Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	minE	796730	796737	8	26 [0]	[0] 40	ycgR	protein involved in flagellar function

TCACGCGGAAAAACTCCTGACTGACAAACTGTCTTTGGTTTATCGGTCACAGTTAACAAAACTTAA  >  minE/796738‑796803 |                                                                  tCACGCGGAAAAACTCCTGACTGACAAACTGTCTTTGGtt                            >  1:1960777/1‑40 (MQ=255) tCACGCGGAAAAACTCCTGACTGACAAACTGTCTTTGGTTTa                          >  1:1389409/1‑42 (MQ=255) tCACGCGGAAAAACTCCTGACTGACAAACTGTCTTTGGTTTATCGGTCACAGTTAACAAATCTTaa  >  1:1194481/1‑66 (MQ=255) tCACGCGGAAAAACTCCTGACTGACAAACTGTCTTTGGTTTATCGGTCACAGTTAACAAAACtt    >  1:1924588/1‑64 (MQ=255) tCACGCGGAAAAACTCCTGACTGACAAACTGTCTTTGGTTTATCGGTCACAGTTAACAAAACTTaa  >  1:540469/1‑66 (MQ=255) tCACGCGGAAAAACTCCTGACTGACAAACTGTCTTTGGTTTATCGGTCACAGTTAACAAAACTTaa  >  1:2031740/1‑66 (MQ=255) tCACGCGGAAAAACTCCTGACTGACAAACTGTCTTTGGTTTATCGGTCACAGTTAACAAAACTTaa  >  1:2065071/1‑66 (MQ=255) tCACGCGGAAAAACTCCTGACTGACAAACTGTCTTTGGTTTATCGGTCACAGTTAACAAAACTTaa  >  1:2073205/1‑66 (MQ=255) tCACGCGGAAAAACTCCTGACTGACAAACTGTCTTTGGTTTATCGGTCACAGTTAACAAAACTTaa  >  1:230193/1‑66 (MQ=255) tCACGCGGAAAAACTCCTGACTGACAAACTGTCTTTGGTTTATCGGTCACAGTTAACAAAACTTaa  >  1:330135/1‑66 (MQ=255) tCACGCGGAAAAACTCCTGACTGACAAACTGTCTTTGGTTTATCGGTCACAGTTAACAAAACTTaa  >  1:407077/1‑66 (MQ=255) tCACGCGGAAAAACTCCTGACTGACAAACTGTCTTTGGTTTATCGGTCACAGTTAACAAAACTTaa  >  1:409508/1‑66 (MQ=255) tCACGCGGAAAAACTCCTGACTGACAAACTGTCTTTGGTTTATCGGTCACAGTTAACAAAACTTaa  >  1:532751/1‑66 (MQ=255) tCACGCGGAAAAACTCCTGACTGACAAACTGTCTTTGGTTTATCGGTCACAGTTAACAAAACTTaa  >  1:818275/1‑66 (MQ=255) tCACGCGGAAAAACTCCTGACTGACAAACTGTCTTTGGTTTATCGGTCACAGTTAACAAAACTTaa  >  1:550827/1‑66 (MQ=255) tCACGCGGAAAAACTCCTGACTGACAAACTGTCTTTGGTTTATCGGTCACAGTTAACAAAACTTaa  >  1:586843/1‑66 (MQ=255) tCACGCGGAAAAACTCCTGACTGACAAACTGTCTTTGGTTTATCGGTCACAGTTAACAAAACTTaa  >  1:629259/1‑66 (MQ=255) tCACGCGGAAAAACTCCTGACTGACAAACTGTCTTTGGTTTATCGGTCACAGTTAACAAAACTTaa  >  1:685996/1‑66 (MQ=255) tCACGCGGAAAAACTCCTGACTGACAAACTGTCTTTGGTTTATCGGTCACAGTTAACAAAACTTaa  >  1:719916/1‑66 (MQ=255) tCACGCGGAAAAACTCCTGACTGACAAACTGTCTTTGGTTTATCGGTCACAGTTAACAAAACTTaa  >  1:755221/1‑66 (MQ=255) tCACGCGGAAAAACTCCTGACTGACAAACTGTCTTTGGTTTATCGGTCACAGTTAACAAAACTTaa  >  1:1039653/1‑66 (MQ=255) tCACGCGGAAAAACTCCTGACTGACAAACTGTCTTTGGTTTATCGGTCACAGTTAACAAAACTTaa  >  1:1595879/1‑66 (MQ=255) tCACGCGGAAAAACTCCTGACTGACAAACTGTCTTTGGTTTATCGGTCACAGTTAACAAAACTTaa  >  1:1078124/1‑66 (MQ=255) tCACGCGGAAAAACTCCTGACTGACAAACTGTCTTTGGTTTATCGGTCACAGTTAACAAAACTTaa  >  1:1114134/1‑66 (MQ=255) tCACGCGGAAAAACTCCTGACTGACAAACTGTCTTTGGTTTATCGGTCACAGTTAACAAAACTTaa  >  1:1125452/1‑66 (MQ=255) tCACGCGGAAAAACTCCTGACTGACAAACTGTCTTTGGTTTATCGGTCACAGTTAACAAAACTTaa  >  1:1209489/1‑66 (MQ=255) tCACGCGGAAAAACTCCTGACTGACAAACTGTCTTTGGTTTATCGGTCACAGTTAACAAAACTTaa  >  1:1355350/1‑66 (MQ=255) tCACGCGGAAAAACTCCTGACTGACAAACTGTCTTTGGTTTATCGGTCACAGTTAACAAAACTTaa  >  1:1378526/1‑66 (MQ=255) tCACGCGGAAAAACTCCTGACTGACAAACTGTCTTTGGTTTATCGGTCACAGTTAACAAAACTTaa  >  1:1382347/1‑66 (MQ=255) tCACGCGGAAAAACTCCTGACTGACAAACTGTCTTTGGTTTATCGGTCACAGTTAACAAAACTTaa  >  1:1389700/1‑66 (MQ=255) tCACGCGGAAAAACTCCTGACTGACAAACTGTCTTTGGTTTATCGGTCACAGTTAACAAAACTTaa  >  1:1977290/1‑66 (MQ=255) tCACGCGGAAAAACTCCTGACTGACAAACTGTCTTTGGTTTATCGGTCACAGTTAACAAAACTTaa  >  1:1608399/1‑66 (MQ=255) tCACGCGGAAAAACTCCTGACTGACAAACTGTCTTTGGTTTATCGGTCACAGTTAACAAAACTTaa  >  1:1711548/1‑66 (MQ=255) tCACGCGGAAAAACTCCTGACTGACAAACTGTCTTTGGTTTATCGGTCACAGTTAACAAAACTTaa  >  1:1848727/1‑66 (MQ=255) tCACGCGGAAAAACTCCTGACTGACAAACTGTCTTTGGTTTATCGGTCACAGTTAACAAAACTTaa  >  1:1857268/1‑66 (MQ=255) tCACGCGGAAAAACTCCTGACTGACAAACTGTCTTTGGTTTATCGGTCACAGTTAACAAAACTTaa  >  1:1862922/1‑66 (MQ=255) tCACGCGGAAAAACTCCTGACTGACAAACTGTCTTTGGTTTATCGGTCACAGTTAACAAAACTTaa  >  1:1932014/1‑66 (MQ=255) tCACGCGGAAAAACTCCTGACTGACAAACTGTCTTTGGTTTATCGGTCACAGTTAACAAAACTTaa  >  1:1937489/1‑66 (MQ=255) tCACGCGGAAAAACTCCTGACTGACAAACTGTCTTTGGTTTATCGGTCACAGTTAACAAAACTTa   >  1:54352/1‑65 (MQ=255) tCACGCGGAAAAACTCCTGACTGACAAACTGTCTTTGGTTTATCGGTCACAGTTAACAAAACTTa   >  1:2096817/1‑65 (MQ=255) |                                                                  TCACGCGGAAAAACTCCTGACTGACAAACTGTCTTTGGTTTATCGGTCACAGTTAACAAAACTTAA  >  minE/796738‑796803

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑