Missing coverage evidence...
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TGGTTGTGGCGTAAGAAAATAGTAAACCCACAGACTTGCTCCCGTTAGCAGGACAAAAACGGTAATTCCATTAAATCCGCGTG  >  minE/931652‑931734                 |                                                                   tGGTTGTGGCGTAAGAAAATAGTAAACCCACAGACTTGCTCCCGTTAGCAGGACAAAAACGGTAAt                   <  1:374171/66‑1 (MQ=255)                 aaaTAGTAAACCCACAGACTTGCTCCCGTTAGCAGGACAAAAACGGTAATTCCATTAAATCcgcgcg  <  1:1213373/67‑3 (MQ=255)                 aaaTAGTAAACCCACAGACTTGCTCCCGTTAGCAGGACAAAAACGGTAATTCCATTAAATCCgcgtg  <  1:736272/67‑1 (MQ=255)                 aaaTAGTAAACCCACAGACTTGCTCCCGTTAGCAGGACAAAAACGGTAATTCCATTAAATCCgcgtg  <  1:289940/67‑1 (MQ=255)                 aaaTAGTAAACCCACAGACTTGCTCCCGTTAGCAGGACAAAAACGGTAATTCCATTAAATCCgcgtg  <  1:302605/67‑1 (MQ=255)                 aaaTAGTAAACCCACAGACTTGCTCCCGTTAGCAGGACAAAAACGGTAATTCCATTAAATCCgcgtg  <  1:32281/67‑1 (MQ=255)                 aaaTAGTAAACCCACAGACTTGCTCCCGTTAGCAGGACAAAAACGGTAATTCCATTAAATCCgcgtg  <  1:327305/67‑1 (MQ=255)                 aaaTAGTAAACCCACAGACTTGCTCCCGTTAGCAGGACAAAAACGGTAATTCCATTAAATCCgcgtg  <  1:344398/67‑1 (MQ=255)                 aaaTAGTAAACCCACAGACTTGCTCCCGTTAGCAGGACAAAAACGGTAATTCCATTAAATCCgcgtg  <  1:697050/67‑1 (MQ=255)                 aaaTAGTAAACCCACAGACTTGCTCCCGTTAGCAGGACAAAAACGGTAATTCCATTAAATCCgcgtg  <  1:709596/67‑1 (MQ=255)                 aaaTAGTAAACCCACAGACTTGCTCCCGTTAGCAGGACAAAAACGGTAATTCCATTAAATCCgcgtg  <  1:730853/67‑1 (MQ=255)                 aaaTAGTAAACCCACAGACTTGCTCCCGTTAGCAGGACAAAAACGGTAATTCCATTAAATCCgcgtg  <  1:2066822/67‑1 (MQ=255)                 aaaTAGTAAACCCACAGACTTGCTCCCGTTAGCAGGACAAAAACGGTAATTCCATTAAATCCgcgtg  <  1:740203/67‑1 (MQ=255)                 aaaTAGTAAACCCACAGACTTGCTCCCGTTAGCAGGACAAAAACGGTAATTCCATTAAATCCgcgtg  <  1:761422/67‑1 (MQ=255)                 aaaTAGTAAACCCACAGACTTGCTCCCGTTAGCAGGACAAAAACGGTAATTCCATTAAATCCgcgtg  <  1:770729/67‑1 (MQ=255)                 aaaTAGTAAACCCACAGACTTGCTCCCGTTAGCAGGACAAAAACGGTAATTCCATTAAATCCgcgtg  <  1:801863/67‑1 (MQ=255)                 aaaTAGTAAACCCACAGACTTGCTCCCGTTAGCAGGACAAAAACGGTAATTCCATTAAATCCgcgtg  <  1:811050/67‑1 (MQ=255)                 aaaTAGTAAACCCACAGACTTGCTCCCGTTAGCAGGACAAAAACGGTAATTCCATTAAATCCgcgtg  <  1:850753/67‑1 (MQ=255)                 aaaTAGTAAACCCACAGACTTGCTCCCGTTAGCAGGACAAAAACGGTAATTCCATTAAATCCgcgtg  <  1:947548/67‑1 (MQ=255)                 aaaTAGTAAACCCACAGACTTGCTCCCGTTAGCAGGACAAAAACGGTAATTCCATTAAATCCgcgtg  <  1:985067/67‑1 (MQ=255)                 aaaTAGTAAACCCACAGACTTGCTCCCGTTAGCAGGACAAAAACGGTAATTCCATTAAATCCgcgtg  <  1:1543236/67‑1 (MQ=255)                 aaaTAGTAAACCCACAGACTTGCTCCCGTTAGCAGGACAAAAACGGTAATTCCATTAAATCCgcgtg  <  1:1027187/67‑1 (MQ=255)                 aaaTAGTAAACCCACAGACTTGCTCCCGTTAGCAGGACAAAAACGGTAATTCCATTAAATCCgcgtg  <  1:1091976/67‑1 (MQ=255)                 aaaTAGTAAACCCACAGACTTGCTCCCGTTAGCAGGACAAAAACGGTAATTCCATTAAATCCgcgtg  <  1:1134891/67‑1 (MQ=255)                 aaaTAGTAAACCCACAGACTTGCTCCCGTTAGCAGGACAAAAACGGTAATTCCATTAAATCCgcgtg  <  1:1192667/67‑1 (MQ=255)                 aaaTAGTAAACCCACAGACTTGCTCCCGTTAGCAGGACAAAAACGGTAATTCCATTAAATCCgcgtg  <  1:1249337/67‑1 (MQ=255)                 aaaTAGTAAACCCACAGACTTGCTCCCGTTAGCAGGACAAAAACGGTAATTCCATTAAATCCgcgtg  <  1:1397773/67‑1 (MQ=255)                 aaaTAGTAAACCCACAGACTTGCTCCCGTTAGCAGGACAAAAACGGTAATTCCATTAAATCCgcgtg  <  1:1423265/67‑1 (MQ=255)                 aaaTAGTAAACCCACAGACTTGCTCCCGTTAGCAGGACAAAAACGGTAATTCCATTAAATCCgcgtg  <  1:1500712/67‑1 (MQ=255)                 aaaTAGTAAACCCACAGACTTGCTCCCGTTAGCAGGACAAAAACGGTAATTCCATTAAATCCgcgtg  <  1:150535/67‑1 (MQ=255)                 aaaTAGTAAACCCACAGACTTGCTCCCGTTAGCAGGACAAAAACGGTAATTCCATTAAATCCgcgtg  <  1:225000/67‑1 (MQ=255)                 aaaTAGTAAACCCACAGACTTGCTCCCGTTAGCAGGACAAAAACGGTAATTCCATTAAATCCgcgtg  <  1:1657021/67‑1 (MQ=255)                 aaaTAGTAAACCCACAGACTTGCTCCCGTTAGCAGGACAAAAACGGTAATTCCATTAAATCCgcgtg  <  1:1780519/67‑1 (MQ=255)                 aaaTAGTAAACCCACAGACTTGCTCCCGTTAGCAGGACAAAAACGGTAATTCCATTAAATCCgcgtg  <  1:1797182/67‑1 (MQ=255)                 aaaTAGTAAACCCACAGACTTGCTCCCGTTAGCAGGACAAAAACGGTAATTCCATTAAATCCgcgtg  <  1:1811668/67‑1 (MQ=255)                 aaaTAGTAAACCCACAGACTTGCTCCCGTTAGCAGGACAAAAACGGTAATTCCATTAAATCCgcgtg  <  1:1879696/67‑1 (MQ=255)                 aaaTAGTAAACCCACAGACTTGCTCCCGTTAGCAGGACAAAAACGGTAATTCCATTAAATCCgcgtg  <  1:1925340/67‑1 (MQ=255)                 aaaTAGTAAACCCACAGACTTGCTCCCGTTAGCAGGACAAAAACGGTAATTCCATTAAATCCgcgtg  <  1:1959545/67‑1 (MQ=255)                 aaaTAGTAAACCCACAGACTTGCTCCCGTTAGCAGGACAAAAACGGTAATTCCATTAAATCCgcgtg  <  1:1026160/67‑1 (MQ=255)                 |                                                                   TGGTTGTGGCGTAAGAAAATAGTAAACCCACAGACTTGCTCCCGTTAGCAGGACAAAAACGGTAATTCCATTAAATCCGCGTG  >  minE/931652‑931734

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑