGCCGTACCGCATGGGAAAATATCATCGCGCCGCAGc  <  1:1125044/65‑1 (MQ=255) tttCGCCATGCCGGGTTCGACCAAAGCGTGCCGTACCGCATGGGAAAATATCATCGCGCCGCAGc  <  1:1136995/65‑1 (MQ=255) tttCGCCATGCCGGGTTCGACCAAAGCGTGCCGTACCGCATGGGAAAATATCATCGCGCCGCAGc  <  1:1161163/65‑1 (MQ=255) tttCGCCATGCCGGGTTCGACCAAAGCGTGCCGTACCGCATGGGAAAATATCATCGCGCCGCAGc  <  1:1161758/65‑1 (MQ=255) tttCGCCATGCCGGGTTCGACCAAAGCGTGCCGTACCGCATGGGAAAATATCATCGCGCCGCAGc  <  1:1205778/65‑1 (MQ=255) tttCGCCATGCCGGGTTCGACCAAAGCGTGCCGTACCGCATGGGAAAATATCATCGCGCCGCAGc  <  1:125372/65‑1 (MQ=255) tttCGCCATGCCGGGTTCGACCAAAGCGTGCCGTACCGCATGGGAAAATATCATCGCGCCGCAGc  <  1:1264820/65‑1 (MQ=255) tttCGCCATGCCGGGTTCGACCAAAGCGTGCCGTACCGCATGGGAAAATATCATCGCGCCGCAGc  <  1:1276734/65‑1 (MQ=255) tttCGCCATGCCGGGTTCGACCAAAGCGTGCCGTACCGCATGGGAAAATATCATCGCGCCGCAGc  <  1:1303536/65‑1 (MQ=255) tttCGCCATGCCGGGTTCGACCAAAGCGTGCCGTACCGCATGGGAAAATATCATCGCGCCGCAGc  <  1:1303779/65‑1 (MQ=255) tttCGCCATGCCGGGTTCGACCAAAGCGTGCCGTACCGCATGGGAAAATATCATCGCGCCGCAGc  <  1:2137033/65‑1 (MQ=255) tttCGCCATGCCGGGTTCGACCAAAGCGTGCCGTACCGCATGGGAAAATATCATCGCGCCGCAGc  <  1:1391794/65‑1 (MQ=255) tttCGCCATGCCGGGTTCGACCAAAGCGTGCCGTACCGCATGGGAAAATATCATCGCGCCGCAGc  <  1:1479109/65‑1 (MQ=255) tttCGCCATGCCGGGTTCGACCAAAGCGTGCCGTACCGCATGGGAAAATATCATCGCGCCGCAGc  <  1:1554367/65‑1 (MQ=255) tttCGCCATGCCGGGTTCGACCAAAGCGTGCCGTACCGCATGGGAAAATATCATCGCGCCGCAGc  <  1:1578894/65‑1 (MQ=255) tttCGCCATGCCGGGTTCGACCAAAGCGTGCCGTACCGCATGGGAAAATATCATCGCGCCGCAGc  <  1:1791882/65‑1 (MQ=255) tttCGCCATGCCGGGTTCGACCAAAGCGTGCCGTACCGCATGGGAAAATATCATCGCGCCGCAGc  <  1:1865363/65‑1 (MQ=255) tttCGCCATGCCGGGTTCGACCAAAGCGTGCCGTACCGCATGGGAAAATATCATCGCGCCGCAGc  <  1:1909826/65‑1 (MQ=255) tttCGCCATGCCGGGTTCGACCAAAGCGTGCCGTACCGCATGGGAAAATATCATCGCGCCGCAGc  <  1:1935882/65‑1 (MQ=255) tttCGCCATGCCGGGTTCGACCAAAGCGTGCCGTACCGCATGGGAAAATATCATCGCGCCGCAGc  <  1:1082345/65‑1 (MQ=255) tttCGCCATGCCGGGTTCGACCAAAGCGTGCCGTACCGCATGGGAAAATATCATCGCGACGCAGc  <  1:172760/65‑1 (MQ=255) |                                                                 TTTCGCCATGCCGGGTTCGACCAAAGCGTGCCGTACCGCATGGGAAAATATCATCGCGCCGCAGC  >  minE/524908‑524972

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑