Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	minE	17542	17559	18	4 [0]	[0] 8	nhaR	DNA‑binding transcriptional activator

CTGATGCACTTTCCAAACGCCTGGTCAGTAGCGTACTTAACGCCGCAGTG  >  minE/17560‑17609 |                                                  cTGATGCACTTTCCAAACGCCTGGTCAGTAGCGTACTTAACGCCGCAGTg  <  1:1211702/50‑1 (MQ=255) cTGATGCACTTTCCAAACGCCTGGTCAGTAGCGTACTTAACGCCGCAGTg  <  1:131235/50‑1 (MQ=255) cTGATGCACTTTCCAAACGCCTGGTCAGTAGCGTACTTAACGCCGCAGTg  <  1:1607416/50‑1 (MQ=255) cTGATGCACTTTCCAAACGCCTGGTCAGTAGCGTACTTAACGCCGCAGTg  <  1:253882/50‑1 (MQ=255) cTGATGCACTTTCCAAACGCCTGGTCAGTAGCGTACTTAACGCCGCAGTg  <  1:535577/50‑1 (MQ=255) cTGATGCACTTTCCAAACGCCTGGTCAGTAGCGTACTTAACGCCGCAGTg  <  1:684116/50‑1 (MQ=255) cTGATGCACTTTCCAAACGCCTGGTCAGTAGCGTACTTAACGCCGCAGTg  <  1:692042/50‑1 (MQ=255) cTGATGCACTTTCCAAACGCCTGGTCAGTAGCGTACTTAACGCCGCAGTg  <  1:809001/50‑1 (MQ=255) |                                                  CTGATGCACTTTCCAAACGCCTGGTCAGTAGCGTACTTAACGCCGCAGTG  >  minE/17560‑17609

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑