Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	minE	796196	796266	71	5 [0]	[0] 37	ycgR	protein involved in flagellar function

TTGCTGTTTCCAGTAATGCGCCCATGCCGCCTAACGACAAATCATACAGGCGGAAACGTAACGTACT  >  minE/796267‑796333 |                                                                   ttGCTGTTTCCAGTAATGCGCCCATGCTGCCTAACGACAAATCATACAGGCGGAAACGTAACGTACt  >  1:716136/1‑67 (MQ=255) ttGCTGTTTCCAGTAATGCGCCCATGCCGCCTAACGACAAATCATACAGGCGGa               >  1:1635342/1‑54 (MQ=255) ttGCTGTTTCCAGTAATGCGCCCATGCCGCCTAACGACAAATCATACAGGCGGAAACGTAACGTACt  >  1:440935/1‑67 (MQ=255) ttGCTGTTTCCAGTAATGCGCCCATGCCGCCTAACGACAAATCATACAGGCGGAAACGTAACGTACt  >  1:1998533/1‑67 (MQ=255) ttGCTGTTTCCAGTAATGCGCCCATGCCGCCTAACGACAAATCATACAGGCGGAAACGTAACGTACt  >  1:2100623/1‑67 (MQ=255) ttGCTGTTTCCAGTAATGCGCCCATGCCGCCTAACGACAAATCATACAGGCGGAAACGTAACGTACt  >  1:2124560/1‑67 (MQ=255) ttGCTGTTTCCAGTAATGCGCCCATGCCGCCTAACGACAAATCATACAGGCGGAAACGTAACGTACt  >  1:2136245/1‑67 (MQ=255) ttGCTGTTTCCAGTAATGCGCCCATGCCGCCTAACGACAAATCATACAGGCGGAAACGTAACGTACt  >  1:235556/1‑67 (MQ=255) ttGCTGTTTCCAGTAATGCGCCCATGCCGCCTAACGACAAATCATACAGGCGGAAACGTAACGTACt  >  1:387006/1‑67 (MQ=255) ttGCTGTTTCCAGTAATGCGCCCATGCCGCCTAACGACAAATCATACAGGCGGAAACGTAACGTACt  >  1:387870/1‑67 (MQ=255) ttGCTGTTTCCAGTAATGCGCCCATGCCGCCTAACGACAAATCATACAGGCGGAAACGTAACGTACt  >  1:390168/1‑67 (MQ=255) ttGCTGTTTCCAGTAATGCGCCCATGCCGCCTAACGACAAATCATACAGGCGGAAACGTAACGTACt  >  1:1952862/1‑67 (MQ=255) ttGCTGTTTCCAGTAATGCGCCCATGCCGCCTAACGACAAATCATACAGGCGGAAACGTAACGTACt  >  1:478470/1‑67 (MQ=255) ttGCTGTTTCCAGTAATGCGCCCATGCCGCCTAACGACAAATCATACAGGCGGAAACGTAACGTACt  >  1:697109/1‑67 (MQ=255) ttGCTGTTTCCAGTAATGCGCCCATGCCGCCTAACGACAAATCATACAGGCGGAAACGTAACGTACt  >  1:734228/1‑67 (MQ=255) ttGCTGTTTCCAGTAATGCGCCCATGCCGCCTAACGACAAATCATACAGGCGGAAACGTAACGTACt  >  1:750991/1‑67 (MQ=255) ttGCTGTTTCCAGTAATGCGCCCATGCCGCCTAACGACAAATCATACAGGCGGAAACGTAACGTACt  >  1:78673/1‑67 (MQ=255) ttGCTGTTTCCAGTAATGCGCCCATGCCGCCTAACGACAAATCATACAGGCGGAAACGTAACGTACt  >  1:866779/1‑67 (MQ=255) ttGCTGTTTCCAGTAATGCGCCCATGCCGCCTAACGACAAATCATACAGGCGGAAACGTAACGTACt  >  1:882666/1‑67 (MQ=255) ttGCTGTTTCCAGTAATGCGCCCATGCCGCCTAACGACAAATCATACAGGCGGAAACGTAACGTACt  >  1:1356559/1‑67 (MQ=255) ttGCTGTTTCCAGTAATGCGCCCATGCCGCCTAACGACAAATCATACAGGCGGAAACGTAACGTACt  >  1:1205814/1‑67 (MQ=255) ttGCTGTTTCCAGTAATGCGCCCATGCCGCCTAACGACAAATCATACAGGCGGAAACGTAACGTACt  >  1:1208614/1‑67 (MQ=255) ttGCTGTTTCCAGTAATGCGCCCATGCCGCCTAACGACAAATCATACAGGCGGAAACGTAACGTACt  >  1:1240768/1‑67 (MQ=255) ttGCTGTTTCCAGTAATGCGCCCATGCCGCCTAACGACAAATCATACAGGCGGAAACGTAACGTACt  >  1:12416/1‑67 (MQ=255) ttGCTGTTTCCAGTAATGCGCCCATGCCGCCTAACGACAAATCATACAGGCGGAAACGTAACGTACt  >  1:1248467/1‑67 (MQ=255) ttGCTGTTTCCAGTAATGCGCCCATGCCGCCTAACGACAAATCATACAGGCGGAAACGTAACGTACt  >  1:1256935/1‑67 (MQ=255) ttGCTGTTTCCAGTAATGCGCCCATGCCGCCTAACGACAAATCATACAGGCGGAAACGTAACGTACt  >  1:1275734/1‑67 (MQ=255) ttGCTGTTTCCAGTAATGCGCCCATGCCGCCTAACGACAAATCATACAGGCGGAAACGTAACGTACt  >  1:1349627/1‑67 (MQ=255) ttGCTGTTTCCAGTAATGCGCCCATGCCGCCTAACGACAAATCATACAGGCGGAAACGTAACGTACt  >  1:1955285/1‑67 (MQ=255) ttGCTGTTTCCAGTAATGCGCCCATGCCGCCTAACGACAAATCATACAGGCGGAAACGTAACGTACt  >  1:1527749/1‑67 (MQ=255) ttGCTGTTTCCAGTAATGCGCCCATGCCGCCTAACGACAAATCATACAGGCGGAAACGTAACGTACt  >  1:170160/1‑67 (MQ=255) ttGCTGTTTCCAGTAATGCGCCCATGCCGCCTAACGACAAATCATACAGGCGGAAACGTAACGTACt  >  1:1711371/1‑67 (MQ=255) ttGCTGTTTCCAGTAATGCGCCCATGCCGCCTAACGACAAATCATACAGGCGGAAACGTAACGTACt  >  1:1815659/1‑67 (MQ=255) ttGCTGTTTCCAGTAATGCGCCCATGCCGCCTAACGACAAATCATACAGGCGGAAACGTAACGTACt  >  1:1880926/1‑67 (MQ=255) ttGCTGTTTCCAGTAATGCGCCCATGCCGCCTAACGACAAATCATACAGGCGGAAACGTAACGTACt  >  1:1889335/1‑67 (MQ=255) ttGCTGTTTCCAGTAATGCGCCCATGCCGCCTAACGACAAATCATACAGGCGGAAACGTAACGTACt  >  1:1045718/1‑67 (MQ=255) ttGCTGTTTCAAGTAATGCGCCCATGCCGCCTAACGACAAATCATa                       >  1:1692546/1‑46 (MQ=255) |                                                                   TTGCTGTTTCCAGTAATGCGCCCATGCCGCCTAACGACAAATCATACAGGCGGAAACGTAACGTACT  >  minE/796267‑796333

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑