Missing coverage evidence...
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TATTCGGCTCGGTCTGCCCCCTCGCTCTTTCAGGGAGAGGGTGACCGGCGGTTCAGTTCCTGCAGAA  >  minE/890332‑890398 |                                                                   tATTCGGCTCGGTCTGCCCCCTCGCTCTTTTAGGGAGAGGGTg                          >  1:1430898/1‑43 (MQ=255) tATTCGGCTCGGTCTGCCCCCTCGCTCTTTCAGGGAGAGGGTg                          >  1:1080843/1‑43 (MQ=255) tATTCGGCTCGGTCTGCCCCCTCGCTCTTTCAGGGAGAGGGTg                          >  1:1092302/1‑43 (MQ=255) tATTCGGCTCGGTCTGCCCCCTCGCTCTTTCAGGGAGAGGGTg                          >  1:1100231/1‑43 (MQ=255) tATTCGGCTCGGTCTGCCCCCTCGCTCTTTCAGGGAGAGGGTg                          >  1:1952269/1‑43 (MQ=255) tATTCGGCTCGGTCTGCCCCCTCGCTCTTTCAGGGAGAGGGTg                          >  1:1383829/1‑43 (MQ=255) tATTCGGCTCGGTCTGCCCCCTCGCTCTTTCAGGGAGAGGGTg                          >  1:1457544/1‑43 (MQ=255) tATTCGGCTCGGTCTGCCCCCTCGCTCTTTCAGGGAGAGGGTg                          >  1:472280/1‑43 (MQ=255) tATTCGGCTCGGTCTGCCCCCTCGCTCTTTCAGGGAGAGGGTGACCGGCGGTTCAGTTCCTGCAGaa  <  1:1906670/67‑1 (MQ=255) tATTCGGCTCGGTCTGCCCCCTCGCTCTTTCAGGGAGAGGGTGACCGGCGGTTCAGTTCCTGCAGaa  <  1:934130/67‑1 (MQ=255) tATTCGGCTCGGTCTGCCCCCTCGCTCTTTCAGGGAGAGGGTGACCGGCGGTTCAGTTCCTGCAGaa  <  1:196696/67‑1 (MQ=255) tATTCGGCTCGGTCTGCCCCCTCGCTCTTTCAGGGAGAGGGTGACCGGCGGTTCAGTTCCTGCAGaa  <  1:2017614/67‑1 (MQ=255) tATTCGGCTCGGTCTGCCCCCTCGCTCTTTCAGGGAGAGGGTGACCGGCGGTTCAGTTCCTGCAGaa  <  1:2046467/67‑1 (MQ=255) tATTCGGCTCGGTCTGCCCCCTCGCTCTTTCAGGGAGAGGGTGACCGGCGGTTCAGTTCCTGCAGaa  <  1:234126/67‑1 (MQ=255) tATTCGGCTCGGTCTGCCCCCTCGCTCTTTCAGGGAGAGGGTGACCGGCGGTTCAGTTCCTGCAGaa  <  1:256189/67‑1 (MQ=255) tATTCGGCTCGGTCTGCCCCCTCGCTCTTTCAGGGAGAGGGTGACCGGCGGTTCAGTTCCTGCAGaa  <  1:260982/67‑1 (MQ=255) tATTCGGCTCGGTCTGCCCCCTCGCTCTTTCAGGGAGAGGGTGACCGGCGGTTCAGTTCCTGCAGaa  <  1:441042/67‑1 (MQ=255) tATTCGGCTCGGTCTGCCCCCTCGCTCTTTCAGGGAGAGGGTGACCGGCGGTTCAGTTCCTGCAGaa  <  1:474071/67‑1 (MQ=255) tATTCGGCTCGGTCTGCCCCCTCGCTCTTTCAGGGAGAGGGTGACCGGCGGTTCAGTTCCTGCAGaa  <  1:4876/67‑1 (MQ=255) tATTCGGCTCGGTCTGCCCCCTCGCTCTTTCAGGGAGAGGGTGACCGGCGGTTCAGTTCCTGCAGaa  <  1:53498/67‑1 (MQ=255) tATTCGGCTCGGTCTGCCCCCTCGCTCTTTCAGGGAGAGGGTGACCGGCGGTTCAGTTCCTGCAGaa  <  1:55811/67‑1 (MQ=255) tATTCGGCTCGGTCTGCCCCCTCGCTCTTTCAGGGAGAGGGTGACCGGCGGTTCAGTTCCTGCAGaa  <  1:610590/67‑1 (MQ=255) tATTCGGCTCGGTCTGCCCCCTCGCTCTTTCAGGGAGAGGGTGACCGGCGGTTCAGTTCCTGCAGaa  <  1:850218/67‑1 (MQ=255) tATTCGGCTCGGTCTGCCCCCTCGCTCTTTCAGGGAGAGGGTGACCGGCGGTTCAGTTCCTGCAGaa  <  1:1052584/67‑1 (MQ=255) tATTCGGCTCGGTCTGCCCCCTCGCTCTTTCAGGGAGAGGGTGACCGGCGGTTCAGTTCCTGCAGaa  <  1:163706/67‑1 (MQ=255) tATTCGGCTCGGTCTGCCCCCTCGCTCTTTCAGGGAGAGGGTGACCGGCGGTTCAGTTCCTGCAGaa  <  1:114079/67‑1 (MQ=255) tATTCGGCTCGGTCTGCCCCCTCGCTCTTTCAGGGAGAGGGTGACCGGCGGTTCAGTTCCTGCAGaa  <  1:1172187/67‑1 (MQ=255) tATTCGGCTCGGTCTGCCCCCTCGCTCTTTCAGGGAGAGGGTGACCGGCGGTTCAGTTCCTGCAGaa  <  1:1375168/67‑1 (MQ=255) tATTCGGCTCGGTCTGCCCCCTCGCTCTTTCAGGGAGAGGGTGACCGGCGGTTCAGTTCCTGCAGaa  <  1:139206/67‑1 (MQ=255) tATTCGGCTCGGTCTGCCCCCTCGCTCTTTCAGGGAGAGGGTGACCGGCGGTTCAGTTCCTGCAGaa  <  1:1537024/67‑1 (MQ=255) tATTCGGCTCGGTCTGCCCCCTCGCTCTTTCAGGGAGAGGGTGACCGGCGGTTCAGTTCCTGCAGaa  <  1:1585661/67‑1 (MQ=255) tATTCGGCTCGGTCTGCCCCCTCGCTCTTTCAGGGAGAGGGTGACCGGCGGTTCAGTTCCTGCAGaa  <  1:1614717/67‑1 (MQ=255) tATTCGGCTCGGTCTGCCCCCTCGCTCTTTCAGGGAGAGGGTGACCGGCGGTTCAGTTCCTGCAGaa  <  1:1627054/67‑1 (MQ=255) tATTCGGCTCGGTCTGCCCCCTCGCTCTTTCAGGGAGAGGGTGACCGGCGGTTCAGTTCCTGCAGaa  <  1:1822977/67‑1 (MQ=255) tATTCGGCTCGGTCTGCCCCCTCGCTCTTTCAGGGAGAGGGTGACCGGCGGTTCAGTTCCTGCAGaa  <  1:1657429/67‑1 (MQ=255) tATTCGGCTCGGTCTGCCCCCTCGCTCTTTCAGGGAGAGGGTGACCGGCGGTTCAGTTCCTGCAGaa  <  1:1663387/67‑1 (MQ=255) tATTCGGCTCGGTCTGCCCCCTCGCTCTTTCAGGGAGAGGGTGACCGGCGGTTCAGTTCCTGCAGaa  <  1:1693624/67‑1 (MQ=255) tATTCGGCTCGGTCTGCCCCCTCGCTCTTTCAGGGAGAGGGTGACCGGCGGTTCAGTTCCTGCAGaa  <  1:1721118/67‑1 (MQ=255) tATTCGGCTCGGTCTGCCCCCTCGCTCTTTCAGGGAGAGGGTGACCGGCGGTTCAGTTCCTGCAGaa  <  1:1724353/67‑1 (MQ=255) tATTCGGCTCGGTCTGCCCCCTCGCTCTTTCAGGGAGAGGGTGACCGGCGGTTCAGTTCCTGCAGaa  <  1:1750356/67‑1 (MQ=255) tATTCGGCTCGGTCTGCCCCCTCGCTCTTTCAGGGAGAGGGTGACCGGCGGTTCAGTTCCTGCAGaa  <  1:1757352/67‑1 (MQ=255) tATTCGGCTCGGTCTGCCCCCTCGCTCTTTCAGGGAGAGGGTGACCGGCGGTTCAGTTCCTGCAGaa  <  1:1774034/67‑1 (MQ=255) tATTCGGCTCGGTCTGCCCCCTCGCTCTTTCAGGGAGAGGGTGACCGGCGGTTCAGTGCCTGCAGaa  <  1:499847/67‑1 (MQ=255) |                                                                   TATTCGGCTCGGTCTGCCCCCTCGCTCTTTCAGGGAGAGGGTGACCGGCGGTTCAGTTCCTGCAGAA  >  minE/890332‑890398

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑