Missing coverage evidence...
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AGGTGGCGACAATTAACGCCGGTACGGCTTTGCCGATGAAGATCTGCCAGGTGGTGAGCGGCGAAAC  >  minE/531870‑531936 |                                                                   aGGTGGCGACAATTAACGCCGGTACGGCTTTGCCGATGAAGATCTGCCAGGTGGTTAGCGGCGAAAc  <  1:702798/67‑1 (MQ=255) aGGTGGCGACAATTAACGCCGGTACGGCTTTGCCGATGAAGATCTGCCAGGTGGTGAGCGGCGAAAc  <  1:679628/67‑1 (MQ=255) aGGTGGCGACAATTAACGCCGGTACGGCTTTGCCGATGAAGATCTGCCAGGTGGTGAGCGGCGAAAc  <  1:300731/67‑1 (MQ=255) aGGTGGCGACAATTAACGCCGGTACGGCTTTGCCGATGAAGATCTGCCAGGTGGTGAGCGGCGAAAc  <  1:322784/67‑1 (MQ=255) aGGTGGCGACAATTAACGCCGGTACGGCTTTGCCGATGAAGATCTGCCAGGTGGTGAGCGGCGAAAc  <  1:35699/67‑1 (MQ=255) aGGTGGCGACAATTAACGCCGGTACGGCTTTGCCGATGAAGATCTGCCAGGTGGTGAGCGGCGAAAc  <  1:370194/67‑1 (MQ=255) aGGTGGCGACAATTAACGCCGGTACGGCTTTGCCGATGAAGATCTGCCAGGTGGTGAGCGGCGAAAc  <  1:39970/67‑1 (MQ=255) aGGTGGCGACAATTAACGCCGGTACGGCTTTGCCGATGAAGATCTGCCAGGTGGTGAGCGGCGAAAc  <  1:437680/67‑1 (MQ=255) aGGTGGCGACAATTAACGCCGGTACGGCTTTGCCGATGAAGATCTGCCAGGTGGTGAGCGGCGAAAc  <  1:590535/67‑1 (MQ=255) aGGTGGCGACAATTAACGCCGGTACGGCTTTGCCGATGAAGATCTGCCAGGTGGTGAGCGGCGAAAc  <  1:67733/67‑1 (MQ=255) aGGTGGCGACAATTAACGCCGGTACGGCTTTGCCGATGAAGATCTGCCAGGTGGTGAGCGGCGAAAc  <  1:21997/67‑1 (MQ=255) aGGTGGCGACAATTAACGCCGGTACGGCTTTGCCGATGAAGATCTGCCAGGTGGTGAGCGGCGAAAc  <  1:740985/67‑1 (MQ=255) aGGTGGCGACAATTAACGCCGGTACGGCTTTGCCGATGAAGATCTGCCAGGTGGTGAGCGGCGAAAc  <  1:768747/67‑1 (MQ=255) aGGTGGCGACAATTAACGCCGGTACGGCTTTGCCGATGAAGATCTGCCAGGTGGTGAGCGGCGAAAc  <  1:777486/67‑1 (MQ=255) aGGTGGCGACAATTAACGCCGGTACGGCTTTGCCGATGAAGATCTGCCAGGTGGTGAGCGGCGAAAc  <  1:893135/67‑1 (MQ=255) aGGTGGCGACAATTAACGCCGGTACGGCTTTGCCGATGAAGATCTGCCAGGTGGTGAGCGGCGAAAc  <  1:936696/67‑1 (MQ=255) aGGTGGCGACAATTAACGCCGGTACGGCTTTGCCGATGAAGATCTGCCAGGTGGTGAGCGGCGAAAc  <  1:948412/67‑1 (MQ=255) aGGTGGCGACAATTAACGCCGGTACGGCTTTGCCGATGAAGATCTGCCAGGTGGTGAGCGGCGAAAc  <  1:995360/67‑1 (MQ=255) aGGTGGCGACAATTAACGCCGGTACGGCTTTGCCGATGAAGATCTGCCAGGTGGTGAGCGGCGAAAc  <  1:1753263/67‑1 (MQ=255) aGGTGGCGACAATTAACGCCGGTACGGCTTTGCCGATGAAGATCTGCCAGGTGGTGAGCGGCGAAAc  <  1:1251515/67‑1 (MQ=255) aGGTGGCGACAATTAACGCCGGTACGGCTTTGCCGATGAAGATCTGCCAGGTGGTGAGCGGCGAAAc  <  1:1263390/67‑1 (MQ=255) aGGTGGCGACAATTAACGCCGGTACGGCTTTGCCGATGAAGATCTGCCAGGTGGTGAGCGGCGAAAc  <  1:130250/67‑1 (MQ=255) aGGTGGCGACAATTAACGCCGGTACGGCTTTGCCGATGAAGATCTGCCAGGTGGTGAGCGGCGAAAc  <  1:1309530/67‑1 (MQ=255) aGGTGGCGACAATTAACGCCGGTACGGCTTTGCCGATGAAGATCTGCCAGGTGGTGAGCGGCGAAAc  <  1:1312071/67‑1 (MQ=255) aGGTGGCGACAATTAACGCCGGTACGGCTTTGCCGATGAAGATCTGCCAGGTGGTGAGCGGCGAAAc  <  1:1596308/67‑1 (MQ=255) aGGTGGCGACAATTAACGCCGGTACGGCTTTGCCGATGAAGATCTGCCAGGTGGTGAGCGGCGAAAc  <  1:164653/67‑1 (MQ=255) aGGTGGCGACAATTAACGCCGGTACGGCTTTGCCGATGAAGATCTGCCAGGTGGTGAGCGGCGAAAc  <  1:1729696/67‑1 (MQ=255) aGGTGGCGACAATTAACGCCGGTACGGCTTTGCCGATGAAGATCTGCCAGGTGGTGAGCGGCGAAAc  <  1:1148606/67‑1 (MQ=255) aGGTGGCGACAATTAACGCCGGTACGGCTTTGCCGATGAAGATCTGCCAGGTGGTGAGCGGCGAAAc  <  1:1790734/67‑1 (MQ=255) aGGTGGCGACAATTAACGCCGGTACGGCTTTGCCGATGAAGATCTGCCAGGTGGTGAGCGGCGAAAc  <  1:1815282/67‑1 (MQ=255) aGGTGGCGACAATTAACGCCGGTACGGCTTTGCCGATGAAGATCTGCCAGGTGGTGAGCGGCGAAAc  <  1:1873679/67‑1 (MQ=255) aGGTGGCGACAATTAACGCCGGTACGGCTTTGCCGATGAAGATCTGCCAGGTGGTGAGCGGCGAAAc  <  1:1940104/67‑1 (MQ=255) aGGTGGCGACAATTAACGCCGGTACGGCTTTGCCGATGAAGATCTGCCAGGTGGTGAGCGGCGAAAc  <  1:1992207/67‑1 (MQ=255) aGGTGGCGACAATTAACGCCGGTACGGCTTTGCCGATGAAGATCTGCCAGGTGGTGAGCGGCGAAAc  <  1:2085785/67‑1 (MQ=255) aGGTGGCGACAATTAACGCCGGTACGGCTTTGCCGATGAAGATCTGCCAGGTGGTGAGCGGCGAAAc  <  1:2099798/67‑1 (MQ=255) aGGGGGCGACAATTAACGCCGGTACGGCTTTGCCGATGAAGATCTGCCAGGTGGTGAGCGGCGAAAc  <  1:2109270/67‑1 (MQ=255) |                                                                   AGGTGGCGACAATTAACGCCGGTACGGCTTTGCCGATGAAGATCTGCCAGGTGGTGAGCGGCGAAAC  >  minE/531870‑531936

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑