Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	minE	1011321	1011330	10	23 [0]	[0] 25	rstB	sensory histidine kinase in two‑component regulatory system with RstA

TCAACTTGAAGCTTTAATTGAAGAGCTGCTGACTTATGCCCGACTCGATCGCCCACAAAACGAGCTT  >  minE/1011331‑1011397 |                                                                   tCAACTTGAAGCTTTAATTGAAGAGCTGCTGACTTATGCCCGCCTCGATCGCCCACAAAACGAGCtt  >  1:947978/1‑67 (MQ=255) tCAACTTGAAGCTTTAATTGAAGAGCTGCTGACTTATGCCCGAc                         >  1:272680/1‑44 (MQ=255) tCAACTTGAAGCTTTAATTGAAGAGCTGCTGACTTATGCCCGACTCg                      >  1:770140/1‑47 (MQ=255) tCAACTTGAAGCTTTAATTGAAGAGCTGCTGACTTATGCCCGACTCGATCGCCCACaa           >  1:1616446/1‑58 (MQ=255) tCAACTTGAAGCTTTAATTGAAGAGCTGCTGACTTATGCCCGACTCGATCGCCCACAAAACGCGCtt  >  1:509791/1‑67 (MQ=255) tCAACTTGAAGCTTTAATTGAAGAGCTGCTGACTTATGCCCGACTCGATCGCCCACAAAACGCGCtt  >  1:1939606/1‑67 (MQ=255) tCAACTTGAAGCTTTAATTGAAGAGCTGCTGACTTATGCCCGACTCGATCGCCCACAAAACGAGCtt  >  1:1135211/1‑67 (MQ=255) tCAACTTGAAGCTTTAATTGAAGAGCTGCTGACTTATGCCCGACTCGATCGCCCACAAAACGAGCtt  >  1:877695/1‑67 (MQ=255) tCAACTTGAAGCTTTAATTGAAGAGCTGCTGACTTATGCCCGACTCGATCGCCCACAAAACGAGCtt  >  1:812486/1‑67 (MQ=255) tCAACTTGAAGCTTTAATTGAAGAGCTGCTGACTTATGCCCGACTCGATCGCCCACAAAACGAGCtt  >  1:809641/1‑67 (MQ=255) tCAACTTGAAGCTTTAATTGAAGAGCTGCTGACTTATGCCCGACTCGATCGCCCACAAAACGAGCtt  >  1:634896/1‑67 (MQ=255) tCAACTTGAAGCTTTAATTGAAGAGCTGCTGACTTATGCCCGACTCGATCGCCCACAAAACGAGCtt  >  1:329201/1‑67 (MQ=255) tCAACTTGAAGCTTTAATTGAAGAGCTGCTGACTTATGCCCGACTCGATCGCCCACAAAACGAGCtt  >  1:2066297/1‑67 (MQ=255) tCAACTTGAAGCTTTAATTGAAGAGCTGCTGACTTATGCCCGACTCGATCGCCCACAAAACGAGCtt  >  1:2057521/1‑67 (MQ=255) tCAACTTGAAGCTTTAATTGAAGAGCTGCTGACTTATGCCCGACTCGATCGCCCACAAAACGAGCtt  >  1:1990322/1‑67 (MQ=255) tCAACTTGAAGCTTTAATTGAAGAGCTGCTGACTTATGCCCGACTCGATCGCCCACAAAACGAGCtt  >  1:1965368/1‑67 (MQ=255) tCAACTTGAAGCTTTAATTGAAGAGCTGCTGACTTATGCCCGACTCGATCGCCCACAAAACGAGCtt  >  1:1905978/1‑67 (MQ=255) tCAACTTGAAGCTTTAATTGAAGAGCTGCTGACTTATGCCCGACTCGATCGCCCACAAAACGAGCtt  >  1:1868214/1‑67 (MQ=255) tCAACTTGAAGCTTTAATTGAAGAGCTGCTGACTTATGCCCGACTCGATCGCCCACAAAACGAGCtt  >  1:1865169/1‑67 (MQ=255) tCAACTTGAAGCTTTAATTGAAGAGCTGCTGACTTATGCCCGACTCGATCGCCCACAAAACGAGCtt  >  1:1742738/1‑67 (MQ=255) tCAACTTGAAGCTTTAATTGAAGAGCTGCTGACTTATGCCCGACTCGATCGCCCACAAAACGAGCtt  >  1:1511312/1‑67 (MQ=255) tCAACTTGAAGCTTTAATTGAAGAGCTGCTGACTTATGCCCGACTCGATCGCCCACAAAACGAGCtt  >  1:1195573/1‑67 (MQ=255) tCAACTTGAAGCTTTAATTGAAGAGCTGCTGACTTATGCCCGACTCGATCGCCCACAAAACGAGCtt  >  1:1145486/1‑67 (MQ=255) tCAACTTGAAGCTTTAATTGAAGAGCTGCTGACTTATGCCCGACTCGATCGCCCACAAAACGAGCtt  >  1:1100119/1‑67 (MQ=255) tCAACTTGAAGCTTTAATTGAAGAGCTGCTGACTTATGCCCGACTCGATCGCCCACAAAACGAGCt   >  1:991875/1‑66 (MQ=255) |                                                                   TCAACTTGAAGCTTTAATTGAAGAGCTGCTGACTTATGCCCGACTCGATCGCCCACAAAACGAGCTT  >  minE/1011331‑1011397

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑