Missing coverage evidence...
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TTTACCGAGCAGGCGACAGATGATGTCAGCGCCACCCGCCTTTCCACCAGTCTGTCATTTGCGGAAG  >  minE/804984‑805050 |                                                                   tttACCGAGCAGGCGACAGATGATGTCAGCGCCACCCGCCTTTCCACCAGTCTGTCATTTGCGGaa   >  1:1001770/1‑66 (MQ=255) tttACCGAGCAGGCGACAGATGATGTCAGCGCCACCCGCCTTTCCACCAGTCTGTCATTTGCGGaa   >  1:858672/1‑66 (MQ=255) tttACCGAGCAGGCGACAGATGATGTCAGCGCCACCCGCCTTTCCACCAGTCTGTCATTTGCGGaa   >  1:789094/1‑66 (MQ=255) tttACCGAGCAGGCGACAGATGATGTCAGCGCCACCCGCCTTTCCACCAGTCTGTCATTTGCGGaa   >  1:1841151/1‑66 (MQ=255) tttACCGAGCAGGCGACAGATGATGTCAGCGCCACCCGCCTTTCCACCAGTCTGTCATTTGCGGAAg  >  1:530787/1‑67 (MQ=255) tttACCGAGCAGGCGACAGATGATGTCAGCGCCACCCGCCTTTCCACCAGTCTGTCATTTGCGGAAg  >  1:1771154/1‑67 (MQ=255) tttACCGAGCAGGCGACAGATGATGTCAGCGCCACCCGCCTTTCCACCAGTCTGTCATTTGCGGAAg  >  1:1810362/1‑67 (MQ=255) tttACCGAGCAGGCGACAGATGATGTCAGCGCCACCCGCCTTTCCACCAGTCTGTCATTTGCGGAAg  >  1:1958861/1‑67 (MQ=255) tttACCGAGCAGGCGACAGATGATGTCAGCGCCACCCGCCTTTCCACCAGTCTGTCATTTGCGGAAg  >  1:2069034/1‑67 (MQ=255) tttACCGAGCAGGCGACAGATGATGTCAGCGCCACCCGCCTTTCCACCAGTCTGTCATTTGCGGAAg  >  1:2145107/1‑67 (MQ=255) tttACCGAGCAGGCGACAGATGATGTCAGCGCCACCCGCCTTTCCACCAGTCTGTCATTTGCGGAAg  >  1:236261/1‑67 (MQ=255) tttACCGAGCAGGCGACAGATGATGTCAGCGCCACCCGCCTTTCCACCAGTCTGTCATTTGCGGAAg  >  1:364049/1‑67 (MQ=255) tttACCGAGCAGGCGACAGATGATGTCAGCGCCACCCGCCTTTCCACCAGTCTGTCATTTGCGGAAg  >  1:365318/1‑67 (MQ=255) tttACCGAGCAGGCGACAGATGATGTCAGCGCCACCCGCCTTTCCACCAGTCTGTCATTTGCGGAAg  >  1:1605301/1‑67 (MQ=255) tttACCGAGCAGGCGACAGATGATGTCAGCGCCACCCGCCTTTCCACCAGTCTGTCATTTGCGGAAg  >  1:534548/1‑67 (MQ=255) tttACCGAGCAGGCGACAGATGATGTCAGCGCCACCCGCCTTTCCACCAGTCTGTCATTTGCGGAAg  >  1:578379/1‑67 (MQ=255) tttACCGAGCAGGCGACAGATGATGTCAGCGCCACCCGCCTTTCCACCAGTCTGTCATTTGCGGAAg  >  1:610927/1‑67 (MQ=255) tttACCGAGCAGGCGACAGATGATGTCAGCGCCACCCGCCTTTCCACCAGTCTGTCATTTGCGGAAg  >  1:64582/1‑67 (MQ=255) tttACCGAGCAGGCGACAGATGATGTCAGCGCCACCCGCCTTTCCACCAGTCTGTCATTTGCGGAAg  >  1:682398/1‑67 (MQ=255) tttACCGAGCAGGCGACAGATGATGTCAGCGCCACCCGCCTTTCCACCAGTCTGTCATTTGCGGAAg  >  1:837462/1‑67 (MQ=255) tttACCGAGCAGGCGACAGATGATGTCAGCGCCACCCGCCTTTCCACCAGTCTGTCATTTGCGGAAg  >  1:913508/1‑67 (MQ=255) tttACCGAGCAGGCGACAGATGATGTCAGCGCCACCCGCCTTTCCACCAGTCTGTCATTTGCGGAAg  >  1:1190923/1‑67 (MQ=255) tttACCGAGCAGGCGACAGATGATGTCAGCGCCACCCGCCTTTCCACCAGTCTGTCATTTGCGGAAg  >  1:1014442/1‑67 (MQ=255) tttACCGAGCAGGCGACAGATGATGTCAGCGCCACCCGCCTTTCCACCAGTCTGTCATTTGCGGAAg  >  1:1030374/1‑67 (MQ=255) tttACCGAGCAGGCGACAGATGATGTCAGCGCCACCCGCCTTTCCACCAGTCTGTCATTTGCGGAAg  >  1:1051894/1‑67 (MQ=255) tttACCGAGCAGGCGACAGATGATGTCAGCGCCACCCGCCTTTCCACCAGTCTGTCATTTGCGGAAg  >  1:106417/1‑67 (MQ=255) tttACCGAGCAGGCGACAGATGATGTCAGCGCCACCCGCCTTTCCACCAGTCTGTCATTTGCGGAAg  >  1:1086946/1‑67 (MQ=255) tttACCGAGCAGGCGACAGATGATGTCAGCGCCACCCGCCTTTCCACCAGTCTGTCATTTGCGGAAg  >  1:1102326/1‑67 (MQ=255) tttACCGAGCAGGCGACAGATGATGTCAGCGCCACCCGCCTTTCCACCAGTCTGTCATTTGCGGAAg  >  1:1117126/1‑67 (MQ=255) tttACCGAGCAGGCGACAGATGATGTCAGCGCCACCCGCCTTTCCACCAGTCTGTCATTTGCGGAAg  >  1:1124142/1‑67 (MQ=255) tttACCGAGCAGGCGACAGATGATGTCAGCGCCACCCGCCTTTCCACCAGTCTGTCATTTGCGGAAg  >  1:1141385/1‑67 (MQ=255) tttACCGAGCAGGCGACAGATGATGTCAGCGCCACCCGCCTTTCCACCAGTCTGTCATTTGCGGAAg  >  1:1647052/1‑67 (MQ=255) tttACCGAGCAGGCGACAGATGATGTCAGCGCCACCCGCCTTTCCACCAGTCTGTCATTTGCGGAAg  >  1:1277306/1‑67 (MQ=255) tttACCGAGCAGGCGACAGATGATGTCAGCGCCACCCGCCTTTCCACCAGTCTGTCATTTGCGGAAg  >  1:128616/1‑67 (MQ=255) tttACCGAGCAGGCGACAGATGATGTCAGCGCCACCCGCCTTTCCACCAGTCTGTCATTTGCGGAAg  >  1:129534/1‑67 (MQ=255) tttACCGAGCAGGCGACAGATGATGTCAGCGCCACCCGCCTTTCCACCAGTCTGTCATTTGCGGAAg  >  1:1311020/1‑67 (MQ=255) tttACCGAGCAGGCGACAGATGATGTCAGCGCCACCCGCCTTTCCACCAGTCTGTCATTTGCGGAAg  >  1:1334129/1‑67 (MQ=255) tttACCGAGCAGGCGACAGATGATGTCAGCGCCACCCGCCTTTCCACCAGTCTGTCATTTGCGGAAg  >  1:1357010/1‑67 (MQ=255) tttACCGAGCAGGCGACAGATGATGTCAGCGCCACCCGCCTTTCCACCAGTCTGTCATTTGCGGAAg  >  1:1430282/1‑67 (MQ=255) tttACCGAGCAGGCGACAGATGATGTCAGCGCCACCCGCCTTTCCACCAGTCTGTCATTTGCGGAAg  >  1:1498057/1‑67 (MQ=255) tttACCGAGCAGGCGACAGATGATGTCAGCGCCACCCGCCTTTCCACCAGTCTGTCATTTGCGGAAg  >  1:1508404/1‑67 (MQ=255) |                                                                   TTTACCGAGCAGGCGACAGATGATGTCAGCGCCACCCGCCTTTCCACCAGTCTGTCATTTGCGGAAG  >  minE/804984‑805050

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑